NGSワークフロー用に設計された低バイアス、高忠実度の増幅。
NGSライブラリ増幅用に設計されたTwist TrueAmp Polymeraseは、GC含量が極端な場合でも均一なカバレッジを実現し、低インプットからの高感度と自動化対応のホットスタートパフォーマンスを提供します。
ライブラリの複雑性を損なわない遺伝子工学的増幅。
多くのPCR酵素は、複雑なNGSライブラリではなく、単一のアンプリコンタスク(qPCR、クローニング)用に最適化されています。
TrueAmpがアプローチを変更
遺伝子工学によるプルーフリーディングと高処理能力を備えたDNAポリメラーゼにより、業界トップクラスのGCの均一性、収量、ライブラリ増幅の忠実度を提供します。
結果
短いGC中性分子に対するバイアスを軽減し、1回の解析あたりの利用可能なデータが増加します。
主な機能
- シングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスにより、セットアップを簡素化して処理エラーを低減します
- キャプチャ前およびキャプチャ後の増幅に対応します
- Twist TEキットと併用した同日または夜間のハイブリダイゼーションワークフロー用に設計されています
- Twistライブラリ調製試薬およびエンリッチメント試薬による検証済みで、エンドツーエンドのパフォーマンスの一貫性を維持します
NGSワークフロー用に設計された低バイアス、高忠実度の増幅。
NGSライブラリ増幅用に設計されたTwist TrueAmp Polymeraseは、GC含量が極端な場合でも均一なカバレッジを実現し、低インプットからの高感度と自動化対応のホットスタートパフォーマンスを提供します。
ライブラリの複雑性を損なわない遺伝子工学的増幅。
多くのPCR酵素は、複雑なNGSライブラリではなく、単一のアンプリコンタスク(qPCR、クローニング)用に最適化されています。
TrueAmpがアプローチを変更
遺伝子工学によるプルーフリーディングと高処理能力を備えたDNAポリメラーゼにより、業界トップクラスのGCの均一性、収量、ライブラリ増幅の忠実度を提供します。
結果
短いGC中性分子に対するバイアスを軽減し、1回の解析あたりの利用可能なデータが増加します。
主な機能
- シングルチューブ2倍濃縮のマスターミックスにより、セットアップを簡素化して処理エラーを低減します
- キャプチャ前およびキャプチャ後の増幅に対応します
- Twist TEキットと併用した同日または夜間のハイブリダイゼーションワークフロー用に設計されています
- Twistライブラリ調製試薬およびエンリッチメント試薬による検証済みで、エンドツーエンドのパフォーマンスの一貫性を維持します
TrueAmpは他社製品では対応できない領域でもカバレッジを維持し、シーケンシングの経済性を向上させ、困難なターゲットを維持します。
図1:GCで正規化したカバレッジ、ATリッチのクロストリジウム・ディフィシルとGCリッチの百日咳菌。
効率の向上により、TrueAmpはより少ないサイクルで収量ターゲットを達成できるため、サイクルによるアーチファクトを低減します。キャプチャ後PCRに典型的な低収量ライブラリでも、堅牢性を維持します。
図2:1 ng~100 fgの連続希釈、QubitおよびTapeStation QC。
遺伝子工学的手法によるプルーフリーディングポリメラーゼは、シトシンの脱アミノ化によって引き起こされることが多いC→Tの取込みエラーを低減し、長いホモポリマーのスリッページを軽減します。これは、高感度のバリアント検出に不可欠です。
図3:700万個を超える塩基の取込み後の置換率。Twistクローンプラスミドを使用したホモポリマーのリードアウト。
磁気ビーズは精製およびサイズ選択に広く使用されていますが、PCRを阻害して収量を低下させることがあります。図4に示すように、Twist TrueAmp Polymerase Mixは、ビーズ濃度が高い(6.25~50 μl)場合でも、他のポリメラーゼよりも高いシーケンシングリードカウントを維持します。この強力なビーズ耐性により、ワークフローを簡素化し、手直しを低減し、一貫したデータ品質を保証します。
図 4:PCR中の常磁性ビーズに対する耐性。PCR反応物を、6.25 μl、12.5 μl、25 μl、50 μlのMyOne T1ビーズ、M270ビーズ(Invitrogen)、Twist DNA Purification Beadsでスパイクしました。ビーズ除去後に反応物を精製し、Qubit dsDNA Broad Range Assayで定量化しました。
TrueAmpは他社製品では対応できない領域でもカバレッジを維持し、シーケンシングの経済性を向上させ、困難なターゲットを維持します。
図1:GCで正規化したカバレッジ、ATリッチのクロストリジウム・ディフィシルとGCリッチの百日咳菌。
効率の向上により、TrueAmpはより少ないサイクルで収量ターゲットを達成できるため、サイクルによるアーチファクトを低減します。キャプチャ後PCRに典型的な低収量ライブラリでも、堅牢性を維持します。
図2:1 ng~100 fgの連続希釈、QubitおよびTapeStation QC。
遺伝子工学的手法によるプルーフリーディングポリメラーゼは、シトシンの脱アミノ化によって引き起こされることが多いC→Tの取込みエラーを低減し、長いホモポリマーのスリッページを軽減します。これは、高感度のバリアント検出に不可欠です。
図3:700万個を超える塩基の取込み後の置換率。Twistクローンプラスミドを使用したホモポリマーのリードアウト。
磁気ビーズは精製およびサイズ選択に広く使用されていますが、PCRを阻害して収量を低下させることがあります。図4に示すように、Twist TrueAmp Polymerase Mixは、ビーズ濃度が高い(6.25~50 μl)場合でも、他のポリメラーゼよりも高いシーケンシングリードカウントを維持します。この強力なビーズ耐性により、ワークフローを簡素化し、手直しを低減し、一貫したデータ品質を保証します。
図 4:PCR中の常磁性ビーズに対する耐性。PCR反応物を、6.25 μl、12.5 μl、25 μl、50 μlのMyOne T1ビーズ、M270ビーズ(Invitrogen)、Twist DNA Purification Beadsでスパイクしました。ビーズ除去後に反応物を精製し、Qubit dsDNA Broad Range Assayで定量化しました。
リキッドバイオプシーにより、血液、血漿、尿から、cfDNAやRNAなどのバイオマーカーを低侵襲的に検出することができます。NGSと組み合わせると、少量の断片化サンプルから、疾患進行に対する高感度の洞察が得られます。ライブラリ調製の進歩は、検出可能なバイオマーカーを拡大し続けています。TrueAmp Polymeraseは、低インプットのcfDNAにおける堅牢な収量、低バイアスの増幅、高忠実度を促進し、これらのワークフローで使用可能なデータを最大化します。
低インプットのリキッドバイオプシー研究用のcfDNA Library Prep with TrueAmp Polymeraseの利点についての詳細をご覧ください。
リキッドバイオプシーにより、血液、血漿、尿から、cfDNAやRNAなどのバイオマーカーを低侵襲的に検出することができます。NGSと組み合わせると、少量の断片化サンプルから、疾患進行に対する高感度の洞察が得られます。ライブラリ調製の進歩は、検出可能なバイオマーカーを拡大し続けています。TrueAmp Polymeraseは、低インプットのcfDNAにおける堅牢な収量、低バイアスの増幅、高忠実度を促進し、これらのワークフローで使用可能なデータを最大化します。
低インプットのリキッドバイオプシー研究用のcfDNA Library Prep with TrueAmp Polymeraseの利点についての詳細をご覧ください。
