Les progrès réalisés dans le NGS contribuent à réduire les coûts de séquençage en augmentant le nombre de données générées par cycle. Grâce à cette économie, il est possible de réaliser des expériences génomiques au niveau de la population afin d’étudier et de diagnostiquer les maladies génétiques. Malgré les progrès des séquenceurs, la préparation efficace des banques NGS est entravée par le coût et les efforts nécessaires pour traiter les différents échantillons. Les banques doivent être quantifiées et regroupées pour répartir équitablement les lectures de séquençage, ce qui devient excessivement fastidieux, coûteux et long à mesure que le nombre d’échantillons augmente. Nous vous présentons une technologie rationalisée de préparation de banques NGS qui supprime tout besoin de normalisation de la manipulation échantillon par échantillon et qui regroupe les échantillons dès le début du processus, ce qui simplifie grandement le flux de travail et multiplie par 48 le débit de traitement des échantillons après ligature sans compromettre la qualité des données. Ce flux de travail à haut débit repose sur la fragmentation enzymatique des échantillons qui sont convertis en banques séquençables à l’aide d’adaptateurs de normalisation originaux dotés de codes-barres en ligne. La normalisation de la banque se fait à partir des adaptateurs pendant l’étape de ligature, ce qui permet d’obtenir une conversion de la banque indépendante de la masse d’ADN introduite (20-200 ng, CV < 20 %), à l’instar du regroupement basé sur la qPCR. Jusqu’à 48 codes-barres en ligne sont inclus sur les adaptateurs qui se ligaturent uniformément aux échantillons pour un démultiplexage simple. La conception des codes-barres en ligne permet un regroupement modulaire pouvant aller jusqu’à 48 échantillons. Grâce aux adaptateurs de normalisation et aux codes-barres en ligne, le regroupement d’échantillons est effectué immédiatement après la ligature de l’adaptateur, ce qui réduit considérablement le nombre de nettoyages et de réactions PCR. Ce format peut également prendre en charge jusqu’à des dizaines de milliers de banques en un seul cycle de séquençage en utilisant des amorces de séquençage à double index unique après la ligature. Finally, multiplexed PCR amplification artifacts can be reduced using this workflow. La conversion des banques est cohérente et bien adaptée au séquençage à faible couverture du génome entier (WGS) et au séquençage ciblé pour l’appel de variants (couverture > 20x). Ce nouveau processus de préparation de banque utilise une technologie novatrice qui permet de réduire le temps de manipulation et d’augmenter l’efficacité. Un processus qui traitait auparavant chaque échantillon individuellement peut désormais être regroupé tout en garantissant une conversion égale, indépendamment de l’entrée de masse d’ADN. Ce flux de travail améliore considérablement le processus expérimental de préparation de banque et vient compléter les progrès réalisés en matière de capacité de production dans l’instrumentation de séquençage.

Fiche de données de sécurité pour 107619 et 107620