Engineered for next generation sequencing (NGS) workflows
Engineered for NGS library amplification, Twist TrueAmp Polymerase delivers uniform coverage across GC extremes, high sensitivity from low inputs, and automation-ready hot start performance.
TrueAmp は、他の手法では検出が困難な領域でもカバレッジを維持し、シーケンス解析のコスト効率を向上させ、難易度の高いターゲットも確実に捕捉します。
効率の向上により、TrueAmp はより少ないサイクル数で収量の目標を達成でき、サイクルに起因するアーティファクトを低減します。キャプチャ後の PCR に典型的な低収量ライブラリでも、堅牢性を維持します。
設計された校正用ポリメラーゼにより、シトシンの脱アミノ化によって頻繁に生じる C → T という塩基の誤った組み込みが低減され、長鎖ホモポリマー上の滑りも制限されます。これらは高感度での変異検出に不可欠です。
磁気ビーズは精製およびサイズ選択に広く使用されていますが、PCR を阻害して収量を低下させることがあります。
図 1. GC で正規化したカバレッジ。AT リッチの C. difficile および GC リッチの B. pertussis(百日咳菌)。
図 2. 1 ng から 100 fg への連続希釈、Qubit および TapeStation QC。
図 3. 700 万個を超える塩基の組み込み後の置換率。Twist Clonal Genes を使用したホモポリマーの読み取り。
図 4. PCR 中の常磁性ビーズに対する耐性。PCR 反応物を、6.25 μl、12.5 μl、25 μl、50 μl の MyOne T1 ビーズ、M270 ビーズ(Invitrogen)、Twist DNA Purification Beads でスパイク。ビーズ除去後に反応物を精製し、Qubit dsDNA Broad Range Assay で定量を実施。
TrueAmp は、他の手法では検出が困難な領域でもカバレッジを維持し、シーケンス解析のコスト効率を向上させ、難易度の高いターゲットも確実に捕捉します。
図 1. GC で正規化したカバレッジ。AT リッチの C. difficile および GC リッチの B. pertussis(百日咳菌)。
効率の向上により、TrueAmp はより少ないサイクル数で収量の目標を達成でき、サイクルに起因するアーティファクトを低減します。キャプチャ後の PCR に典型的な低収量ライブラリでも、堅牢性を維持します。
図 2. 1 ng から 100 fg への連続希釈、Qubit および TapeStation QC。
設計された校正用ポリメラーゼにより、シトシンの脱アミノ化によって頻繁に生じる C → T という塩基の誤った組み込みが低減され、長鎖ホモポリマー上の滑りも制限されます。これらは高感度での変異検出に不可欠です。
図 3. 700 万個を超える塩基の組み込み後の置換率。Twist Clonal Genes を使用したホモポリマーの読み取り。
磁気ビーズは精製およびサイズ選択に広く使用されていますが、PCR を阻害して収量を低下させることがあります。
図 4. PCR 中の常磁性ビーズに対する耐性。PCR 反応物を、6.25 μl、12.5 μl、25 μl、50 μl の MyOne T1 ビーズ、M270 ビーズ(Invitrogen)、Twist DNA Purification Beads でスパイク。ビーズ除去後に反応物を精製し、Qubit dsDNA Broad Range Assay で定量を実施。
多くの PCR 酵素は、複雑な NGS ライブラリではなく、単一のアンプリコン用途(qPCR、クローニング)向けに最適化されています。
TrueAmp がアプローチを変える
遺伝子工学的に設計された校正機能付きの高処理能力 DNA ポリメラーゼにより、ライブラリ増幅において、業界トップクラスの GC 均一性、収量、および忠実度を実現します。
結果
短鎖かつ GC 含量が中間的な分子に対するバイアスが低減し、1 回の分析でより多くの有用なデータが得られます。
主な特徴
Twist Library Preparation Kit は、主な調製プロセスを単一の効率的な反応に統合することで、次世代シーケンシング(NGS)用高品質 DNA ライブラリの構築を効率化します。
Twist DNA CGP Panel は、SNV、インデル、コピー数多型、および遺伝子再構成を包括的に検出することができ、1 回のアッセイで広範な変異をカバーします。
Twist Bioscience の MRD Rapid 500 Panel は、微小残存病変(MRD)を対象としたスケーラブルなターゲットエンリッチメントソリューションであり、50 ~ 500 プローブからなるパネルを用いて広範なゲノムカバレッジを実現します。
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