Twist Multiplexed Gene Fragments とは
Twist Multiplexed Gene Fragments は、最大鎖長 500 塩基対の二本鎖遺伝子断片で、１ウェルごとに1 つの断片ではなく、プールとしてお届けします。このように断片がプールされた形式のため、プライム編集、CRISPR をベースとした極めて複雑な機能スクリーニング、ペプチドおよびタンパク質工学、抗体探索、超並列レポーターアッセイ（MPRA）などのハイスループットスクリーニングアプリケーションが可能になります。これらのアプリケーションでは、断片１つあたりのコストが、目的とするバリアント数の障害となる場合があります。
Multiplexed Gene Fragments は、ユーザー定義の塩基配列から遺伝子ごとに最大 500 塩基対の鎖長で合成されます。これらのユーザー定義の配列は、最初に最大鎖長 500 ヌクレオチドの一本鎖オリゴプールとして合成され、次に二本鎖 DNA に増幅されます。そして、プール内の 90% 以上の遺伝子が正しい鎖長であることを慎重に分析した上で、 Multiplexed Gene Fragments としてお届けします。本製品は、迅速かつハイスループットなスクリーニング用途に最適化されています。
お客様の声
Twist Multiplexed Gene Fragments とは
Twist Multiplexed Gene Fragments は、最大鎖長 500 塩基対の二本鎖遺伝子断片で、１ウェルごとに1 つの断片ではなく、プールとしてお届けします。このように断片がプールされた形式のため、プライム編集、CRISPR をベースとした極めて複雑な機能スクリーニング、ペプチドおよびタンパク質工学、抗体探索、超並列レポーターアッセイ（MPRA）などのハイスループットスクリーニングアプリケーションが可能になります。これらのアプリケーションでは、断片１つあたりのコストが、目的とするバリアント数の障害となる場合があります。
Multiplexed Gene Fragments は、ユーザー定義の塩基配列から遺伝子ごとに最大 500 塩基対の鎖長で合成されます。これらのユーザー定義の配列は、最初に最大鎖長 500 ヌクレオチドの一本鎖オリゴプールとして合成され、次に二本鎖 DNA に増幅されます。そして、プール内の 90% 以上の遺伝子が正しい鎖長であることを慎重に分析した上で、 Multiplexed Gene Fragments としてお届けします。本製品は、迅速かつハイスループットなスクリーニング用途に最適化されています。
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Twist の Multiplexed Gene Fragments のプールは、ご注文いただいたすべての配列を包括的に網羅し、より的確で合理的なスクリーニングのために、バリアント構築に対する精密な制御を実現します。
500 bp の dual gRNA バリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、ドロップアウトを最小限に抑えた完全な断片表現を示しており（図 1）、これは 450 bp の triple gRNA バリアントのプール（図 2）でも同様です。最後に、最大 80% の GC 含量を持つ断片など、広範囲の GC 含量を含むバリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、高い表現性を示し、バイアスが最小限に抑えられます（図 3）。
図 1．500 bp の Multiplexed Gene Fragments プールを増幅した際の、マッピングされた各 dual gRNA バリアントのリードカウント（X 軸）のグラフ。
図 2．450 bp の Multiplexed Gene Fragments のプールを増幅した際の、マッピングした各 triple gRNA バリアントのリードカウント（X軸）のグラフ。
図 3：鎖長 500 bp の Multiplexed Gene Fragments のプールを増幅した際のGC プロットを作成したところ、GC 含量が80%に達する広範な範囲において、バイアスが最小限に抑えられることが示された。X 軸は、GC 含量の異なる 14 グループの配列カテゴリー。Y 軸はリードカウント。
Twist の Multiplexed Gene Fragments のプールは、ご注文いただいたすべての配列を包括的に網羅し、より的確で合理的なスクリーニングのために、バリアント構築に対する精密な制御を実現します。
500 bp の dual gRNA バリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、ドロップアウトを最小限に抑えた完全な断片表現を示しており（図 1）、これは 450 bp の triple gRNA バリアントのプール（図 2）でも同様です。最後に、最大 80% の GC 含量を持つ断片など、広範囲の GC 含量を含むバリアントの Multiplexed Gene Fragments プールは、高い表現性を示し、バイアスが最小限に抑えられます（図 3）。
図 1．500 bp の Multiplexed Gene Fragments プールを増幅した際の、マッピングされた各 dual gRNA バリアントのリードカウント（X 軸）のグラフ。
図 2．450 bp の Multiplexed Gene Fragments のプールを増幅した際の、マッピングした各 triple gRNA バリアントのリードカウント（X軸）のグラフ。
図 3：鎖長 500 bp の Multiplexed Gene Fragments のプールを増幅した際のGC プロットを作成したところ、GC 含量が80%に達する広範な範囲において、バイアスが最小限に抑えられることが示された。X 軸は、GC 含量の異なる 14 グループの配列カテゴリー。Y 軸はリードカウント。
収量
増幅済み dsDNA、200 ng 以上納期
8 ～ 12 営業日納品形態
乾燥状態の dsDNA（2 mL チューブにプール）鎖長
301 ～ 500 bpプールサイズ
最小・最大の制限なし均一性
90% の配列が平均値の 3 倍以内*品質管理（QC）
フラグメント解析によりプール中の遺伝子の 90% 超が正しい鎖長を持つことを確保エラー率
1：2000 塩基（元のプール合成より、増幅前まで）*ご利用条件：Multiplexed Gene Fragments の標準納期は、8 ～ 12 営業日です。これは配列の長さや複雑さによって変動します。Multiplexed Gene Fragments の鎖長は最大 500 塩基対、可変領域には最大 460 bp が割り当てられ、プライマー領域には最小 40 bp が確保されます。品質管理試験により、プール内の 90% を超える遺伝子配列がユーザー定義の鎖長であることが確保されます。
研究用途にのみお使いいただけます。診断用には使用できません。
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8 ～ 12 営業日納品形態
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フラグメント解析によりプール中の遺伝子の 90% 超が正しい鎖長を持つことを確保エラー率
1：2000 塩基（元のプール合成より、増幅前まで）*ご利用条件：Multiplexed Gene Fragments の標準納期は、8 ～ 12 営業日です。これは配列の長さや複雑さによって変動します。Multiplexed Gene Fragments の鎖長は最大 500 塩基対、可変領域には最大 460 bp が割り当てられ、プライマー領域には最小 40 bp が確保されます。品質管理試験により、プール内の 90% を超える遺伝子配列がユーザー定義の鎖長であることが確保されます。
研究用途にのみお使いいただけます。診断用には使用できません。
はじめに
- ステップ１：本ページの連絡先フォームにご記入ください
- ステップ２：MGF 提出フォームをダウンロードし、MGF 設計について、すべての空欄にご記入ください
- ステップ 3：本ページの「ファイル送信」タブをクリックして、記入した提出フォームをアップロードしてください
ご不明な点がございましたら、お気軽に {{[email protected]}} までメールでお問い合わせください
提出の準備はよろしいですか？
- ステップ１：記入済みの提出フォームをアップロードします
- ステップ２：当社 MGF チームの専門家がお客様のプロジェクトを確認いたします
- ステップ 3：MGF チームでプロジェクトを確認後、お見積もりのご連絡をいたします
- ステップ 4：お客様がお見積もりをご承諾後、MGF チームより製造チームにプロジェクトを送ります
ご不明な点がございましたら、お気軽に {{[email protected]}} までメールでお問い合わせください
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