概要 RNA ライブラリ調製 RNA エクソーム RNA FUSION ご注文 資料
概要

Twist の RNA シーケンシングワークフローで、 RNA シーケンシング用の均一なライブラリを作製するための完璧な NGS ソリューションをご利用いただけます。Twist はターゲットを絞ったトランスクリプトーム解析または全トランスクリプトーム解析のワークフローを提供しています。お客様の作業時間を削減すると共に、ターゲットエンリッチメントキットなど Twist が現在ラインナップしている NGS 試薬のセットと統合することができます。各ワークフローでは、トランスレーショナルリサーチ用サンプルを含む、幅広いインプットおよびサンプルタイプから、そのままシーケンシング可能な高品質なライブラリが得られます。

Twist Custom RNA Panels は、比類のない一貫したパフォーマンスを提供する、幅広いパネルサイズ/転写産物のターゲット領域をカバーするよう設計・構築されています。Twist では独自の専門的な経験を生かして、エクソンーエクソン間の結合部位を優先的に選択するのではなく、個々のエクソンを標的にする、exon-awareデザインアルゴリズムを開発しました。この設計手法を Twist RNA Exome に適用することで、トランスクリプトーム解析や融合遺伝子検出に最適なツールにしました。

組み合わせ

このエンドツーエンドのワークフローは、効果的かつ合理化されたライブラリ調製キット、高品質なユニークデュアルインデックス(UDI)、分子バーコード、最適化されたターゲットエンリッチメント、エクソンを考慮した独自のパネル設計アルゴリズムを組み合わせることにより実現します。

ターゲット RNA シーケンシング

  • カスタムパネルを作製し、目的の RNA 転写産物のみをシーケンシング 
  • Twist RNA ライブラリ調製、 Twist ハイブリダイゼーション、 RNA ターゲットエンリッチメントパネルを組み合わせて使用
  • 主要なターゲットに対する感度が向上し、FFPE から得られる 低品質で劣化した RNA も使用可能

RNA Exome & ターゲットシーケンシング

  • タンパク質コーディング領域および個々のスプライス部位を考慮し、エクソンについて検討を加えたプローブ設計
  • より多くのサンプルを処理できるよう、サンプルあたりのリード数を低減
  • 19708 個の遺伝子と 63215 個のアイソフォームをターゲット化 
  • 全トランスクリプトームに対し 1.8 倍超のエンリッチメント

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全トランスクリプトーム解析

  • mRNA、lncRNA、その他の種類の RNA の発現量を測定
  • 生のサンプルまたは FFPE サンプルから抽出された total RNA からライブラリ調製
  • Twist RNA Library Prep を Twist rRNA & Globin Depletion キットと組み合わせて使用
  • RNA ライブラリ調製を 5 時間もかからず完了可能

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RNA Fusion Detection

  • Twist Alliance CeGaT Fusion Panel を用いて、既知・新規に関わらず融合遺伝子を濃縮
  • CeGaT との提携による、専門的なコンテンツ設計
  • Twist RNA Library Prep キットを用いた、最適化した完全型ワークフローで、そのままシーケンシングできるライブラリ
  • Twist コアキャプチャ・エンリッチメントテクノロジーを活用して効率を最大化

詳細はこちら

 

さらに詳しく調べる

幅広いサンプルインプットおよびサンプルタイプに対応する RNA シーケンシングワークフローを合理化する方法についてご覧ください。

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Twist の RNA シーケンシングワークフローで、 RNA シーケンシング用の均一なライブラリを作製するための完璧な NGS ソリューションをご利用いただけます。Twist はターゲットを絞ったトランスクリプトーム解析または全トランスクリプトーム解析のワークフローを提供しています。お客様の作業時間を削減すると共に、ターゲットエンリッチメントキットなど Twist が現在ラインナップしている NGS 試薬のセットと統合することができます。各ワークフローでは、トランスレーショナルリサーチ用サンプルを含む、幅広いインプットおよびサンプルタイプから、そのままシーケンシング可能な高品質なライブラリが得られます。

Twist Custom RNA Panels は、比類のない一貫したパフォーマンスを提供する、幅広いパネルサイズ/転写産物のターゲット領域をカバーするよう設計・構築されています。Twist では独自の専門的な経験を生かして、エクソンーエクソン間の結合部位を優先的に選択するのではなく、個々のエクソンを標的にする、exon-awareデザインアルゴリズムを開発しました。この設計手法を Twist RNA Exome に適用することで、トランスクリプトーム解析や融合遺伝子検出に最適なツールにしました。

組み合わせ

このエンドツーエンドのワークフローは、効果的かつ合理化されたライブラリ調製キット、高品質なユニークデュアルインデックス(UDI)、分子バーコード、最適化されたターゲットエンリッチメント、エクソンを考慮した独自のパネル設計アルゴリズムを組み合わせることにより実現します。

ターゲット RNA シーケンシング

  • カスタムパネルを作製し、目的の RNA 転写産物のみをシーケンシング 
  • Twist RNA ライブラリ調製、 Twist ハイブリダイゼーション、 RNA ターゲットエンリッチメントパネルを組み合わせて使用
  • 主要なターゲットに対する感度が向上し、FFPE から得られる 低品質で劣化した RNA も使用可能

RNA Exome & ターゲットシーケンシング

  • タンパク質コーディング領域および個々のスプライス部位を考慮し、エクソンについて検討を加えたプローブ設計
  • より多くのサンプルを処理できるよう、サンプルあたりのリード数を低減
  • 19708 個の遺伝子と 63215 個のアイソフォームをターゲット化 
  • 全トランスクリプトームに対し 1.8 倍超のエンリッチメント

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全トランスクリプトーム解析

  • mRNA、lncRNA、その他の種類の RNA の発現量を測定
  • 生のサンプルまたは FFPE サンプルから抽出された total RNA からライブラリ調製
  • Twist RNA Library Prep を Twist rRNA & Globin Depletion キットと組み合わせて使用
  • RNA ライブラリ調製を 5 時間もかからず完了可能

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RNA Fusion Detection

  • Twist Alliance CeGaT Fusion Panel を用いて、既知・新規に関わらず融合遺伝子を濃縮
  • CeGaT との提携による、専門的なコンテンツ設計
  • Twist RNA Library Prep キットを用いた、最適化した完全型ワークフローで、そのままシーケンシングできるライブラリ
  • Twist コアキャプチャ・エンリッチメントテクノロジーを活用して効率を最大化

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幅広いサンプルインプットおよびサンプルタイプに対応する RNA シーケンシングワークフローを合理化する方法についてご覧ください。

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RNA Library Prep

Twist の RNA 製品で、 RNA シーケンシング用の均一なライブラリを作製するための完璧な NGS ソリューションをご利用いただけます。このエンドツーエンドのワークフローは、効果的かつ合理化されたライブラリ調製キット、高品質なユニークデュアルインデックス(UDI)、分子バーコード、最適化されたターゲットエンリッチメント、エクソンを考慮した独自のパネル設計アルゴリズムを組み合わせることにより実現します。

Twist ターゲット RNA シーケンシングワークフロー

  • カスタムパネルを作製し、目的の RNA 転写産物のみをシーケンシング
  • Twist RNA ライブラリ調製、 Twist ハイブリダイゼーション、 RNA ターゲットエンリッチメントパネルを組み合わせて使用
  • 主要なターゲットに対する感度が向上し、FFPE から得られる 低品質で劣化した RNA も使用可能

標的

チャート

Twist 全トランスクリプトーム解析ワークフロー

  • mRNA、lncRNA、その他の種類の RNA の発現量を測定
  • 新鮮検体や FFPE 検体から抽出した Total RNA からライブラリを調製
  • Twist RNA Library Prep を Twist rRNA & Globin Depletion キットと組み合わせて使用
  • RNA ライブラリ調製を 5 時間もかからず完了可能

全

チャート2

関連資料

 

Twist の RNA 製品で、 RNA シーケンシング用の均一なライブラリを作製するための完璧な NGS ソリューションをご利用いただけます。このエンドツーエンドのワークフローは、効果的かつ合理化されたライブラリ調製キット、高品質なユニークデュアルインデックス(UDI)、分子バーコード、最適化されたターゲットエンリッチメント、エクソンを考慮した独自のパネル設計アルゴリズムを組み合わせることにより実現します。

Twist ターゲット RNA シーケンシングワークフロー

  • カスタムパネルを作製し、目的の RNA 転写産物のみをシーケンシング
  • Twist RNA ライブラリ調製、 Twist ハイブリダイゼーション、 RNA ターゲットエンリッチメントパネルを組み合わせて使用
  • 主要なターゲットに対する感度が向上し、FFPE から得られる 低品質で劣化した RNA も使用可能

標的

チャート

Twist 全トランスクリプトーム解析ワークフロー

  • mRNA、lncRNA、その他の種類の RNA の発現量を測定
  • 新鮮検体や FFPE 検体から抽出した Total RNA からライブラリを調製
  • Twist RNA Library Prep を Twist rRNA & Globin Depletion キットと組み合わせて使用
  • RNA ライブラリ調製を 5 時間もかからず完了可能

全

チャート2

関連資料

 

RNA Exome

RNA Exome

Twist RNA Exome は Twist RNA Library Prep および Twist Target Enrichment と共に使用することができ、FFPE を含むさまざまなソースから抽出された RNA から、トランスクリプトーム解析データを生成できる信頼性の高いツールです。RNA Exome は、同じ数の遺伝子を検出するのに必要なシーケンシングリードの数は低減されつつ、シグナルは増加します。これにより、生物学的サンプルの転写状態を正確に把握するために重要な低発現ターゲットの検出が可能になります。さらに、RNA Exome におけるエクソンを考慮した設計手法により、一般的な設計手法では見失われかねないアイソフォームやジャンクションを検出することが可能になります。この完全型シーケンシング・ソリューションによって、ヒトトランスクリプトームのタンパク質コード配列について RNA シーケンシングを行うために、非常に複雑かつ均一なシーケンシングリードを作製することができます。

ヒトトランスクリプトーム用の設計
ヒトトランスクリプトーム用の設計
35.8 Mb の塩基、19,708 個の遺伝子、63,215 個のアイソフォームをターゲット化
Gencode および RefSeq から得られる配列情報で構築
全トランスクリプトームに対して、1.8 倍超のエンリッチメント
RNA 用に構築されたターゲットエンリッチメント
RNA 用に構築されたターゲットエンリッチメント
タンパク質コーディング領域、融合遺伝子、アイソフォーム用にエクソンを考慮したプローブ
より多くのサンプルを処理できるよう、サンプルあたりのリード数を低減
FFPE および低 RNA インプットに対応

より少ないリードで、より多くをターゲットに

Twist RNA Exome は、下図の通り、FFPE およびユニバーサル・ヒトリファレンス RNA を用いた場合の両方で、さまざまな RNA インプットに対して、より少ないリード数でより多くのターゲットを検出しています。すべてのライブラリは、Twist RNA Library Prep で調製されています。

グラフ

RNA Exome

Twist RNA Exome は Twist RNA Library Prep および Twist Target Enrichment と共に使用することができ、FFPE を含むさまざまなソースから抽出された RNA から、トランスクリプトーム解析データを生成できる信頼性の高いツールです。RNA Exome は、同じ数の遺伝子を検出するのに必要なシーケンシングリードの数は低減されつつ、シグナルは増加します。これにより、生物学的サンプルの転写状態を正確に把握するために重要な低発現ターゲットの検出が可能になります。さらに、RNA Exome におけるエクソンを考慮した設計手法により、一般的な設計手法では見失われかねないアイソフォームやジャンクションを検出することが可能になります。この完全型シーケンシング・ソリューションによって、ヒトトランスクリプトームのタンパク質コード配列について RNA シーケンシングを行うために、非常に複雑かつ均一なシーケンシングリードを作製することができます。

ヒトトランスクリプトーム用の設計
ヒトトランスクリプトーム用の設計
35.8 Mb の塩基、19,708 個の遺伝子、63,215 個のアイソフォームをターゲット化
Gencode および RefSeq から得られる配列情報で構築
全トランスクリプトームに対して、1.8 倍超のエンリッチメント
RNA 用に構築されたターゲットエンリッチメント
RNA 用に構築されたターゲットエンリッチメント
タンパク質コーディング領域、融合遺伝子、アイソフォーム用にエクソンを考慮したプローブ
より多くのサンプルを処理できるよう、サンプルあたりのリード数を低減
FFPE および低 RNA インプットに対応

より少ないリードで、より多くをターゲットに

Twist RNA Exome は、下図の通り、FFPE およびユニバーサル・ヒトリファレンス RNA を用いた場合の両方で、さまざまな RNA インプットに対して、より少ないリード数でより多くのターゲットを検出しています。すべてのライブラリは、Twist RNA Library Prep で調製されています。

グラフ

RNA Fusion

RNA Fusion

融合遺伝子は多くの場合、さまざまながん種で、発がん性のドライバー変異として作用します。その迅速かつ正確な検出によって、臨床に情報がもたらされ、治療に関する決定を後押しします。Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel Kit は RNA ベースのエンリッチメントパネルであり、融合遺伝子を調べるために、従来の方法よりも標的を絞った感度の高いアプローチを提供するものです。

本パネルには、約 30 種のがんに関連付けられた 160 の融合遺伝子が含まれています。この融合遺伝子は、遺伝子診断およびシーケンシング分野で欧州を代表する企業である CeGaT によって選定されたものです。この設計は、既知の融合遺伝子を検出するためだけでなく、新規の融合遺伝子を同定するためにも使用されるものです。

本パネルは、完全なエンドツーエンドのワークフローで卓越したパフォーマンスを実現するために、 Twist RNA Library Prep Kit と共に使用するよう最適化され、検証されたものです。RNA ベースのエンリッチメントによる高いキャプチャ効率によって、検出感度が向上しています。本パネルは、治療法を決定するための腫瘍検体のスクリーニングや、腫瘍を分類するための新規融合遺伝子の発見に理想的です。*

ターゲット
RNA 融合遺伝子を確実に濃縮
CeGaT との提携による、専門的なコンテンツ設計
Twist RNA Library Prep キットで最適化されたワークフロー
Twist コアエンリッチメントテクノロジーでキャプチャ効率を最大化

パネルの設計

  • 160 個の融合遺伝子(66 個の遺伝子のブレークポイント)
  • 7394 種類のプローブ
  • さまざまながん種を網羅

*注:Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel, 3 MB は、ISO-13485 認証取得済みです。

関連資料

お客様の声

「CeGaT では、クライアントの皆様に包括的で、安価な腫瘍診断を提供したいと考えています。Twist ターゲットエンリッチメントテクノロジーは堅牢なワークフローであり、ラボにおけるハイスループットなワークフローにおいて、80 を超える治療対応可能な融合遺伝子変異を有する患者由来サンプルについて正確な解析を可能にします。アンプリコンベースのワークフローに伴うアレルドロップアウトの問題を回避することができます。私たち自身による検証で、このパネルを用いたことで、臨床的に対処可能な結果が得られ、治療の決定に役立つことが分かりました。」**

Florian Battke 博士、CeGaT GmbH 開発担当ディレクター

** 免責事項:この結果は、当該研究機関独自で得られたものであり、他の研究機関では必ずしも同じ結果が得られない可能性もあります。

RNA Fusion

融合遺伝子は多くの場合、さまざまながん種で、発がん性のドライバー変異として作用します。その迅速かつ正確な検出によって、臨床に情報がもたらされ、治療に関する決定を後押しします。Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel Kit は RNA ベースのエンリッチメントパネルであり、融合遺伝子を調べるために、従来の方法よりも標的を絞った感度の高いアプローチを提供するものです。

本パネルには、約 30 種のがんに関連付けられた 160 の融合遺伝子が含まれています。この融合遺伝子は、遺伝子診断およびシーケンシング分野で欧州を代表する企業である CeGaT によって選定されたものです。この設計は、既知の融合遺伝子を検出するためだけでなく、新規の融合遺伝子を同定するためにも使用されるものです。

本パネルは、完全なエンドツーエンドのワークフローで卓越したパフォーマンスを実現するために、 Twist RNA Library Prep Kit と共に使用するよう最適化され、検証されたものです。RNA ベースのエンリッチメントによる高いキャプチャ効率によって、検出感度が向上しています。本パネルは、治療法を決定するための腫瘍検体のスクリーニングや、腫瘍を分類するための新規融合遺伝子の発見に理想的です。*

お客様の声

「CeGaT では、クライアントの皆様に包括的で、安価な腫瘍診断を提供したいと考えています。Twist ターゲットエンリッチメントテクノロジーは堅牢なワークフローであり、ラボにおけるハイスループットなワークフローにおいて、80 を超える治療対応可能な融合遺伝子変異を有する患者由来サンプルについて正確な解析を可能にします。アンプリコンベースのワークフローに伴うアレルドロップアウトの問題を回避することができます。私たち自身による検証で、このパネルを用いたことで、臨床的に対処可能な結果が得られ、治療の決定に役立つことが分かりました。」**

Florian Battke 博士、CeGaT GmbH 開発担当ディレクター

** 免責事項:この結果は、当該研究機関独自で得られたものであり、他の研究機関では必ずしも同じ結果が得られない可能性もあります。

ターゲット
RNA 融合遺伝子を確実に濃縮
CeGaT との提携による、専門的なコンテンツ設計
Twist RNA Library Prep キットで最適化されたワークフロー
Twist コアエンリッチメントテクノロジーでキャプチャ効率を最大化

パネルの設計

  • 160 個の融合遺伝子(66 個の遺伝子のブレークポイント)
  • 7394 種類のプローブ
  • さまざまながん種を網羅

*注:Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel, 3 MB は、ISO-13485 認証取得済みです。

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ご注文
製品 SKU: RNA ライブラリ調製

107060

Twist RNA Library Prep Kit, 16 Samples

107061

Twist RNA Library Prep Kit, 96 Samples

107147

Twist RNA Library Prep with Depletion, 16 Samples

107148

Twist RNA Library Prep with Depletion, 96 Samples
製品 SKU: RNA エクソーム

107143

RNA Exome 2 Reactions

107144

RNA Exome 12 Reactions

107146

RNA Exome 96 Reactions
製品 SKU: RNA Fusion

106067

Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB, 2 Rxn Kit

106101

Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB, 12 Rxn Kit

106100

Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB, 96 Rxn Kit
製品 SKU: RNA ライブラリ調製

107060

Twist RNA Library Prep Kit, 16 Samples

107061

Twist RNA Library Prep Kit, 96 Samples

107147

Twist RNA Library Prep with Depletion, 16 Samples

107148

Twist RNA Library Prep with Depletion, 96 Samples
製品 SKU: RNA エクソーム

107143

RNA Exome 2 Reactions

107144

RNA Exome 12 Reactions

107146

RNA Exome 96 Reactions
製品 SKU: RNA Fusion

106067

Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB, 2 Rxn Kit

106101

Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB, 12 Rxn Kit

106100

Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB, 96 Rxn Kit
リソース
合理化された RNA-Seq ワークフロー
合理化された RNA-Seq ワークフロー
合理化された RNA-Seq ワークフロー
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