概要 オリゴプール New! クローニング済みオリゴプール アプリケーション 資料
概要

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

当社の革新的なシリコンベース DNA合成プラットフォームでは、一本ずつ異なる 100 万超の一本鎖 DNA オリゴヌクレオチドを一度に合成可能です。シリコンウェハー1枚に数千のクラスターが形成されており、それぞれに 121 個の独立した合成基点が用意されています。各合成基点に別々のオリゴヌクレオチド配列を指定して合成することが可能です。シリコンウェハー技術のイメージは下図の通りです。

シリコンウェハー上での DNA合成のスループットが非常に高いため、プールを構成するオリゴヌクレオチドの種類の数に事実上制限はありません。用途に制限を設けることなく、お客様の実験に精密に合わせたオリゴプールをご注文ください。

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

長鎖オリゴヌクレオチドで、より多くのイノベーションを

鎖長で制限を受けることは、もうありません。より長いオリゴヌクレオチドが含まれるオリゴプールで、プロモーター、エンハンサー、ガイド、プローブなど、必要な要素と配列をすべてコードできます。最大 300 塩基のオリゴヌクレオチド長により、一度の設計で複数の要素をコードすることが可能であり、より多くのことができるようになります。

長鎖オリゴヌクレオチドで、より多くのイノベーションを

一回で十分なスクリーニング結果を

プールの均一性が非常に高く、偏りがないため、一回のスクリーニングでより多くのターゲットを設定することができます。つまり、必要なデータカバレッジを達成するための労力を少なくでき、時間とコストの節約につながります。

一回で正確なスクリーニング

信頼のおける確かなデータ

高精度かつ高均一性の Twist オリゴプールをお使いいただくことで、実験結果の質に自信を持つことができます。合成エラーや非効率性によるデータポイントの見逃しはありません。ご希望のプールサイズで、業界トップクラスの均一性と低エラー率を誇る最大 300 塩基のオリゴヌクレオチドをお使いください。優れた品質を持つ当社のオリゴプールを、お客様の用途で必要なスケールと鎖長でご活用ください。

データに確信が持てる

ご不明な点はございませんか?

より詳細な情報が必要な場合はお気軽にご連絡ください。ぜひ当社にお任せください。

お問い合わせ

均一性が重要な理由

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

当社の革新的なシリコンベース DNA合成プラットフォームでは、一本ずつ異なる 100 万超の一本鎖 DNA オリゴヌクレオチドを一度に合成可能です。シリコンウェハー1枚に数千のクラスターが形成されており、それぞれに 121 個の独立した合成基点が用意されています。各合成基点に別々のオリゴヌクレオチド配列を指定して合成することが可能です。シリコンウェハー技術のイメージは下図の通りです。

シリコンウェハー上での DNA合成のスループットが非常に高いため、プールを構成するオリゴヌクレオチドの種類の数に事実上制限はありません。用途に制限を設けることなく、お客様の実験に精密に合わせたオリゴプールをご注文ください。

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

長鎖オリゴヌクレオチドで、より多くのイノベーションを

鎖長で制限を受けることは、もうありません。より長いオリゴヌクレオチドが含まれるオリゴプールで、プロモーター、エンハンサー、ガイド、プローブなど、必要な要素と配列をすべてコードできます。最大 300 塩基のオリゴヌクレオチド長により、一度の設計で複数の要素をコードすることが可能であり、より多くのことができるようになります。

長鎖オリゴヌクレオチドで、より多くのイノベーションを

一回で十分なスクリーニング結果を

プールの均一性が非常に高く、偏りがないため、一回のスクリーニングでより多くのターゲットを設定することができます。つまり、必要なデータカバレッジを達成するための労力を少なくでき、時間とコストの節約につながります。

一回で正確なスクリーニング

信頼のおける確かなデータ

高精度かつ高均一性の Twist オリゴプールをお使いいただくことで、実験結果の質に自信を持つことができます。合成エラーや非効率性によるデータポイントの見逃しはありません。ご希望のプールサイズで、業界トップクラスの均一性と低エラー率を誇る最大 300 塩基のオリゴヌクレオチドをお使いください。優れた品質を持つ当社のオリゴプールを、お客様の用途で必要なスケールと鎖長でご活用ください。

データに確信が持てる

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均一性が重要な理由
オリゴプール

オリゴプール

Twist オリゴプールは、当社のシリコンベース DNA 書き込み技術を用いて合成された、高多様性の一本鎖オリゴヌクレオチド・コレクションです。当社の合成プラットフォームは、1回の合成で数十万本の高品質かつ高精度なオリゴヌクレオチドを大量に並行して生産することができます。この技術により、CRISPRスクリーニングのようなアプリケーションで用いられる、複雑で多様なオリゴプールの生成を可能にしています。

当サービスの流れ

オリゴヌクレオチドの配列をご提供いただきますと、お客様ご自身がデザインされたオリゴプールライブラリが当社で合成されますので、お客様にはじっくりとご自身の実験や探索に取り組んでいただくことが可能です。

ライブラリ

優れた均一性のオリゴヌクレオチド合成

下記の図表は、23,000 個の 90 mer オリゴヌクレオチドを含む典型的なオリゴプールの NGS を用いた品質管理データで、カバレッジ 300X でのプールの均一性を示すものです。表にはこのプールの均一性に関する指標を示しています。Twist のオリゴプールは、バイアスのない、高い均一性かつ完全なオリゴヌクレオチドによって構成されています。

オリゴヌクレオチドのリードカウント

オリゴプールの配列解析

Twist Bioscience のオリゴプールと、アレイベースの他社製品を配列解析した結果、 Twist オリゴプールには期待通りの配列が 100% 含まれており、他社製品よりも正確な配列の割合が高いことが実証されました。

分析


仕様

鎖長 20 ~ 300 塩基
オリゴプールサイズ プールサイズに制限なし
収量 オリゴヌクレオチドあたり平均 > 0.2 fmol
均一性 90% を超えるオリゴヌクレオチドが平均値の 2.0 倍未満で存在
エラー率 最大 1 : 3000
納期 わずか 3 日*
価格 お問い合わせください

 

*標準のオリゴプールの納期は、鎖長と配列の複雑性により異なります。オリゴプールの鎖長によって、20 〜 121 ヌクレオチドでは 3 〜 6 営業日、121 〜 200 ヌクレオチドでは 3 〜 8 営業日、201 〜 300 ヌクレオチドでは 5 〜 10 営業日となります。

 

ご不明な点はございませんか?

より詳細な情報が必要な場合はお気軽にご連絡ください。ぜひ当社にお任せください。

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オリゴプール

Twist オリゴプールは、当社のシリコンベース DNA 書き込み技術を用いて合成された、高多様性の一本鎖オリゴヌクレオチド・コレクションです。当社の合成プラットフォームは、1回の合成で数十万本の高品質かつ高精度なオリゴヌクレオチドを大量に並行して生産することができます。この技術により、CRISPRスクリーニングのようなアプリケーションで用いられる、複雑で多様なオリゴプールの生成を可能にしています。

当サービスの流れ

オリゴヌクレオチドの配列をご提供いただきますと、お客様ご自身がデザインされたオリゴプールライブラリが当社で合成されますので、お客様にはじっくりとご自身の実験や探索に取り組んでいただくことが可能です。

ライブラリ

優れた均一性のオリゴヌクレオチド合成

下記の図表は、23,000 個の 90 mer オリゴヌクレオチドを含む典型的なオリゴプールの NGS を用いた品質管理データで、カバレッジ 300X でのプールの均一性を示すものです。表にはこのプールの均一性に関する指標を示しています。Twist のオリゴプールは、バイアスのない、高い均一性かつ完全なオリゴヌクレオチドによって構成されています。

オリゴヌクレオチドのリードカウント

オリゴプールの配列解析

Twist Bioscience のオリゴプールと、アレイベースの他社製品を配列解析した結果、 Twist オリゴプールには期待通りの配列が 100% 含まれており、他社製品よりも正確な配列の割合が高いことが実証されました。

分析


仕様

鎖長 20 ~ 300 塩基
オリゴプールサイズ プールサイズに制限なし
収量 オリゴヌクレオチドあたり平均 > 0.2 fmol
均一性 90% を超えるオリゴヌクレオチドが平均値の 2.0 倍未満で存在
エラー率 最大 1 : 3000
納期 わずか 3 日*
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*標準のオリゴプールの納期は、鎖長と配列の複雑性により異なります。オリゴプールの鎖長によって、20 〜 121 ヌクレオチドでは 3 〜 6 営業日、121 〜 200 ヌクレオチドでは 3 〜 8 営業日、201 〜 300 ヌクレオチドでは 5 〜 10 営業日となります。

 

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クローニング済みオリゴプール

クローニング済みオリゴプール

オリゴプールの品質は、実験を成功に導くための基盤となります。合成時やクローニング時のエラーにより、オリゴプールの品質は容易に変化し、目的の配列に過不足が生じます。Twist は、最適化されたクローニングサービスの提供を開始しました。 PCR 増幅条件のテスト、適切なポリメラーゼ/プライマーペアの選択、クローニングワークフローの設計に伴う研究者の労力が大きく軽減されます。Twist Bioscience にオリゴプールの合成とクローニングをお任せください。

当サービスの流れ

わずか2ステップで、クローニング済みのカスタムオリゴプールを得ることができます。オリゴヌクレオチドの配列をご提供いただきますと、お客様ご自身がデザインされたオリゴプールライブラリを当社で合成、増幅、クローニングしてお届けしますので、お客様にはその分、じっくりご自身の実験や探索に取り組んでいただけます。

フロー

Twist Bioscience のクローニング済みオリゴプールは、すべての鎖長で高い均一性と低エラー率を実現

鎖長 150 塩基以下で高 GC 含量のオリゴプールを増幅・クローニングした場合のパフォーマンスデータ:

均一性


オリゴプール

高 GC 含量で、最大鎖長 300 塩基のオリゴプールを増幅・クローニングした場合のパフォーマンスデータ:

均一性


均一性2

実験データに最高の品質と精度を実現

Twist のクローニング済みオリゴプールは、低エラー率、高い均一性だけではなく、低キメラ率でもあります。キメラとは、オリゴプール内でさまざまなオリゴヌクレオチドの不適切な増幅や組換えを引き起こす、最適ではない PCR 条件の結果として生じる、不要なハイブリッド分子のことです。オンターゲットのクローニング済みプールおよび、キメラを含むオフターゲットのクローニング済みプール(後者は最終的に、望ましくない配列で構成されたクローニング済みオリゴプールになる)の比較例は以下の通りです。

キメラ
 

Twist であれば、キメラについて心配する必要はありません!実際にお確かめください。

従来の増幅法と Twist 独自の増幅法のパフォーマンス比較

オリゴプール

仕様

オリゴヌクレオチド長:最大鎖長 300 塩基
オリゴプールサイズ:プールサイズに制限なし
収量:各オリゴヌクレオチド 平均 0.2 fmol 超
均一性:90% 超のオリゴヌクレオチドが平均値の 5.0 倍未満
キメラ率:1.5% と低いキメラ率*
納期:4 週間と短い納期*

 

*ご利用規約:クローニングと増幅を含むクローニング済みオリゴプールの基本納期は、鎖長 100 ヌクレオチド以下および鎖長 300 ヌクレオチド以下で、それぞれ 4 ~ 6 週間および 6 ~ 8 週間です。クローニング済みオリゴプールの鎖長に関係なく、新しいベクターの作製が必要な場合は、この基本納期にさらに 2 週間追加されます。キメラ率、ドロップアウト率、均一性は配列の複雑さによって異なります。

ご不明な点はございませんか?

より詳細な情報が必要な場合はお気軽にご連絡ください。ぜひ当社にお任せください。

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クローニング済みオリゴプール

オリゴプールの品質は、実験を成功に導くための基盤となります。合成時やクローニング時のエラーにより、オリゴプールの品質は容易に変化し、目的の配列に過不足が生じます。Twist は、最適化されたクローニングサービスの提供を開始しました。 PCR 増幅条件のテスト、適切なポリメラーゼ/プライマーペアの選択、クローニングワークフローの設計に伴う研究者の労力が大きく軽減されます。Twist Bioscience にオリゴプールの合成とクローニングをお任せください。

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フロー

Twist Bioscience のクローニング済みオリゴプールは、すべての鎖長で高い均一性と低エラー率を実現

鎖長 150 塩基以下で高 GC 含量のオリゴプールを増幅・クローニングした場合のパフォーマンスデータ:

均一性


オリゴプール

高 GC 含量で、最大鎖長 300 塩基のオリゴプールを増幅・クローニングした場合のパフォーマンスデータ:

均一性


均一性2

実験データに最高の品質と精度を実現

Twist のクローニング済みオリゴプールは、低エラー率、高い均一性だけではなく、低キメラ率でもあります。キメラとは、オリゴプール内でさまざまなオリゴヌクレオチドの不適切な増幅や組換えを引き起こす、最適ではない PCR 条件の結果として生じる、不要なハイブリッド分子のことです。オンターゲットのクローニング済みプールおよび、キメラを含むオフターゲットのクローニング済みプール(後者は最終的に、望ましくない配列で構成されたクローニング済みオリゴプールになる)の比較例は以下の通りです。

キメラ
 

Twist であれば、キメラについて心配する必要はありません!実際にお確かめください。

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オリゴプール

仕様

オリゴヌクレオチド長:最大鎖長 300 塩基
オリゴプールサイズ:プールサイズに制限なし
収量:各オリゴヌクレオチド 平均 0.2 fmol 超
均一性:90% 超のオリゴヌクレオチドが平均値の 5.0 倍未満
キメラ率:1.5% と低いキメラ率*
納期:4 週間と短い納期*

 

*ご利用規約:クローニングと増幅を含むクローニング済みオリゴプールの基本納期は、鎖長 100 ヌクレオチド以下および鎖長 300 ヌクレオチド以下で、それぞれ 4 ~ 6 週間および 6 ~ 8 週間です。クローニング済みオリゴプールの鎖長に関係なく、新しいベクターの作製が必要な場合は、この基本納期にさらに 2 週間追加されます。キメラ率、ドロップアウト率、均一性は配列の複雑さによって異なります。

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アプリケーション

CRISPRスクリーニング用のガイド RNA ライブラリ

CRISPRスクリーニングは、遺伝子活性の精密かつハイスループットなノックアウト、干渉、調節を伴うため、遺伝子型と表現型の複雑な相互作用を明らかにすることを可能とします。各遺伝子ごとに複数のガイド RNA 分子をコードするようにオリゴプールが設計されます。

製品の利点:

  • ガイドライブラリ設計を完全に制御できるため、不要なガイド、無駄なシーケンシング、遺伝子あたりのガイドの比率の制限をなくすことが可能です。
  • 高忠実性の Cas 酵素と高精度合成を組み合わせることで、オフターゲット作用を最小限に抑えた、真に忠実度の高いスクリーニングを実現します。
  • 信じられないほど均一でバイアスのないプールにより、S/N比を増大させて最大のヒット検出を実現し、下流工程のコストを削減します。
  • 最大 300 塩基のオリゴヌクレオチドによって、さらなる実験要素の追加を可能とします。1本のオリゴヌクレオチドあたり複数のガイドの追加や、ゲノムの相同性や最小限プロモーターの追加も容易に行えます。

単一細胞トランスクリプトミクスに基づく次世代CRISPRスクリーニング

こちらのウェビナーをご覧ください:Next generation CRISPR screens based on single-cell transcriptomics

ゲノムタイリングライブラリ

タイリングライブラリによって、ゲノム機能の包括的な研究が可能になります。オリゴプールは、ペプチドアレイ、 mRNA コード配列、ゲノム断片をコードできます。

製品の利点:

  • ご希望のゲノム領域を正確にタイリングします。設計段階で不要な配列を無視することにより、実験ノイズを低減します。
  • 通常は遺伝子として合成できない複雑な反復配列や回文配列もオリゴヌクレオチドでコード化できます。
  • より大きなペプチド構造やゲノム構造は、長さ 300 塩基のオリゴヌクレオチドにコードすることができます。
  • 均一な合成により、包括的なスクリーニングに伴うオーバーサンプリングが最小限に抑えられます。

RNAワクチン開発のためのコロナウイルス病原性因子の特定

こちらの記事をお読みください: Identifying Coronavirus Virulence Factors for RNA Vaccine Development with Twist Oligo Pools

ハイスループット遺伝子制御スクリーニング

遺伝子の発現や調節を制御する遺伝学的要素に関する知見は、合成生物学や潜在的な疾患治療法の開発に広く応用されています。オリゴプールは、遺伝子発現のプロファイリングやレポーターを用いたアプリケーションなど、遺伝子制御のハイスループットスクリーニングを可能にします。

製品の利点:

  • 高品質なプールにより、すべての塩基の機能を調べることができます。
  • 高い均一性のため、少ないスクリーニング回数で結論を導くことが可能です。
  • 最大 300 塩基のプールにより、複数の要素や相同領域を柔軟に追加できます。

Epitranscriptome Screening on TechNetworks

こちらのウェビナーをご覧ください:Epitranscriptome Screening on TechNetworks

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション(FISH)により、生体サンプル中の核酸の存在量と空間的構成を直接可視化できます。オリゴプールは蛍光プローブをコードすることができます。蛍光プローブは、蛍光マーカーに結合すると多数のターゲットを可視化でき、それは調節可能かつプログラム可能です。

製品の利点:

  • 迅速な FISH プローブの開発
  • 配列制御により効果的なターゲット設定が可能
  • より長いオリゴヌクレオチドでより特異的なターゲット設定が可能

Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

こちらのウェビナーをご覧ください:Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

CRISPRスクリーニング用のガイド RNA ライブラリ

CRISPRスクリーニングは、遺伝子活性の精密かつハイスループットなノックアウト、干渉、調節を伴うため、遺伝子型と表現型の複雑な相互作用を明らかにすることを可能とします。各遺伝子ごとに複数のガイド RNA 分子をコードするようにオリゴプールが設計されます。

製品の利点:

  • ガイドライブラリ設計を完全に制御できるため、不要なガイド、無駄なシーケンシング、遺伝子あたりのガイドの比率の制限をなくすことが可能です。
  • 高忠実性の Cas 酵素と高精度合成を組み合わせることで、オフターゲット作用を最小限に抑えた、真に忠実度の高いスクリーニングを実現します。
  • 信じられないほど均一でバイアスのないプールにより、S/N比を増大させて最大のヒット検出を実現し、下流工程のコストを削減します。
  • 最大 300 塩基のオリゴヌクレオチドによって、さらなる実験要素の追加を可能とします。1本のオリゴヌクレオチドあたり複数のガイドの追加や、ゲノムの相同性や最小限プロモーターの追加も容易に行えます。

単一細胞トランスクリプトミクスに基づく次世代CRISPRスクリーニング

こちらのウェビナーをご覧ください:Next generation CRISPR screens based on single-cell transcriptomics

ゲノムタイリングライブラリ

タイリングライブラリによって、ゲノム機能の包括的な研究が可能になります。オリゴプールは、ペプチドアレイ、 mRNA コード配列、ゲノム断片をコードできます。

製品の利点:

  • ご希望のゲノム領域を正確にタイリングします。設計段階で不要な配列を無視することにより、実験ノイズを低減します。
  • 通常は遺伝子として合成できない複雑な反復配列や回文配列もオリゴヌクレオチドでコード化できます。
  • より大きなペプチド構造やゲノム構造は、長さ 300 塩基のオリゴヌクレオチドにコードすることができます。
  • 均一な合成により、包括的なスクリーニングに伴うオーバーサンプリングが最小限に抑えられます。

RNAワクチン開発のためのコロナウイルス病原性因子の特定

こちらの記事をお読みください: Identifying Coronavirus Virulence Factors for RNA Vaccine Development with Twist Oligo Pools

ハイスループット遺伝子制御スクリーニング

遺伝子の発現や調節を制御する遺伝学的要素に関する知見は、合成生物学や潜在的な疾患治療法の開発に広く応用されています。オリゴプールは、遺伝子発現のプロファイリングやレポーターを用いたアプリケーションなど、遺伝子制御のハイスループットスクリーニングを可能にします。

製品の利点:

  • 高品質なプールにより、すべての塩基の機能を調べることができます。
  • 高い均一性のため、少ないスクリーニング回数で結論を導くことが可能です。
  • 最大 300 塩基のプールにより、複数の要素や相同領域を柔軟に追加できます。

Epitranscriptome Screening on TechNetworks

こちらのウェビナーをご覧ください:Epitranscriptome Screening on TechNetworks

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション(FISH)により、生体サンプル中の核酸の存在量と空間的構成を直接可視化できます。オリゴプールは蛍光プローブをコードすることができます。蛍光プローブは、蛍光マーカーに結合すると多数のターゲットを可視化でき、それは調節可能かつプログラム可能です。

製品の利点:

  • 迅速な FISH プローブの開発
  • 配列制御により効果的なターゲット設定が可能
  • より長いオリゴヌクレオチドでより特異的なターゲット設定が可能

Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

こちらのウェビナーをご覧ください:Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

資料

お客様の声

Twist の一本鎖 DNA オリゴプールは高い均一性と低エラー率、そして最大 300 塩基の鎖長という特徴から、 RNA でのプール作製に最適です。上記の特徴のおかげで、 RNA - 低分子間相互作用のスクリーニングを高精度かつ高効率で行うことができます。
小松 リチャード 馨
代表取締役、最高技術責任者/株式会社 xFOREST Therapeutics
Twist オリゴプールは、我々の研究用にカスタマイズした高品質な CRISPR ライブラリを合成できる、迅速かつ便利で柔軟な方法であることが分かりました。
Stephen Pettit
研究員/がん研究所(英国)
私たちは単一塩基置換による遺伝子調節機能の同定に焦点を当てた超並列レポーターアッセイ(MPRA)に取り組んでおり、オリゴが高い忠実度を持つことは大変重要です。Twist から入手したプールをシーケンシングしたところ、変異が想定の半分ほどで、驚くほど高品質でした。
Bernie Mulvey
博士課程学生/ワシントン大学 医学部(米国ミズーリ州セントルイス)
あらゆる規模に対応する
優れたパフォーマンス
あらゆる規模に対応する
優れたパフォーマンス
あらゆる規模に対応する
優れたパフォーマンス

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製造に関する大切な情報を常に把握していただけるよう、ご注文の進捗状況をその都度お知らせいたします

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