L’avènement récent d’outils associés au travail génétique, tels que la méthode Peturb-seq, qui associent l’analyse de criblages CRISPR en pools au séquençage d’ARN unicellulaire a fourni des informations imcomparables sur la fonction génétique chez les mammifères et sur les réseaux de régulation génétique. La mise en œuvre de ces outils est cependant confrontée à des limitations techniques et pratiques qui en restreignent l’utilisation. Pour surmonter ces difficultés, des chercheurs de l’Université de Californie à San Francisco et de l’Université de Princeton, en collaboration avec la société 10x Genomics, ont développé une technologie Peturb-seq à « capture directe » qui permet des investigations à débit nettement supérieur sur les interactions génétiques. En outre, grâce à l’ajout d’une méthodologie d’enrichissement ciblé basé sur hybridation, il est désormais possible d’obtenir un séquençage sensible et spécifique de panels de transcriptions biologiquement significatifs, ce qui réduit notablement le coût des expériences. In this webinar you will… Learn how Perturb-seq, which combines pooled CRISPR screens with single-cell RNA-sequencing, facilitates unbiased exploration of gene function and delineation of genetic regulatory networks. Informez-vous sur l’innovation récente de la capture directe de la méthode Perturb-seq qui augmente notablement le débit du criblage et qui étend fortement l’échelle et la flexibilité de cette technologie. Découvrez comment le fait de cibler des gènes individuels à l’aide de plusieurs sgARN par cellule améliore l’efficacité de l’interférence et de l’activation CRISPR, ce qui facilite l’utilisation de banques de CRISPR compactes et hautement actives pour les criblages unicellulaires. Découvrez comment l’enrichissement ciblé basé sur hybridation peut permettre une réduction des coûts de séquençage des transcriptions d’intérêt pouvant atteindre 90 %. Découvrez l’aide apportée par l’évolutivité et l’exactitude des pool d’oligonucléotides CRISPR et des solutions d’enrichissement de cibles pour NGS de Twist au développement et à la mise en application de cette technologie révolutionnaire.

Dans l’ère post-génome, des études de recherche de cibles à grande échelle, centrées sur les gènes, qui utilisent des outils tels que l’ARNi et la méthode CRISPR se sont multipliées et ont fourni de nombreuses informations sur la biologie des maladies. Il reste cependant des difficultés à surmonter, car ces outils ont souvent du mal à interroger les subtils processus biologiques qui régissent la réponse clinique. Il existe heureusement de nouveaux outils de criblage capables de trouver les cibles, mais aussi de mettre en lumière les mécanismes qui modulent des interactions moléculaires complexes. One such tool is SITESEEKER®, developed by the scientists at PhoreMost.  In this webinar you will: Découvrez comment SITESEEKER® exploite l’interférence protéinique (PROTEINi) pour offrir une complexité de beaucoup supérieure à celle des outils de criblage existants. Voyez comment raccourcir le processus allant de l’identification de cibles au développement d’un médicament à l’aide de PROTEINi, en recourant à la recherche de poches accessibles à des médicaments en plus des cibles. Découvrez l’application qui peut être faite de cette technologie dans le domaine des maladies rénales (notamment en ce qui concerne la biologie du cancer et la neurodégénérescence) et pour détourner la dégradation de la protéine ciblée. Apprenez pourquoi la longueur et la fidélité des Twist Oligo Pools permet à PhoreMost de développer la prochaine génération de sa plateforme.

Le criblage génétique fonctionnel utilisant le système CRISPR/Cas9 est un puissant outil d’interrogation de la fonction génétique à l’échelle voulue, mais l’accès à cette technologie et sa mise en application sont limitées par les banques de sgARN CRISPR prédéfinies déjà existantes. Dans le cas présent, un seul Twist Oligo Pool a été utilisé en association avec le clonage multiplex de banque personnalisée (CLUE ; crispr-clue.de), un processus de bio-informatique et de laboratoire humide facile à utiliser, pour produire de nombreuses banques de sgARn personnalisées de haute qualité. La fidélité exceptionnelle des Twist Oligo Pools préserve la représentation uniforme des sgARN dans les banques CLUE résultantes sans contamination croisée entre banques, ce qui répond aux exigences strictes de réussite dans les applications de criblage CRISPR.