近年、Peturb-seqなどの遺伝学的ツールが登場し、プールされたCRISPRスクリーンの解析とシングルセルRNAシーケンシングを組み合わせることで、哺乳類の遺伝子機能や遺伝子制御ネットワークに関し、これまでにない知見が得られています。しかし、これらのツールを使おうとすると、そ技術的および実用的な制限に阻まれ、使用が難しい状態にあります。

これらの課題を克服するために、カリフォルニア大学サンフランシスコ校、プリンストン大学、10x Genomicsの研究者らは、「ダイレクトキャプチャ」Peturb-seqを開発し、遺伝的相互作用をより高いスループットで調査できるようにしました。さらに、ハイブリダイゼーションを利用したターゲットエンリッチメント手法を追加することで、生物学的に意味のある転写産物のパネルを高感度かつ特異的に配列決定することが可能となり、実験コストを大幅に削減することが可能となっています。

このウェビナーでは...

• プールされたCRISPRスクリーンとシングルセルRNAシーケンシングを組み合わせたPerturb-seqにより、遺伝子の働きに関する偏りのない探究が可能になるとともに、遺伝子制御ネットワークの解明が可能になりました。
• スクリーニングのスループットを大幅に向上させ、この技術の規模と柔軟性を大幅に拡大したダイレクトキャプチャPerturb-seqの最新技術をご紹介します。
• 細胞あたり複数のsgRNAで個々の遺伝子をターゲットにすることで、CRISPRの干渉と活性化の効果がいかに向上するかをご理解ください。シングルセルスクリーン用のコンパクトで高活性なCRISPRライブラリをご使用になられることと思います。
• ハイブリダイゼーションを利用したターゲットエンリッチメントにより、対象となる転写産物のシーケンスコストを最大90％削減できます。
• Twist社のCRISPRオリゴプールとNGSターゲットエンリッチメントソリューションのスケーラビリティおよび精度により、この画期的な技術の開発と応用が後押しされました。