信頼性の高いスケーラブルなcfDNAワークフローのための遺伝子工学的パフォーマンス
高いコンバージョン率と感度を提供して希少なバリアントを検出する効率的ワークフローにより、難解析なcfDNAインプットから高品質のライブラリを生成します。Twist cfDNA Library Preparation Kitは、低インプットサンプルと断片化サンプル用に設計されており、重要な洞察を高い信頼性で効率よく導き出すことを助けます。
レアバリアントの検出感度を最大化
高コンバージョン率のため、希少バリアント（≦ 0.1% VAF）を確実に検出。Twist UMI Adapter System によりサポートされる Duplex シーケンシングワークフローに対応した高カバレッジライブラリ。
貴重なサンプルのワークフローを合理化
堅牢なパフォーマンス、低 (<1ng) サンプルインプットでも 2 時間でシーケンス対応ライブラリ。
バイアスのない増幅
5～95%のGCで一貫したカバレッジを提供し、難解析なゲノム領域とキャプチャが困難なターゲットの可視性を維持します。DNAインプットが100 pg以下であっても、複雑なライブラリから一貫した高収量が得られます。忠実度の向上とホモポリマーのスリッページを抑えることで、信頼性の高いバリアントコールを行います。
信頼性の高いスケーラブルなcfDNAワークフローのための遺伝子工学的パフォーマンス
高いコンバージョン率と感度を提供して希少なバリアントを検出する効率的ワークフローにより、難解析なcfDNAインプットから高品質のライブラリを生成します。Twist cfDNA Library Preparation Kitは、低インプットサンプルと断片化サンプル用に設計されており、重要な洞察を高い信頼性で効率よく導き出すことを助けます。
レアバリアントの検出感度を最大化
高コンバージョン率のため、希少バリアント（≦ 0.1% VAF）を確実に検出。Twist UMI Adapter System によりサポートされる Duplex シーケンシングワークフローに対応した高カバレッジライブラリ。
貴重なサンプルのワークフローを合理化
堅牢なパフォーマンス、低 (<1ng) サンプルインプットでも 2 時間でシーケンス対応ライブラリ。
バイアスのない増幅
5～95%のGCで一貫したカバレッジを提供し、難解析なゲノム領域とキャプチャが困難なターゲットの可視性を維持します。DNAインプットが100 pg以下であっても、複雑なライブラリから一貫した高収量が得られます。忠実度の向上とホモポリマーのスリッページを抑えることで、信頼性の高いバリアントコールを行います。
製品データ
図 1. TrueAmp による増幅ありとなしとで同等の塩基置換エラー率。Twist cfDNA Library Preparation Kitを使用し、Twist cfDNA Pan-Cancer Reference Standard v2をインプット材料として、ライブラリを生成しました。非PCR条件のライゲーションにはTwist Full Length Unique Dual Index（UDI）アダプターを、PCR条件のライゲーションにはTwist Universal Adapterを使用しました。Twist TrueAmp Polymerase MixおよびUDIプライマーを使用して、6サイクルでPCR条件を増幅しました。ライブラリをプールし、シーケンシングして分析しました。非PCRライブラリとTrueAmp ライブラリでは、同等のエラー率が示されています。
図 2. Twist cfDNA Library Preparation Kit は、より高い収量での cfDNA ライブラリ調製を実現します。ライブラリ調製後、サンプルを20 μLの水に溶出し、1 μLをQubit™ dsDNA Broad Range Kitで定量しました。
図 3. Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kitでは、VAF0.25%で高感度かつ正確なバリアントの検出が可能です。ライブラリは、Pan-Cancer Standardサンプルの217 SNPバリアントサイトを標的とするカスタム50 kbオンコロジーカスタムパネルを用いてシングルプレックスでキャプチャされました。未検出バリアント率は、1バリアントファミリー未満のサイトの合計を検出可能なバリアントサイトの合計で除して算出しました。
図 4. Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit は、分子バーコード（UMI）による Duplication 除去の有無にかかわらず、複雑性の高さを実現します。
図 5.Twist cfDNA Library Preparation Kit は、ネイティブ cfDNA サンプルで、より高い cfDNA ライブラリ収量を実現します。ライブラリ調製後、サンプルを20 μLの水に溶出し、1 μLをQubit™ dsDNA Broad Range Kitで定量しました。
cfDNA Library Prep Kit with TrueAmp Polymerase Mix Workflow
このcfDNAワークフローは、遺伝子工学によるGCバランスと高忠実度の増幅を活用します。この設計は、低頻度バリアントの検出を損なう可能性のあるPCRによるエラーを最小限に抑えながら、高い増幅収量を提供します。
その結果、2時間という高速のワークフローで、均一で高品質のライブラリが得られます。アプタマーベースのホットスタート制御は自動化セットアップに必要な室温の安定性を提供し、シングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスはWGSとターゲットエンリッチメントの両方のワークフローを合理化します。
製品データ
図 1. TrueAmp による増幅ありとなしとで同等の塩基置換エラー率。Twist cfDNA Library Preparation Kitを使用し、Twist cfDNA Pan-Cancer Reference Standard v2をインプット材料として、ライブラリを生成しました。非PCR条件のライゲーションにはTwist Full Length Unique Dual Index（UDI）アダプターを、PCR条件のライゲーションにはTwist Universal Adapterを使用しました。Twist TrueAmp Polymerase MixおよびUDIプライマーを使用して、6サイクルでPCR条件を増幅しました。ライブラリをプールし、シーケンシングして分析しました。非PCRライブラリとTrueAmp ライブラリでは、同等のエラー率が示されています。
図 2. Twist cfDNA Library Preparation Kit は、より高い収量での cfDNA ライブラリ調製を実現します。ライブラリ調製後、サンプルを20 μLの水に溶出し、1 μLをQubit™ dsDNA Broad Range Kitで定量しました。
図 3. Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kitでは、VAF0.25%で高感度かつ正確なバリアントの検出が可能です。ライブラリは、Pan-Cancer Standardサンプルの217 SNPバリアントサイトを標的とするカスタム50 kbオンコロジーカスタムパネルを用いてシングルプレックスでキャプチャされました。未検出バリアント率は、1バリアントファミリー未満のサイトの合計を検出可能なバリアントサイトの合計で除して算出しました。
図 4. Twist cfDNA Library Preparation and Hyb Mix Kit は、分子バーコード（UMI）による Duplication 除去の有無にかかわらず、複雑性の高さを実現します。
図 5.Twist cfDNA Library Preparation Kit は、ネイティブ cfDNA サンプルで、より高い cfDNA ライブラリ収量を実現します。ライブラリ調製後、サンプルを20 μLの水に溶出し、1 μLをQubit™ dsDNA Broad Range Kitで定量しました。
cfDNA Library Prep Kit with TrueAmp Polymerase Mix Workflow
このcfDNAワークフローは、遺伝子工学によるGCバランスと高忠実度の増幅を活用します。この設計は、低頻度バリアントの検出を損なう可能性のあるPCRによるエラーを最小限に抑えながら、高い増幅収量を提供します。
その結果、2時間という高速のワークフローで、均一で高品質のライブラリが得られます。アプタマーベースのホットスタート制御は自動化セットアップに必要な室温の安定性を提供し、シングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスはWGSとターゲットエンリッチメントの両方のワークフローを合理化します。
注目すべきリソース
製品シート
プロトコル
テクニカルノート
注目すべきリソース
関連ワークフローとアプリケーション
Twistのターゲットエンリッチメントワークフローは、大規模で複雑なゲノム領域にわたってスケーラブルで低バイアス、高度に均一なカバレッジを提供し、アンプリコンまたはアレイベースによる解析に比べてより広い検出範囲、高感度、高い柔軟性を可能にします。
Twist はリキッドバイオプシーやがんの早期特性評価に関する研究を支えるさまざまなツールを提供しています。
関連ワークフローとアプリケーション
Twistのターゲットエンリッチメントワークフローは、大規模で複雑なゲノム領域にわたってスケーラブルで低バイアス、高度に均一なカバレッジを提供し、アンプリコンまたはアレイベースによる解析に比べてより広い検出範囲、高感度、高い柔軟性を可能にします。
Twist はリキッドバイオプシーやがんの早期特性評価に関する研究を支えるさまざまなツールを提供しています。
