より多くの可能性を提供均一なカバレッジ、高収量、および確実なバリアント特性。
Twist TrueAmp ライブラリ調製は、特に難解析な低インプットサンプルに対するNGS ターゲットエンリッチメントワークフローで実力を発揮する、ばらつきのない高品質なライブラリを提供します。Twist の TrueAmp ポリメラーゼを活用し、酵素による断片化に対して最適化されたこのワークフローは、高い変換効率、低い GC バイアス、バランスの取れたカバレッジを提供し、難解析なゲノム領域全体において正確なバリアント特性評価をサポートします。
難解析なゲノム領域における信頼性の高い均一性
カバレッジの一貫性が向上すると、AT および GC 関連のドロップアウトが減少し、難解析領域の表現も改善されます。
低インプットおよび劣化サンプルからの高変換効率
低インプット、FFPE、および様々な品質のサンプルに対する高いライブラリ収量により、再測定の必要性が減り、貴重なサンプルを節約できます。
高忠実度の増幅によりバリアント検出の信頼性を高める
Twist TrueAmp ポリメラーゼは、増幅によるエラーとバイアスを最小限に抑え、低 VAF バリアントの正確な検出をサポートします。
より多くの可能性を提供均一なカバレッジ、高収量、および確実なバリアント特性。
Twist TrueAmp ライブラリ調製は、特に難解析な低インプットサンプルに対するNGS ターゲットエンリッチメントワークフローで実力を発揮する、ばらつきのない高品質なライブラリを提供します。Twist の TrueAmp ポリメラーゼを活用し、酵素による断片化に対して最適化されたこのワークフローは、高い変換効率、低い GC バイアス、バランスの取れたカバレッジを提供し、難解析なゲノム領域全体において正確なバリアント特性評価をサポートします。
難解析なゲノム領域における信頼性の高い均一性
カバレッジの一貫性が向上すると、AT および GC 関連のドロップアウトが減少し、難解析領域の表現も改善されます。
低インプットおよび劣化サンプルからの高変換効率
低インプット、FFPE、および様々な品質のサンプルに対する高いライブラリ収量により、再測定の必要性が減り、貴重なサンプルを節約できます。
高忠実度の増幅によりバリアント検出の信頼性を高める
Twist TrueAmp ポリメラーゼは、増幅によるエラーとバイアスを最小限に抑え、低 VAF バリアントの正確な検出をサポートします。
製品データ
図 1. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は優れた捕捉前ライブラリ収量を生み出し、それは高いライブラリ構築と増幅効率を示しています。(B) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は、他社製品と比較して、より高いライブラリの複雑性を示しています。これにより、ライブラリ内でシークエンシング可能な独自の DNA 分子が可能になり、シーケンシングコストも削減されます。(C) より高いカバレッジを実現します。
図 2. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) 優れたカバレッジ均一性を提供し、それは低いfold-80ベースペナルティの測定で表されます。(B) カバレッジのない領域が縮小しており、それはゼロカバレッジターゲット率の測定で表されます。
図 3. Twist TrueAmp ポリメラーゼのカバレッジの改善を示す正規化 GC バイアストレース。Twist TrueAmp Library Preparation Kit でライブラリを調製し、異なるポリメラーゼとサイクルで増幅しました。
上部パネル： 3サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
下部パネル： 16サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
図 4.Twist TrueAmp Library Prep Kit は、超低インプットでも信頼性の高いライブラリサイズを実現します。
500ng、100ng、50ng、10ng、および1ng（gDNA）を、32°Cで断片化しました。それぞれ、PCRの3、5、6、8、10、および14サイクルを増幅に利用しました。サンプルは重複して用いられています。
A: Twist TrueAmp Library Preparation Kit で作成された NGS ライブラリの電気泳動図。
B: さまざまな DNA インプットに対して増幅されたのライブラリの濃度。
図 5.Twist TrueAmp Library Preparation Kit のチューニング性。
A: 異なる断片化時間を使用して生成された NGS ライブラリの5つの電気泳動図。50ngの高品質 gDNA を32°Cで、さまざまな時間断片化しました。6サイクルの PCR を増幅に利用しました。
B: 挿入サイズの中央値対時間。50ngの高品質の gDNA を、32°Cでさまざまな時間断片化しました。増幅は、6サイクルの PCR を用いて実施しました。サンプルは Twist Exome 2.0 パネルを使用して捕捉しました。
製品データ
最も解析困難なサンプルに対する高収量と高カバレッジ
Twist TrueAmp Library Prepは、低インプットの劣化した FFPE DNA から、捕捉前収量を増加させ、一貫したライブラリサイズとより強力な平均ターゲットカバレッジを実現します。これらの利点により、過度の PCR サイクリングの必要性が減り、ライブラリの複雑性が保持され、難解析なサンプルからの信頼性の高いシーケンシングがより多く得られます。
図 1. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は優れた捕捉前ライブラリ収量を生み出し、それは高いライブラリ構築と増幅効率を示しています。(B) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は、他社製品と比較して、より高いライブラリの複雑性を示しています。これにより、ライブラリ内でシークエンシング可能な独自の DNA 分子が可能になり、シーケンシングコストも削減されます。(C) より高いカバレッジを実現します。
より少ないターゲットで均一なカバレッジ
Twist TrueAmp Library Prep は、カバレッジの均一性を向上させ、カバレッジのない領域を減らします。ターゲットドロップアウトが減少することにより、重要な領域が一貫してシーケンスされ、信頼性が向上します。
図 2. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) 優れたカバレッジ均一性を提供し、それは低いfold-80ベースペナルティの測定値で表されます。(B) カバレッジのない領域が縮小しており、それはゼロカバレッジターゲット率の測定で表されます。
広範囲の GC 領域に対するカバレッジを改善
Twist TrueAmp Polymerase Mix は、広範囲な GC 領域において均一なカバレッジを実現し、PCRサイクルが増えた場合でもパフォーマンスを維持します。
図 3. Twist TrueAmp ポリメラーゼのカバレッジの改善を示す正規化 GC バイアストレース。Twist TrueAmp Library Preparation Kit でライブラリを調製し、異なるポリメラーゼとサイクルで増幅しました。
上部パネル：3サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
下部パネル： 16サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
様々なインプットやワークフローに対応した設計
Twist TrueAmp Library Preparation Kitは、幅広いサンプルインプットで一貫した DNA ライブラリ断片サイズを提供し、均一なカバレッジと再現性のある結果を大規模で維持しながら、混合インプットワークフローを可能にします。
図 4. Twist TrueAmp Library Prep Kit は、超低インプットでも信頼性の高いライブラリサイズを実現します。
500ng、100ng、50ng、10ng、1ng、および0.1ng（gDNA）を、32°Cでさまざまな時間断片化しました。それぞれ、PCRの3、5、6、8、10、および14サイクルを増幅に利用しました。サンプルは重複して用いられています。
A: Twist TrueAmp Library Preparation Kit で作成された NGS ライブラリの電気泳動図。
B: さまざまな DNA インプットに対して増幅されたのライブラリの濃度。
高性能な調整のために制御された挿入サイズ
Twist TrueAmp Library Preparation Kit は、幅広いインプット量で反復可能な DNA ライブラリ断片サイズを提供し、シーケンシングとダウンストリーム解析の信頼性を高めます。
図 5.Twist TrueAmp Library Preparation Kit のチューニング性。
A: 異なる断片化時間を使用して生成された NGS ライブラリの5つの電気泳動図。50ngの高品質 gDNA を32°Cで、さまざまな時間断片化しました。6サイクルの PCR を増幅に利用しました。
B: 挿入サイズの中央値対時間。50ngの高品質の gDNA を、32°Cでさまざまな時間断片化しました。増幅は、6サイクルの PCR を用いて実施しました。サンプルは Twist Exome 2.0 パネルを使用して捕捉しました。
製品データ
図 1. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は優れた捕捉前ライブラリ収量を生み出し、それは高いライブラリ構築と増幅効率を示しています。(B) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は、他社製品と比較して、より高いライブラリの複雑性を示しています。これにより、ライブラリ内でシークエンシング可能な独自の DNA 分子が可能になり、シーケンシングコストも削減されます。(C) より高いカバレッジを実現します。
図 2. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) 優れたカバレッジ均一性を提供し、それは低いfold-80ベースペナルティの測定で表されます。(B) カバレッジのない領域が縮小しており、それはゼロカバレッジターゲット率の測定で表されます。
図 3. Twist TrueAmp ポリメラーゼのカバレッジの改善を示す正規化 GC バイアストレース。Twist TrueAmp Library Preparation Kit でライブラリを調製し、異なるポリメラーゼとサイクルで増幅しました。
上部パネル： 3サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
下部パネル： 16サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
図 4.Twist TrueAmp Library Prep Kit は、超低インプットでも信頼性の高いライブラリサイズを実現します。
500ng、100ng、50ng、10ng、および1ng（gDNA）を、32°Cで断片化しました。それぞれ、PCRの3、5、6、8、10、および14サイクルを増幅に利用しました。サンプルは重複して用いられています。
A: Twist TrueAmp Library Preparation Kit で作成された NGS ライブラリの電気泳動図。
B: さまざまな DNA インプットに対して増幅されたのライブラリの濃度。
図 5.Twist TrueAmp Library Preparation Kit のチューニング性。
A: 異なる断片化時間を使用して生成された NGS ライブラリの5つの電気泳動図。50ngの高品質 gDNA を32°Cで、さまざまな時間断片化しました。6サイクルの PCR を増幅に利用しました。
B: 挿入サイズの中央値対時間。50ngの高品質の gDNA を、32°Cでさまざまな時間断片化しました。増幅は、6サイクルの PCR を用いて実施しました。サンプルは Twist Exome 2.0 パネルを使用して捕捉しました。
製品データ
最も解析困難なサンプルに対する高収量と高カバレッジ
Twist TrueAmp Library Prepは、低インプットの劣化した FFPE DNA から、捕捉前収量を増加させ、一貫したライブラリサイズとより強力な平均ターゲットカバレッジを実現します。これらの利点により、過度の PCR サイクリングの必要性が減り、ライブラリの複雑性が保持され、難解析なサンプルからの信頼性の高いシーケンシングがより多く得られます。
図 1. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は優れた捕捉前ライブラリ収量を生み出し、それは高いライブラリ構築と増幅効率を示しています。(B) Twist TrueAmp Library Preparation Kit は、他社製品と比較して、より高いライブラリの複雑性を示しています。これにより、ライブラリ内でシークエンシング可能な独自の DNA 分子が可能になり、シーケンシングコストも削減されます。(C) より高いカバレッジを実現します。
より少ないターゲットで均一なカバレッジ
Twist TrueAmp Library Prep は、カバレッジの均一性を向上させ、カバレッジのない領域を減らします。ターゲットドロップアウトが減少することにより、重要な領域が一貫してシーケンスされ、信頼性が向上します。
図 2. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリの性能を、TrueAmp Library Preparation Kit と競合他社の製品との間で比較し、難解析なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) 優れたカバレッジ均一性を提供し、それは低いfold-80ベースペナルティの測定値で表されます。(B) カバレッジのない領域が縮小しており、それはゼロカバレッジターゲット率の測定で表されます。
広範囲の GC 領域に対するカバレッジを改善
Twist TrueAmp Polymerase Mix は、広範囲な GC 領域において均一なカバレッジを実現し、PCRサイクルが増えた場合でもパフォーマンスを維持します。
図 3. Twist TrueAmp ポリメラーゼのカバレッジの改善を示す正規化 GC バイアストレース。Twist TrueAmp Library Preparation Kit でライブラリを調製し、異なるポリメラーゼとサイクルで増幅しました。
上部パネル：3サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
下部パネル： 16サイクルのPCRでのポリメラーゼを比較しつつ、GCプロットに対して正規化されたカバレッジ。
様々なインプットやワークフローに対応した設計
Twist TrueAmp Library Preparation Kitは、幅広いサンプルインプットで一貫した DNA ライブラリ断片サイズを提供し、均一なカバレッジと再現性のある結果を大規模で維持しながら、混合インプットワークフローを可能にします。
図 4. Twist TrueAmp Library Prep Kit は、超低インプットでも信頼性の高いライブラリサイズを実現します。
500ng、100ng、50ng、10ng、1ng、および0.1ng（gDNA）を、32°Cでさまざまな時間断片化しました。それぞれ、PCRの3、5、6、8、10、および14サイクルを増幅に利用しました。サンプルは重複して用いられています。
A: Twist TrueAmp Library Preparation Kit で作成された NGS ライブラリの電気泳動図。
B: さまざまな DNA インプットに対して増幅されたのライブラリの濃度。
高性能な調整のために制御された挿入サイズ
Twist TrueAmp Library Preparation Kit は、幅広いインプット量で反復可能な DNA ライブラリ断片サイズを提供し、シーケンシングとダウンストリーム解析の信頼性を高めます。
図 5.Twist TrueAmp Library Preparation Kit のチューニング性。
A: 異なる断片化時間を使用して生成された NGS ライブラリの5つの電気泳動図。50ngの高品質 gDNA を32°Cで、さまざまな時間断片化しました。6サイクルの PCR を増幅に利用しました。
B: 挿入サイズの中央値対時間。50ngの高品質の gDNA を、32°Cでさまざまな時間断片化しました。増幅は、6サイクルの PCR を用いて実施しました。サンプルは Twist Exome 2.0 パネルを使用して捕捉しました。
注目すべきリソース
製品シート
プロトコル
注目すべきリソース
関連ワークフローとアプリケーション
Twistのターゲットエンリッチメントワークフローは、大規模で複雑なゲノム領域にわたってスケーラブルで低バイアス、高度に均一なカバレッジを提供し、アンプリコンまたはアレイベースによる解析に比べてより広い検出範囲、高感度、高い柔軟性を可能にします。
Twist はリキッドバイオプシーやがんの早期特性評価に関する研究を支えるさまざまなツールを提供しています。
関連ワークフローとアプリケーション
Twistのターゲットエンリッチメントワークフローは、大規模で複雑なゲノム領域にわたってスケーラブルで低バイアス、高度に均一なカバレッジを提供し、アンプリコンまたはアレイベースによる解析に比べてより広い検出範囲、高感度、高い柔軟性を可能にします。
Twist はリキッドバイオプシーやがんの早期特性評価に関する研究を支えるさまざまなツールを提供しています。
