Twist UMI Adapter システムを用いると、セルフリー DNA (cfDNA)から低頻度の体細胞変異を高感度で同定できます。UMI アダプターシステムを用いて調製したライブラリは、解析時のコンセンサスリードの構築に使用することで、バリアント検出感度を高め、PCR エラーの寄与を減らすことができます。

本システムは異種のサンプルにも最適なパフォーマンスを発揮するよう設計され、16 または 96 サンプル形式で利用可能です。以下のものが含まれます。

  • Twist Unique Molecular Identifier (UMI) Adapters:「T-A」オーバーハングワークフローに対応した、分子バーコード(各分子に 2 個ずつ)。
  • Twist 10 bp Unique Dual-Indexed (UDI) Primers:ペアごとに固有の配列を組み合わせたデュアルインデックス設計で、自動化アプリケーションに適した 96 ウェルプレート形式で提供されます。

主な利点

高感度

  • アダプター配列によって、PCR エラーの優れた識別が可能
  • がん研究とがんの発見において、低頻度バリアントの偽陽性を低減

Twist の NGS ソリューションに対応

  • Twist 物理的断片化ライブラリ調製ワークフローと容易に統合可能
  • Twist のターゲットエンリッチメントパネルで性能試験済み

体細胞アプリケーションに対応

  • gDNA または cfDNA のインプットに対応
  • 16 または 96 サンプルに対応するスケーラブルな形式

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シーケンス解析ワークフローに UMI を適切に導入する方法を学ぶ

Twist NGS ワークフローに対応

Twist の包括的な NGS ツールキットには、少量のサンプルを DNA からデータに変換するために必要なものが揃っています。Twist UMI アダプターシステムは、Twist ユニバーサルアダプターの代替品として、あるいは追加ステップとして、既存のライブラリ調製ワークフローにシームレスに統合することができます。

高感度のバリアント検出

Twist のUMI アダプターシステムは、 PCR duplicate 由来のエラーを除去するコンセンサス構築用のツールとなります。

NGS - Twist UMI Adapter System:レアバリアント検出を可能にする高感度

NGS - NGS - Library Preparation with the Twist UMI Adapter System
Library Preparation EF 2.0 with Enzymatic Fragmentation および Twist UMI Adapter System
酵素による断片化と Twist UMI アダプターシステム

Twist Unique Molecular Identifier (UMI) Adapter System を用いてシーケンシングデータを処理する

Twist UMI の設計に関する概要および使用ガイドライン
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