コドン最適化

We have moved beyond simple codon frequency tables. Our new algorithm prioritizes biological expression by focusing on:

• mRNA Stability
• Secondary Structure
• Ribosome Processivity

We have decoupled manufacturability parameters from the core optimization to focus primarily on protein expression. However, if the algorithm cannot find a manufacturable solution, it will automatically attempt to fix localized regions of extreme complexity. We do this while minimizing any impact on the expression profile.

Important: While we optimize for the best possible DNA composition, please remember that protein expression is multifactorial; DNA sequence is just one of many variables influencing your final yield.

現在のところ「Impossible」と判定された遺伝子の合成はできません。当社のアルゴリズムが遺伝子を「Impossible」と判定する要因はいくつかあり、遺伝子配列ごとに特定のパラメータが用いられています。当社のアルゴリズムは、機械学習を用いて開発された独自のものです。機械学習に加えて、当社のアルゴリズムは以下の要素も考慮します。

• GC 含量（25 ～ 65%）
• 最大ホモポリマー長（< 10 塩基対）
• 低い相同性

上記を組み合わせた結果として、特定の遺伝子配列が「Impossible」と判定されます。

Twist supports over 150 organisms, including most frequently used organisms such as E. coli, human, CHO, mouse and yeast.