牛の育種事業におけるアレイからシーケンシングをベースとしたジェノタイピングへの移行 

このポスターでは、28,000頭規模の牛-子牛飼育事業が、Curio GenomicsおよびTwist Bioscienceと協力してアレイベースのジェノタイピングからシーケンスベースのジェノタイピングへ移行した事例を紹介します。本研究では、TwistのHTPセルフノーマライズFlexPrepライブラリ調製およびマルチプレックスキャプチャを用いて、従来70k牛アレイで捉えられていたゲノム領域をターゲットとする際の実現可能性と正確性を示しています。結果は、アレイとターゲットシーケンスデータの間で99%を超える一致率を示し、切り替えを完了して育種プログラムの効率を向上させるうえでの信頼を提供します。

重要な学び:

  • シーケンスベースのジェノタイピングは、従来のアレイベースの手法に代わる有効かつ正確な選択肢を提供し、高い一致率を示します。

  • 最低でも 30 ナノグラムのDNAインプットにより、ターゲットシーケンスで必要とされる十分なカバレッジ(20x+)とジェノタイプの正確性(99%+)を一貫して得ることができます。

  • CURIOのアグリゲノミクスデータ解析プラットフォームでは、マイクロアレイとNGSベースのジェノタイプ結果の両方を同時に可視化・比較することができます。

このポスターでは、28,000頭規模の牛-子牛飼育事業が、Curio GenomicsおよびTwist Bioscienceと協力してアレイベースのジェノタイピングからシーケンスベースのジェノタイピングへ移行した事例を紹介します。本研究では、TwistのHTPセルフノーマライズFlexPrepライブラリ調製およびマルチプレックスキャプチャを用いて、従来70k牛アレイで捉えられていたゲノム領域をターゲットとする際の実現可能性と正確性を示しています。結果は、アレイとターゲットシーケンスデータの間で99%を超える一致率を示し、切り替えを完了して育種プログラムの効率を向上させるうえでの信頼を提供します。

重要な学び:

  • シーケンスベースのジェノタイピングは、従来のアレイベースの手法に代わる有効かつ正確な選択肢を提供し、高い一致率を示します。

  • 最低でも 30 ナノグラムのDNAインプットにより、ターゲットシーケンスで必要とされる十分なカバレッジ(20x+)とジェノタイプの正確性(99%+)を一貫して得ることができます。

  • CURIOのアグリゲノミクスデータ解析プラットフォームでは、マイクロアレイとNGSベースのジェノタイプ結果の両方を同時に可視化・比較することができます。

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