TCR ライブラリ

概要

養子免疫細胞療法（ACT）は、がん治療法の選択肢がほとんどなかった患者さんに、効果の高いがん治療を提供することにつながりました。ACT では、患者自身の免疫系を利用してがん細胞を攻撃します。

遺伝子工学で改変を加えた T 細胞受容体（TCR）を用いた TCR 療法は ACT の一種で、腫瘍に特有の抗原を標的とするものです。TCR 療法では、腫瘍に特徴的な変異を同定するために行う腫瘍生検のシーケンシングから始まり、一般的には、TCR レパトアを明らかにするために末梢血のシーケンシングも行います。

TCR レパトアのシーケンシングは、シングルセルシーケンシングまたはバルクシーケンシングで行うことができます。それぞれに利点があります。バルクシーケンシングでは、より多くの配列空間をサンプリングすることができますが、TCR の α 鎖と β 鎖 のペアリングに関する情報は失われます。シングルセルシーケンシングでは、α 鎖と β 鎖のペアリングや受容体における構成に関する情報を得ることができます。しかし、シングルセルシーケンシングは、バルクシーケンシングと比べて非常に低スループットであるという特徴があります。

TCR ライブラリの構築で Twist がお役に立てること

Twist は、下記のどちらの戦略にも対応する TCR ライブラリを提供します。

ペア・プール TCR ライブラリ（Figure 1A）

• 元の α 鎖および β 鎖のペアリングを保持することで、ヒット検証を最大化し、TCR レパトアを複製することが可能
• TCR の α 鎖、β 鎖のペアリングを把握できるシングルセルシーケンシングによく適合した選択肢

コンビナトリアル TCR ライブラリ（Figure 1B）

• α 鎖と β 鎖のペアをシャッフルすることで、さらなる多様性を生み出し、同定されているレパトア以外の新しい組み合わせを検討することが可能
• TCR の α 鎖、β 鎖のペアリングを把握できないバルクシーケンシングによく適合した選択肢