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ハイブリッドキャプチャシーケンシングはアンプリコンシーケンシングよりもウイルスサーベイランスにおける堅牢性が高い
パンデミック新規株を遮断して阻止することを可能にするには、ウイルスゲノムシーケンシングの堅牢で正確な技術が条件となります。ウイルスゲノム配列には、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）を用いるのが一般的です。この方法は、アンプリコンプライマー結合領域に変異が蓄積してドロップアウトする可能性があるため、急速に変異する生物を扱う場合には、時間の経過とともに信頼性が低下します。ここでは、ターゲットキャプチャシーケシングが、パンデミック株のサーベイランスにおいて、急速に変異する株のドロップアウトを起こさない堅牢な代替手段であることを示しています。
このテクニカルノートに記載されている事項
急速に変異する疾患株のシーケンスを行う際に、アンプリコンシーケンスがどのようにドロップアウトを引き起こすか
ターゲットキャプチャーはドロップアウトに対してどの程度堅牢か。これはSARS-CoV-2のようなウイルスの正確な配列決定とサーベイランスにつながります
アンプリコンシーケンスでドロップアウトが見られた臨床サンプルでの堅牢なターゲットキャプチャの例
