超ハイスループットシーケンシングを実現するシンプルなワークフロー
Twist の FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、集団研究やアグリゲノミクスなどの超ハイスループットアプリケーション向けに、従来のマイクロアレイをベースとした技術に代わる NGS（次世代シーケンシング）を実現します。Twist の Normalization by LigationTM（NBL）技術と酵素による断片化法を組み合わせたこのキットは、幅広い DNA インプット量に対してサンプルの正規化を行えるため、通常のサンプル処理ステップのコストと複雑性が軽減されます。早い段階でサンプルをバーコーディングすることで、下流で 12 個の別々のサンプルを 1 つの反応にプールすることができ、より合理的で効率的なワークフローが可能になります。
研究用途にのみお使いいただけます。診断や臨床用途には使用できません。
*8 ウェル対 96 ウェルのワークフローに基づく
Twist の超ハイスループットシーケンシングへのアプローチをご覧ください
超ハイスループットシーケンシングを実現するシンプルなワークフロー
Twist の FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、集団研究やアグリゲノミクスなどの超ハイスループットアプリケーション向けに、従来のマイクロアレイをベースとした技術に代わる NGS（次世代シーケンシング）を実現します。Twist の Normalization by LigationTM（NBL）技術と酵素による断片化法を組み合わせたこのキットは、幅広い DNA インプット量に対してサンプルの正規化を行えるため、通常のサンプル処理ステップのコストと複雑性が軽減されます。早い段階でサンプルをバーコーディングすることで、下流で 12 個の別々のサンプルを 1 つの反応にプールすることができ、より合理的で効率的なワークフローが可能になります。
Twist の超ハイスループットシーケンシングへのアプローチをご覧ください
研究用途にのみお使いいただけます。診断や臨床用途には使用できません。
*8 ウェル対 96 ウェルのワークフローに基づく
FAQ
Twist FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、Normalization by LigationTM という新しい手法を採用しており、 事前および中間のサンプル定量が不要となり、シーケンシングワークフローが合理化されます。
断片化反応とライゲーション反応が、サンプルごとに 1 つのウェルで行われます。ライゲーションで使用するアダプターにはインラインバーコードが含まれており、このステップの後に96 ウェルプレートの 1 列の全 12 ウェルをプーリングできます。それぞれのプールは、プールレベルでのデマルチプレックス化用に PCR で追加されたインデックス（UDI）と共に調製されます。FlexPrep キットからの 1 回のシーケンシング実行で最大 1,152 のサンプルを処理することで、シーケンシングスループットを最大化できます。この効率向上によりコストと消耗品の節約につながります。
さまざまな DNA インプット量で NGS のリードデプスを正規化しました。各ライブラリで同定された総リード数の割合は、ユニークデュアルインデックスおよびインラインバーコードのデマルチプレックス化を行った後に算出されます。完全な正規化が行われた場合の平均値は 1.04%（100/96）です。
FlexPrep UHT により、ターゲットエンリッチメント後に均一なカバレッジを持つ複雑性の高いライブラリが調製できます。Twist カスタムパネルと組み合わせて、FlexPrep は SNP、k-mer、構造多型など関心のあるゲノム領域に対してカバー領域を調整することが可能です。濃縮後のサンプルは平均 75x のカバレッジにダウンサンプリングされています。Picard のうち、主なターゲットエンリッチメントメトリクスを示しています。
96-plex のターゲットエンリッチメント30 ng ～ 300 ng の gDNA インプットをライブラリ調製に使用 |
|
生ターゲットカバレッジ（75X）における指標 |
平均 ± 標準偏差 |
選択塩基Mean Target CoverageキメラFold-80 ベースペナルティカバーされる塩基（10X）カバーされる塩基（20X）カバーされる塩基（0X） |
79.22% ± 0.54%32.74 ± 4.781.31% ± 0.38%1.416 ± 0.04496.06% ± 0.94%85.41% ± 6.36%0.43% ± 0.04% |
*使用した方法：96 のライブラリを、Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit および FlexPrep ターゲットエンリッチメントプロトコルを用いてヒトゲノム DNA（gDNA）（NA12878）からカスタム 800 kb パネルの 96-plexとして調製し、Illumina NextSeq 550 でシーケンシングを行いました。それぞれ 12 サンプルからなる 8 つのライブラリプールを得ました（各ライブラリプール中のインプットの質量は 30 ng ～ 300 ng の範囲）。**標準キットは、酵素による断片化とその後のライゲーション、そして PCR を用いるワークフローに基づいています。 ***すべてのチャート、図およびグラフは Twist の内部データ（2024 年 9 月）に基づいています。研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。
Twist FlexPrepTM UHT ライブラリ調製キットは、Normalization by LigationTM という新しい手法を採用しており、 事前および中間のサンプル定量が不要となり、シーケンシングワークフローが合理化されます。
断片化反応とライゲーション反応が、サンプルごとに 1 つのウェルで行われます。ライゲーションで使用するアダプターにはインラインバーコードが含まれており、このステップの後に96 ウェルプレートの 1 列の全 12 ウェルをプーリングできます。それぞれのプールは、プールレベルでのデマルチプレックス化用に PCR で追加されたインデックス（UDI）と共に調製されます。FlexPrep キットからの 1 回のシーケンシング実行で最大 1,152 のサンプルを処理することで、シーケンシングスループットを最大化できます。この効率向上によりコストと消耗品の節約につながります。
さまざまな DNA インプット量で NGS のリードデプスを正規化しました。各ライブラリで同定された総リード数の割合は、ユニークデュアルインデックスおよびインラインバーコードのデマルチプレックス化を行った後に算出されます。完全な正規化が行われた場合の平均値は 1.04%（100/96）です。
FlexPrep UHT により、ターゲットエンリッチメント後に均一なカバレッジを持つ複雑性の高いライブラリが調製できます。Twist カスタムパネルと組み合わせて、FlexPrep は SNP、k-mer、構造多型など関心のあるゲノム領域に対してカバー領域を調整することが可能です。濃縮後のサンプルは平均 75x のカバレッジにダウンサンプリングされています。Picard のうち、主なターゲットエンリッチメントメトリクスを示しています。
96-plex のターゲットエンリッチメント30 ng ～ 300 ng の gDNA インプットをライブラリ調製に使用 |
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生ターゲットカバレッジ（75X）における指標 |
平均 ± 標準偏差 |
選択塩基Mean Target CoverageキメラFold-80 ベースペナルティカバーされる塩基（10X）カバーされる塩基（20X）カバーされる塩基（0X） |
79.22% ± 0.54%32.74 ± 4.781.31% ± 0.38%1.416 ± 0.04496.06% ± 0.94%85.41% ± 6.36%0.43% ± 0.04% |
*使用した方法：96 のライブラリを、Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit および FlexPrep ターゲットエンリッチメントプロトコルを用いてヒトゲノム DNA（gDNA）（NA12878）からカスタム 800 kb パネルの 96-plexとして調製し、Illumina NextSeq 550 でシーケンシングを行いました。それぞれ 12 サンプルからなる 8 つのライブラリプールを得ました（各ライブラリプール中のインプットの質量は 30 ng ～ 300 ng の範囲）。**標準キットは、酵素による断片化とその後のライゲーション、そして PCR を用いるワークフローに基づいています。 ***すべてのチャート、図およびグラフは Twist の内部データ（2024 年 9 月）に基づいています。研究専用です。診断や臨床用途には使用できません。
ローパスシーケンシング向けの FlexPrep™ UHT ライブラリ調製キットと、効率的な解析を実現する Curio Genomics を活用して、アグリゲノミクス研究の規模を拡大しましょう。Twist の柔軟なライブラリ調製は、ハイスループット処理と効率的な補完機能を備えた Curio Genomics のプラットフォームとシームレスに統合され、大規模集団でのコスト効率の高いジェノタイピングを可能にします。
効率的なヒト集団ゲノミクスを実現するには、FlexPrep™ UHT ライブラリ調製キットと Gencove の強力な解析ツールを組み合わせてください。Twist の革新的なライブラリ調製（Normalization By Ligation™：NBL）によってボトルネックが解消され、同時に Gencove の補完パイプラインが低カバレッジ下でも高信頼性のバリアントコールを可能にすることで、効率とスループットが最大化され、優れた精度かつ低コストでジェノタイピングデータから価値ある知見が得られます。
ローパスシーケンシング向けの FlexPrep™ UHT ライブラリ調製キットと、効率的な解析を実現する Curio Genomics を活用して、アグリゲノミクス研究の規模を拡大しましょう。Twist の柔軟なライブラリ調製は、ハイスループット処理と効率的な補完機能を備えた Curio Genomics のプラットフォームとシームレスに統合され、大規模集団でのコスト効率の高いジェノタイピングを可能にします。
効率的なヒト集団ゲノミクスを実現するには、FlexPrep™ UHT ライブラリ調製キットと Gencove の強力な解析ツールを組み合わせてください。Twist の革新的なライブラリ調製（Normalization By Ligation™：NBL）によってボトルネックが解消され、同時に Gencove の補完パイプラインが低カバレッジ下でも高信頼性のバリアントコールを可能にすることで、効率とスループットが最大化され、優れた精度かつ低コストでジェノタイピングデータから価値ある知見が得られます。
109220
Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 192 Samples109223
Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 192 Samples109224
Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 1152 Samples109226
Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 1152 Samples109220
Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 192 Samples109223
Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 192 Samples109224
Twist FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit, 1152 Samples109226
Twist FlexPrep™ UHT LP and Hybridization Kit, 1152 Samples
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