Twist Bioscience本社
681 Gateway Blvd
South San Francisco, CA 94080
全般
ターゲットエンリッチメントに関して、複雑性の低い領域とはどのようなものでしょうか?
現在、独自のモデルを用いて、 Illumina のシーケンスでプローブの検出が難しいかどうかを予測しています。このモデルへの入力項目には、GC 含量、全体的な複雑性(プローブ配列に含まれる異なる kmer 数として測定)、ローカルな複雑性(配列の限られた領域内にある異なる kmer 数として測定)、そしてホモポリマーの有無が含まれます。
一般的に、GC 含量が 85% を超えるプローブ、20 塩基より長いホモポリマー、30 塩基より長いジヌクレオチドまたはトリヌクレオチドのタンデムリピートは、配列決定が困難です。
ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。
Twist では RNA プローブの用意はありますか?
いいえ、 RNA プローブはご用意しておりませんが、当社の DNA プローブを用いて、 RNA から作製した cDNA ライブラリからターゲットを濃縮することが可能です。
ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。
ターゲットエンリッチメントパネルについて、プローブ鎖長を変更するオプションはありますか?
はい。ただし、詳細についてTwist担当者に一度ご相談いただくことをお勧めします。80 bp、100 bp、120 bp の鎖長のプローブでパネルを設計可能です。
ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。
Twist はヒト以外の生物種用のカスタムエンリッチメントパネルを設計できますか?
はい。詳細につきましては、カスタマーサポート(customersupport@twistbioscience)または営業担当者までお問い合わせください。
ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。
Twist のプローブは RNA ですか?それとも DNA ですか?
Twist のターゲットエンリッチメント用プローブは2本鎖 DNA で、両鎖をターゲットとするため感度が向上します。また、RNA から作製した cDNA ライブラリからターゲットを濃縮する際にもご使用いただけます。
ご不明な点がございましたら、こちらまでお問い合わせください。
ターゲットエンリッチメントに関して、複雑性の低い領域とはどのようなものでしょうか?
現在、独自のモデルを用いて、 Illumina のシーケンスでプローブの検出が難しいかどうかを予測しています。このモデルへの入力項目には、GC 含量、全体的な複雑性(プローブ配列に含まれる異なる kmer 数として測定)、ローカルな複雑性(配列の限られた領域内にある異なる kmer 数として測定)、そしてホモポリマーの有無が含まれます。
一般的に、GC 含量が 85% を超えるプローブ、20 塩基より長いホモポリマー、30 塩基より長いジヌクレオチドまたはトリヌクレオチドのタンデムリピートは、配列決定が困難です。
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Twist では RNA プローブの用意はありますか?
いいえ、 RNA プローブはご用意しておりませんが、当社の DNA プローブを用いて、 RNA から作製した cDNA ライブラリからターゲットを濃縮することが可能です。
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ターゲットエンリッチメントパネルについて、プローブ鎖長を変更するオプションはありますか?
はい。ただし、詳細についてTwist担当者に一度ご相談いただくことをお勧めします。80 bp、100 bp、120 bp の鎖長のプローブでパネルを設計可能です。
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Twist はヒト以外の生物種用のカスタムエンリッチメントパネルを設計できますか?
はい。詳細につきましては、カスタマーサポート(customersupport@twistbioscience)または営業担当者までお問い合わせください。
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Twist のプローブは RNA ですか?それとも DNA ですか?
Twist のターゲットエンリッチメント用プローブは2本鎖 DNA で、両鎖をターゲットとするため感度が向上します。また、RNA から作製した cDNA ライブラリからターゲットを濃縮する際にもご使用いただけます。
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