データは語る

高品質なデータ

Twist Bioscience のシリコンベース DNA合成プラットフォームおよびライブラリテクノロジーにより、高信頼性のデータをより短期間で得られる高品質なライブラリがご利用いただけます。他の 2 つの競合技術と比較すると（図を参照）、 Twist のライブラリは設計したアミノ酸頻度からのずれが 1% 未満でした。Twist の in silico DNA合成プラットフォームによって、設計されたアミノ酸比率との正確な一致に加えて、望ましい結合モチーフや鎖長のバリエーションをマルチドメインライブラリにシームレスに組み込むことができるので、変異空間の網羅的解析を可能にする変異体遺伝子ライブラリを正確に設計し、カスタマイズすることができます。

また、 Twist ライブラリでは、NNK ライブラリや TRIM ライブラリにありがちな問題や課題を回避することができます。各変異体は一塩基ずつ書き込まれると共に、合成前に検査されることで、終止コドン、不利なモチーフ、不要な変異、望ましくないバイアスなどがすべてプロセスの最初に除去されます。その結果、機能面で要求通りの変異体がライブラリに濃縮され、スクリーニングにおける負荷が軽減されます。

業界をリードする当社のライブラリは、精密に設計された、すぐに使える高多様性ライブラリであり、より多くの機会で研究の目標を達成できます。

優れたライブラリ

Twist には分子生物学の高度な専門的基盤があり、変異体遺伝子ライブラリを精密に構築することが可能です。当社の一塩基制御アプローチにより、スクリーニングプロセスに悪影響を与えるモチーフを排除した高多様性ライブラリをご提供可能です。当社は、目的とする変異をお客様自身が決めた比率で備えた、比類のない品質かつ完全カスタマイズのライブラリをご用意します。ここではその品質を表すコンビナトリアル変異ライブラリ (CVL) の例を示しています。7 つの連続したアミノ酸に関する変異体が作製され、それぞれの位置で予想通りの変異が見られ、ほぼすべてが目的とする比率になっています。

Position 1 と Position 6 では、野生型アミノ酸がそれぞれ 40%（Position 1）と 30%（Position 6）の比率になるよう設計されました。残りの 18 種のアミノ酸は、いずれも 3.3% 程度の低い割合となるよう設計されました。

Position 3 から Position 5 では、アミノ酸残基すべてが設計値、実測値とも 5.3%でした。

ユーザー定義 CDR ライブラリ

Twist Bioscience のユーザー定義変異体遺伝子ライブラリでは、どういった CDR（相補性決定領域）配列をフレームワークに組み込むかを選択することができます。

各 CDR はコドン最適化が可能で、不要な制限部位が含まれないようにすることができます。機械学習はすでに、抗体ライブラリの解析や、例えばより高い親和性や特異性をもたらすような特定の CDR の組み合わせを同定するためのツールとして用いられており、科学研究に不可欠な要素となっています。

Twist のシリコンベース合成プラットフォームと組み合わせることで、解析から生成・明示されたライブラリの組み合わせを完全人工合成ライブラリにシームレスに組み込むことで、変異空間の探索を洗練させることができます。

NGS で品質管理されたライブラリ

すべてのライブラリが NGS を用いて検証されているため、ネガティブデータは機能向上が見込めない変異を特定するのに用いることができ、次のライブラリ設計の際にそれらを除去することができます。

表は、合成した変異領域の７ヵ所におけるアミノ酸頻度（%）を示しています。７つの連続したアミノ酸の位置に、19 種類のアミノ酸残基（システインは省略）を有する変異体を生成しました。こちらは NGS で得られた頻度データを表にしたもので、緑の濃淡が期待値からの逸脱を示しています。予想されるすべての変異体がすべての位置で存在し、その観測頻度は期待値（仕様）5.3% の 25% 以内でした。