概要 データ アプリケーション 資料
概要

NGSワークフロー用に設計された低バイアス、高忠実度の増幅。

NGSライブラリ増幅用に設計されたTwist TrueAmp Polymeraseは、GC含量が極端な場合でも均一なカバレッジを実現し、低インプットからの高感度と自動化対応のホットスタートパフォーマンスを提供します。

柔軟
バイアスのない高忠実度の結果
5~95%のGCでバイアスなく増幅し、困難なターゲットの可視性を維持します。
忠実度の向上とホモポリマーのスリッページを抑えることで、信頼性の高いバリアントコールを実現します。
作業
困難なサンプルからの信頼性の高いパフォーマンス
DNAインプットが100 pg以下であっても、複雑なライブラリから一貫した高収量が得られます。
効率
簡素化されたスケーラブルなワークフロー
アプタマーを使用したスタートにより、自動化対応のワークフローに必要な室温での安定性を提供します。
Twistライブラリ調製試薬とターゲットエンリッチメント試薬で検証されたシングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスで、ワークフローを合理化します。

ライブラリの複雑性を損なわない遺伝子工学的増幅。

多くのPCR酵素は、複雑なNGSライブラリではなく、単一のアンプリコンタスク(qPCR、クローニング)用に最適化されています。

Trueamp

TrueAmpがアプローチを変更


遺伝子工学によるプルーフリーディングと高処理能力を備えたDNAポリメラーゼにより、業界トップクラスのGCの均一性、収量、ライブラリ増幅の忠実度を提供します。

結果


短いGC中性分子に対するバイアスを軽減し、1回の解析あたりの利用可能なデータが増加します。

主な機能

  • シングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスにより、セットアップを簡素化して処理エラーを低減します
  • キャプチャ前およびキャプチャ後の増幅に対応します
  • Twist TEキットと併用した同日または夜間のハイブリダイゼーションワークフロー用に設計されています
  • Twistライブラリ調製試薬およびエンリッチメント試薬による検証済みで、エンドツーエンドのパフォーマンスの一貫性を維持します

 

 

cfDNA Library Preparation with TrueAmp Polymerase Kit

Twist cfDNA Library Preparation with TrueAmp Polymeraseにより、低インプットのサンプルから堅牢なパフォーマンスを実現します

cfDNA

 

詳細はこちら

NGSワークフロー用に設計された低バイアス、高忠実度の増幅。

NGSライブラリ増幅用に設計されたTwist TrueAmp Polymeraseは、GC含量が極端な場合でも均一なカバレッジを実現し、低インプットからの高感度と自動化対応のホットスタートパフォーマンスを提供します。

柔軟
バイアスのない高忠実度の結果
5~95%のGCでバイアスなく増幅し、困難なターゲットの可視性を維持します。
忠実度の向上とホモポリマーのスリッページを抑えることで、信頼性の高いバリアントコールを実現します。
作業
困難なサンプルからの信頼性の高いパフォーマンス
DNAインプットが100 pg以下であっても、複雑なライブラリから一貫した高収量が得られます。
効率
簡素化されたスケーラブルなワークフロー
アプタマーを使用したスタートにより、自動化対応のワークフローに必要な室温での安定性を提供します。
Twistライブラリ調製試薬とターゲットエンリッチメント試薬で検証されたシングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスで、ワークフローを合理化します。
cfDNA Library Preparation with TrueAmp Polymerase Kit

Twist cfDNA Library Preparation with TrueAmp Polymeraseにより、低インプットのサンプルから堅牢なパフォーマンスを実現します

cfDNA

 

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ライブラリの複雑性を損なわない遺伝子工学的増幅。

多くのPCR酵素は、複雑なNGSライブラリではなく、単一のアンプリコンタスク(qPCR、クローニング)用に最適化されています。

Trueamp

TrueAmpがアプローチを変更


遺伝子工学によるプルーフリーディングと高処理能力を備えたDNAポリメラーゼにより、業界トップクラスのGCの均一性、収量、ライブラリ増幅の忠実度を提供します。

結果


短いGC中性分子に対するバイアスを軽減し、1回の解析あたりの利用可能なデータが増加します。

主な機能

  • シングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスにより、セットアップを簡素化して処理エラーを低減します
  • キャプチャ前およびキャプチャ後の増幅に対応します
  • Twist TEキットと併用した同日または夜間のハイブリダイゼーションワークフロー用に設計されています
  • Twistライブラリ調製試薬およびエンリッチメント試薬による検証済みで、エンドツーエンドのパフォーマンスの一貫性を維持します

 

 

データ
GC含量が極端な場合でも低バイアスで増幅

TrueAmpは他社製品では対応できない領域でもカバレッジを維持し、シーケンシングの経済性を向上させ、困難なターゲットを維持します。

図

図1:GCで正規化したカバレッジ、ATリッチのクロストリジウム・ディフィシルとGCリッチの百日咳菌。

低インプットでの効率的で堅牢な収量

効率の向上により、TrueAmpはより少ないサイクルで収量ターゲットを達成できるため、サイクルによるアーチファクトを低減します。キャプチャ後PCRに典型的な低収量ライブラリでも、堅牢性を維持します。

ウェブ

図2:1 ng~100 fgの連続希釈、QubitおよびTapeStation QC。

高忠実度とアーチファクトの低減

遺伝子工学的手法によるプルーフリーディングポリメラーゼは、シトシンの脱アミノ化によって引き起こされることが多いC→Tの取込みエラーを低減し、長いホモポリマーのスリッページを軽減します。これは、高感度のバリアント検出に不可欠です。

ウェブ図3

図3:700万個を超える塩基の取込み後の置換率。Twistクローンプラスミドを使用したホモポリマーのリードアウト。

信頼性の高いPCRに必要なビーズ耐性

磁気ビーズは精製およびサイズ選択に広く使用されていますが、PCRを阻害して収量を低下させることがあります。図4に示すように、Twist TrueAmp Polymerase Mixは、ビーズ濃度が高い(6.25~50 μl)場合でも、他のポリメラーゼよりも高いシーケンシングリードカウントを維持します。この強力なビーズ耐性により、ワークフローを簡素化し、手直しを低減し、一貫したデータ品質を保証します。

ウェブ図4

図 4:PCR中の常磁性ビーズに対する耐性。PCR反応物を、6.25 μl、12.5 μl、25 μl、50 μlのMyOne T1ビーズ、M270ビーズ(Invitrogen)、Twist DNA Purification Beadsでスパイクしました。ビーズ除去後に反応物を精製し、Qubit dsDNA Broad Range Assayで定量化しました。

GC含量が極端な場合でも低バイアスで増幅

TrueAmpは他社製品では対応できない領域でもカバレッジを維持し、シーケンシングの経済性を向上させ、困難なターゲットを維持します。

図

図1:GCで正規化したカバレッジ、ATリッチのクロストリジウム・ディフィシルとGCリッチの百日咳菌。

低インプットでの効率的で堅牢な収量

効率の向上により、TrueAmpはより少ないサイクルで収量ターゲットを達成できるため、サイクルによるアーチファクトを低減します。キャプチャ後PCRに典型的な低収量ライブラリでも、堅牢性を維持します。

ウェブ

図2:1 ng~100 fgの連続希釈、QubitおよびTapeStation QC。

高忠実度とアーチファクトの低減

遺伝子工学的手法によるプルーフリーディングポリメラーゼは、シトシンの脱アミノ化によって引き起こされることが多いC→Tの取込みエラーを低減し、長いホモポリマーのスリッページを軽減します。これは、高感度のバリアント検出に不可欠です。

ウェブ図3

図3:700万個を超える塩基の取込み後の置換率。Twistクローンプラスミドを使用したホモポリマーのリードアウト。

信頼性の高いPCRに必要なビーズ耐性

磁気ビーズは精製およびサイズ選択に広く使用されていますが、PCRを阻害して収量を低下させることがあります。図4に示すように、Twist TrueAmp Polymerase Mixは、ビーズ濃度が高い(6.25~50 μl)場合でも、他のポリメラーゼよりも高いシーケンシングリードカウントを維持します。この強力なビーズ耐性により、ワークフローを簡素化し、手直しを低減し、一貫したデータ品質を保証します。

ウェブ図4

図 4:PCR中の常磁性ビーズに対する耐性。PCR反応物を、6.25 μl、12.5 μl、25 μl、50 μlのMyOne T1ビーズ、M270ビーズ(Invitrogen)、Twist DNA Purification Beadsでスパイクしました。ビーズ除去後に反応物を精製し、Qubit dsDNA Broad Range Assayで定量化しました。

アプリケーション
図

リキッドバイオプシーにより、血液、血漿、尿から、cfDNAやRNAなどのバイオマーカーを低侵襲的に検出することができます。NGSと組み合わせると、少量の断片化サンプルから、疾患進行に対する高感度の洞察が得られます。ライブラリ調製の進歩は、検出可能なバイオマーカーを拡大し続けています。TrueAmp Polymeraseは、低インプットのcfDNAにおける堅牢な収量、低バイアスの増幅、高忠実度を促進し、これらのワークフローで使用可能なデータを最大化します。

 
サンプリング頻度
腫瘍内不均一性
がんの早期発見
微小残存病変(MRD)
転移性疾患の検出
リキッドバイオプシー
低侵襲。高頻度で長期的なサンプリングが可能です。
ctDNAは1回のアッセイで複数の腫瘍部位を反映します。
cfDNAは1つのサンプルから複数のがんを検出できます。
高感度のNGSは低濃度のctDNAを検出します。TrueAmpは低インプットからの信号を維持します。
システム全体のctDNA検出。メチル化は発生源を示す可能性があります。
従来の方法
侵襲的生検はサンプリングを制限します。画像検査は負担が大きいことがあります。
単一部位の生検では、空間的および時間的な不均一性が見落とされます。
臓器特異的であることが多く、感度や費用は様々です。
侵襲的処置が必要です。画像検査では早期の感度が不足しています。
感度が制限され、低頻度のモニタリングにより検出が遅れます。
次のステップに進みましょう。

低インプットのリキッドバイオプシー研究用のcfDNA Library Prep with TrueAmp Polymeraseの利点についての詳細をご覧ください。

詳細はこちら

図

リキッドバイオプシーにより、血液、血漿、尿から、cfDNAやRNAなどのバイオマーカーを低侵襲的に検出することができます。NGSと組み合わせると、少量の断片化サンプルから、疾患進行に対する高感度の洞察が得られます。ライブラリ調製の進歩は、検出可能なバイオマーカーを拡大し続けています。TrueAmp Polymeraseは、低インプットのcfDNAにおける堅牢な収量、低バイアスの増幅、高忠実度を促進し、これらのワークフローで使用可能なデータを最大化します。

次のステップに進みましょう。

低インプットのリキッドバイオプシー研究用のcfDNA Library Prep with TrueAmp Polymeraseの利点についての詳細をご覧ください。

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サンプリング頻度
腫瘍内不均一性
がんの早期発見
微小残存病変(MRD)
転移性疾患の検出
リキッドバイオプシー
低侵襲。高頻度で長期的なサンプリングが可能です。
ctDNAは1回のアッセイで複数の腫瘍部位を反映します。
cfDNAは1つのサンプルから複数のがんを検出できます。
高感度のNGSは低濃度のctDNAを検出します。TrueAmpは低インプットからの信号を維持します。
システム全体のctDNA検出。メチル化は発生源を示す可能性があります。
従来の方法
侵襲的生検はサンプリングを制限します。画像検査は負担が大きいことがあります。
単一部位の生検では、空間的および時間的な不均一性が見落とされます。
臓器特異的であることが多く、感度や費用は様々です。
侵襲的処置が必要です。画像検査では早期の感度が不足しています。
感度が制限され、低頻度のモニタリングにより検出が遅れます。
資料
NGSワークフロー用に設計
NGSワークフロー用に設計
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