Twist キットを使って、全ゲノムシーケンス用のライブラリを作製できますか?

はい。Twist Library Prepキットは、全ゲノムシーケンス(WGS)用のライブラリの作成に適しています。

ほとんどのWGSアプリケーションでは、より長いリード(WGSでは2x151、全エクソームシーケンスでは2x101または2x76)を使用するため、より長い断片長に対応するために断片化条件を変更する必要があります。

酵素による断片化キットの場合、断片の長さは、時間、温度、DNAインプットの3つの要素に依存します。

物理的断片化の場合、断片がより長くなるように条件(時間、power、duty factor、バーストあたりのサイクル数)を設定する必要があります。

 


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist のラインナップには、物理的断片化を利用したライブラリ調製キットはありますか?

はい。 Twist は酵素による断片化を利用したキット以外にも、物理的断片化を利用した以下のライブラリ調製キットを提供しています。

100875: Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 16 Samples (includes enzymes and buffers)

101280:Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 16 Samples(内容物:酵素、バッファー、精製ビーズ)

100876: Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes and buffers)

101281: Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes, buffers, and purification beads)

なお、ライブラリ調製には以下のようなアダプターも必要です。

101307: Twist Universal Adapter System, 16 Samples

101308:Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate A

101309: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate B

101310: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate C

101311: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate D


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

ライゲーションの際のアダプターと DNA 断片の比率を教えてください。

50 ng の DNA をインプットとして用いた場合、アダプターと DNA の比率は約 200 : 1 です。


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

エンリッチメント(濃縮)キットに含まれている製品を個別に購入することはできますか?

はい。 Twist では最大限柔軟に対応させていただいており、 NGS キットに含まれる製品を個別に販売しています。購入可能な全製品のリストは、お客様の Twist アカウントにログインすることでもご確認いただけます。以下の製品をご購入可能です。

ライブラリ調製用 

  • PN 100253 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 16 SAMPLES    
  • PN 100875 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 16 SAMPLES   
  • PN 100401 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 16 SAMPLES                     
  • PN 100572 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 96 SAMPLES    
  • PN 100876 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 96 SAMPLES   
  • PN 100573 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 96 SAMPLES                     

コンビナトリアルアダプター    

  • PN 100255 – 16 SAMPLES 

ユニークデュアルインデックス付きアダプター     

  • PN 101307 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 16 SAMPLES    
  • PN 101308 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE A           
  • PN 101309 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE B
  • PN 101310 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE C
  • PN 101311 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE D

ブロッカー     

  • PN 100856 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 2 REACTIONS   
  • PN 100578 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 12 REACTIONS 
  • PN 100767 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 96 REACTIONS             

ハイブリダイゼーション用試薬*         

  • PN 101263 – HYBRIDIZATION REAGENTS, 2 REACTIONS      
  • PN 100930 – HYBRIDIZATION REAGENTS, 12 REACTIONS    
  • PN 100982 – HYBRIDIZATION REAGENTS, 96 REACTIONS    

高速ハイブリダイゼーション用試薬*  

  • PN 101260 – FAST HYBRIDIZATION REAGENTS, 2 REACTIONS         
  • PN 100964 – FAST HYBRIDIZATION REAGENTS, 12 REACTIONS       
  • PN 100968 – FAST HYBRIDIZATION REAGENTS, 96 REACTIONS       

洗浄バッファー* 

  • PN 101264 – WASH BUFFERS, 2 REACTIONS 
  • PN 100985 – WASH BUFFERS, 12 REACTIONS          
  • PN 100846 – WASH BUFFERS, 96 REACTIONS          

高速洗浄バッファー* 

  • PN 101261 – FAST WASH BUFFERS, 2 REACTIONS    
  • PN 100971 – FAST WASH BUFFERS, 12 REACTIONS  
  • PN 100972 – FAST WASH BUFFERS, 96 REACTIONS  

精製・結合用ビーズ          

  • PN 101262 – PURIFICATION AND STREPTAVIDIN BEADS, 2 REACTIONS      
  • PN 100983 – PURIFICATION AND STREPTAVIDIN BEADS, 12 REACTIONS    
  • PN 100984 – PURIFICATION AND STREPTAVIDIN BEADS, 96 REACTIONS   

 

*注:ハイブリダイゼーション用試薬は洗浄バッファーと一緒に使用し、高速ハイブリダイゼーション用試薬は高速洗浄バッファーと一緒に使用してください。ハイブリダイゼーション用試薬と高速洗浄バッファーを一緒に使うと(またはその逆も)、パフォーマンス低下につながります。

 


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist アダプターは、酵素的および物理的方法による断片化に対応していますか?

はい、 Twist アダプターは、酵素的断片化または物理的断片化により調製された DNA 断片に対応しています。


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist のラインナップには酵素による断片化を利用したライブラリ調製キットはありますか?

はい。 Twist は物理的断片化を利用したキット以外にも、酵素による断片化を利用した以下のライブラリ調製キットを提供しています。

100253: Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 16 Samples (includes enzymes and buffers)

101059:Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 16 Samples(内容物:酵素、バッファー、精製ビーズ)

100572: Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes and buffers)

101058: Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes, buffers, and purification beads)

なお、ライブラリ調製には以下のようなアダプターも必要です。

101307: Twist Universal Adapter System, 16 Samples

101308:Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate A

101309: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate B

101310: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate C

101311: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate D


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist が提供している、 NGS ライブラリ調製とエンリッチメントに関するキットについて教えてください。

Twistでは、酵素による断片化と物理的断片化の両方に対応した完全な*キットを提供しています - これらのキットにはエンリッチメントパネルは含まれていません。

酵素による断片化            

  • PN 101897 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 REACTIONS          
  • PN 101896 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 REACTIONS     
  • PN 101901 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 96x12 REACTIONS       
  • PN 101900 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 REACTIONS    

物理的断片化        

  • PN 101899 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 REACTIONS       
  • PN 101898 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 REACTIONS    
  • PN 101903 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 96x12 REACTIONS     
  • PN 101902 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 REACTIONS

*注:ライブラリの作成と増幅には、KAPA® HiFi HotStart ReadyMix(Kapa Biosystems®, #KK2601)またはその同等品を購入する必要がありました。新製品のEF2.0キットにはEqunox Library Amp Mixが含まれていますので、購入の必要はありません。

 


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist 以外のライブラリ調製法を用いる場合の DNA インサートの推奨サイズを教えてください。

推奨される平均的なターゲット断片長は 200 bp です。この場合、平均的なライブラリサイズは約 350 bp となりますが、シーケンスリードの長さに応じてインサートのサイズを調整する必要があります。


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist キットを使って、全ゲノムシーケンス用のライブラリを作製できますか?

はい。Twist Library Prepキットは、全ゲノムシーケンス(WGS)用のライブラリの作成に適しています。

ほとんどのWGSアプリケーションでは、より長いリード(WGSでは2x151、全エクソームシーケンスでは2x101または2x76)を使用するため、より長い断片長に対応するために断片化条件を変更する必要があります。

酵素による断片化キットの場合、断片の長さは、時間、温度、DNAインプットの3つの要素に依存します。

物理的断片化の場合、断片がより長くなるように条件(時間、power、duty factor、バーストあたりのサイクル数)を設定する必要があります。

 


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist のラインナップには、物理的断片化を利用したライブラリ調製キットはありますか?

はい。 Twist は酵素による断片化を利用したキット以外にも、物理的断片化を利用した以下のライブラリ調製キットを提供しています。

100875: Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 16 Samples (includes enzymes and buffers)

101280:Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 16 Samples(内容物:酵素、バッファー、精製ビーズ)

100876: Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes and buffers)

101281: Twist Library Preparation Kit, Mechanical Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes, buffers, and purification beads)

なお、ライブラリ調製には以下のようなアダプターも必要です。

101307: Twist Universal Adapter System, 16 Samples

101308:Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate A

101309: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate B

101310: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate C

101311: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate D


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

ライゲーションの際のアダプターと DNA 断片の比率を教えてください。

50 ng の DNA をインプットとして用いた場合、アダプターと DNA の比率は約 200 : 1 です。


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

エンリッチメント(濃縮)キットに含まれている製品を個別に購入することはできますか?

はい。 Twist では最大限柔軟に対応させていただいており、 NGS キットに含まれる製品を個別に販売しています。購入可能な全製品のリストは、お客様の Twist アカウントにログインすることでもご確認いただけます。以下の製品をご購入可能です。

ライブラリ調製用 

  • PN 100253 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 16 SAMPLES    
  • PN 100875 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 16 SAMPLES   
  • PN 100401 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 16 SAMPLES                     
  • PN 100572 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 96 SAMPLES    
  • PN 100876 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 96 SAMPLES   
  • PN 100573 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 96 SAMPLES                     

コンビナトリアルアダプター    

  • PN 100255 – 16 SAMPLES 

ユニークデュアルインデックス付きアダプター     

  • PN 101307 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 16 SAMPLES    
  • PN 101308 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE A           
  • PN 101309 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE B
  • PN 101310 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE C
  • PN 101311 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 SAMPLES – PLATE D

ブロッカー     

  • PN 100856 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 2 REACTIONS   
  • PN 100578 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 12 REACTIONS 
  • PN 100767 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 96 REACTIONS             

ハイブリダイゼーション用試薬*         

  • PN 101263 – HYBRIDIZATION REAGENTS, 2 REACTIONS      
  • PN 100930 – HYBRIDIZATION REAGENTS, 12 REACTIONS    
  • PN 100982 – HYBRIDIZATION REAGENTS, 96 REACTIONS    

高速ハイブリダイゼーション用試薬*  

  • PN 101260 – FAST HYBRIDIZATION REAGENTS, 2 REACTIONS         
  • PN 100964 – FAST HYBRIDIZATION REAGENTS, 12 REACTIONS       
  • PN 100968 – FAST HYBRIDIZATION REAGENTS, 96 REACTIONS       

洗浄バッファー* 

  • PN 101264 – WASH BUFFERS, 2 REACTIONS 
  • PN 100985 – WASH BUFFERS, 12 REACTIONS          
  • PN 100846 – WASH BUFFERS, 96 REACTIONS          

高速洗浄バッファー* 

  • PN 101261 – FAST WASH BUFFERS, 2 REACTIONS    
  • PN 100971 – FAST WASH BUFFERS, 12 REACTIONS  
  • PN 100972 – FAST WASH BUFFERS, 96 REACTIONS  

精製・結合用ビーズ          

  • PN 101262 – PURIFICATION AND STREPTAVIDIN BEADS, 2 REACTIONS      
  • PN 100983 – PURIFICATION AND STREPTAVIDIN BEADS, 12 REACTIONS    
  • PN 100984 – PURIFICATION AND STREPTAVIDIN BEADS, 96 REACTIONS   

 

*注:ハイブリダイゼーション用試薬は洗浄バッファーと一緒に使用し、高速ハイブリダイゼーション用試薬は高速洗浄バッファーと一緒に使用してください。ハイブリダイゼーション用試薬と高速洗浄バッファーを一緒に使うと(またはその逆も)、パフォーマンス低下につながります。

 


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist アダプターは、酵素的および物理的方法による断片化に対応していますか?

はい、 Twist アダプターは、酵素的断片化または物理的断片化により調製された DNA 断片に対応しています。


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist のラインナップには酵素による断片化を利用したライブラリ調製キットはありますか?

はい。 Twist は物理的断片化を利用したキット以外にも、酵素による断片化を利用した以下のライブラリ調製キットを提供しています。

100253: Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 16 Samples (includes enzymes and buffers)

101059:Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 16 Samples(内容物:酵素、バッファー、精製ビーズ)

100572: Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes and buffers)

101058: Twist Library Preparation Kit, Enzymatic Fragmentation, 96 Samples (includes enzymes, buffers, and purification beads)

なお、ライブラリ調製には以下のようなアダプターも必要です。

101307: Twist Universal Adapter System, 16 Samples

101308:Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate A

101309: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate B

101310: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate C

101311: Twist Universal Adapter System, 96 Samples – Plate D


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist が提供している、 NGS ライブラリ調製とエンリッチメントに関するキットについて教えてください。

Twistでは、酵素による断片化と物理的断片化の両方に対応した完全な*キットを提供しています - これらのキットにはエンリッチメントパネルは含まれていません。

酵素による断片化            

  • PN 101897 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 REACTIONS          
  • PN 101896 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 REACTIONS     
  • PN 101901 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 96x12 REACTIONS       
  • PN 101900 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 REACTIONS    

物理的断片化        

  • PN 101899 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 REACTIONS       
  • PN 101898 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 REACTIONS    
  • PN 101903 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 96x12 REACTIONS     
  • PN 101902 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 REACTIONS

*注:ライブラリの作成と増幅には、KAPA® HiFi HotStart ReadyMix(Kapa Biosystems®, #KK2601)またはその同等品を購入する必要がありました。新製品のEF2.0キットにはEqunox Library Amp Mixが含まれていますので、購入の必要はありません。

 


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

Twist 以外のライブラリ調製法を用いる場合の DNA インサートの推奨サイズを教えてください。

推奨される平均的なターゲット断片長は 200 bp です。この場合、平均的なライブラリサイズは約 350 bp となりますが、シーケンスリードの長さに応じてインサートのサイズを調整する必要があります。


ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。

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