Contrôles synthétiques viraux

Les contrôles synthétiques du virus humain de la variole du singe (hMPXV) de Twist sont fondés sur des séquences provenant des clades du bassin du Congo (BC) ou de l’Afrique de l’Ouest (AO) du hMPXV et assurent une couverture de ≥ 80 % du génome viral. Par conséquent, ces contrôles permettent la conception d’analyses personnalisées ciblant des régions du génome pertinentes pour la recherche sur les orthopoxvirus et peuvent être utilisés pour les méthodes de détection basées sur l’amplicon et la capture. Les contrôles hMPXV de Twist ont été validés et sont compatibles avec les procédures de test PCR en temps réel recommandées par le contrôle de prévention des maladies (center for disease control, CDC) pour la détection de la variole du singe. Le contrôle 1 et le contrôle 2 sont composés de fragments 154 et 151 se chevauchant de 1,8 kb, respectivement, qui parcourent le génome à un intervalle de 900 pb. Chaque contrôle est présent en copies et fourni à une concentration d’environ 100 000 copies/uL. La figure de droite montre une relation taxonomique entre les clades AO et BC de hMPXV ainsi que d’autres orthopoxvirus. Veuillez contacter votre représentant commercial local pour plus d’informations.

Remarque : Les contrôles synthétiques Twist du virus humain de la variole du singe (hMPXV) ne sont pas
certifiés ISO-13485

Nom du virus, identifiants Genbank, type de virus et longueur pour chaque virus inclus dans les Twist Respiratory Virus Controls

Ressources associées

• Protocoles CDC pour la variole du singe
• Liste des produits de contrôles des maladies infectieuses synthétiques Twist

Twist Bioscience a créé des contrôles d’ARN synthétique pour plusieurs génomes viraux. Ces variants ont été sélectionnés pour couvrir une gamme étendue de diversité de séquences. Chaque contrôle consiste en six fragments de 5 kb non superposés, générés à partir de fragments de gènes Twist Bioscience puis transcrits en ARNss. Ces contrôles permettent de couvrir plus de 99,9 % des bases du génome viral du SARS-CoV-2. La majorité des contrôles sont fournis dans le format standard qui correspond à 100 μL à une concentration d’environ un million de copies par microlitre. Twist propose également des contrôles au format prêt pour analyse ou encapsulé présentés sous forme de pastilles desséchées. Les contrôles prêts pour l’analyse sont fournis à environ deux millions de copies par tube. Les contrôles encapsulés sont fournis à environ 50 000 copies par tube. Le contrôle synthétique de l’ARN du SARS-CoV-2 Twist Bioscience prêt pour analyse a été développé en partenariat avec le CDC américain et intégré à l’analyse multiplex CDC Influenza SARS-CoV-2 (Flu SC2), qui teste simultanément la grippe A, la grippe B et le SARS-CoV-2. Le contrôle synthétique de l’ARN du SARS-CoV-2 Twist Bioscience prêt pour analyse est maintenant disponible pour les clients extérieurs au CDC. 

Les produits de contrôle encapsulés de Twist offrent une méthode de stockage et de livraison unique pour les contrôles synthétiques ARN du SARS-CoV-2 établis par Twist. Tout comme l'encapsulation des virus par des protéines permet un stockage moléculaire plus stable, les produits Encapsulated Control de Twist s'appuient sur une nouvelle méthode pour sceller une capsule métallique autour d'une pastille desséchée pour améliorer la stabilité des contrôles ARN. Grâce à cette stabilité accrue, ils peuvent être expédiés et stockés à température ambiante, ce qui réduit les coûts et améliore l'accessibilité au niveau mondial. Les contrôles encapsulés sont vendus dans un rack de 16 ou 96 tubes, sont à usage unique et ont une durée de conservation de cinq ans à partir de la date de fabrication.

Contrôles SARS-CoV-2 disponibles

Meilleures pratiques pour l'utilisation des contrôles prêts à l'essai et encapsulés

Pour le stockage et l'utilisation des contrôles prêts pour analyse ou encapsulés SARS-CoV-2, veuillez consulter les documents suivants :

• Document sur le stockage et l'utilisation des contrôles synthétiques prêts pour analyse Twist
• Guide de stockage et de manipulation du contrôle ARN encapsulé du Sars-CoV-2 de Twist

Ce produit n’a pas été approuvé par la FDA, mais il a été autorisé pour une utilisation d’urgence par la FDA dans le cadre d’une EUA par des laboratoires agréés ; ce produit a été autorisé uniquement pour détecter l’acide nucléique du SARS-CoV-2, ainsi que pour identifier et différencier les lignées PANGO du SARS-CoV-2 et identifier les mutations génomiques spécifiques du SARS-CoV-2, et non pour d’autres virus ou agents pathogènes ; l’utilisation d’urgence de ce produit n’est autorisée que pour la durée de la déclaration selon laquelle il existe des circonstances justifiant l’autorisation d’une utilisation d’urgence de diagnostics in vitro pour la détection et/ou le diagnostic de COVID-19 en vertu de la section 564(b)(1) du Federal Food, Drug and Cosmetic Act, 21 U.S.C. § 360bbb-3(b)(1), à moins que la déclaration ne prenne fin ou que l’autorisation ne soit révoquée plus tôt.

Les contrôles de virus respiratoires synthétiques Twist Bioscience portent sur un grand nombre de virus à ARN et à ADN en rapport avec la recherche sur les maladies respiratoires. Ces contrôles sont conformes au contenu du Twist Respiratory Virus Research Panel (PN 103067) et conviennent aux procédés NGS du Twist Fixed Panel ou aux expériences RT-PCR ou qPCR que vous aurez conçues. 

La figure montre un arbre taxonomique des virus inclus dans les Twist Respiratory Virus Controls. Le tableau indique les identifiants GenBank, le type de virus et la longueur de chaque contrôle. Des contrôles viraux supplémentaires peuvent être disponibles pour une synthèse personnalisée. Veuillez contacter votre représentant commercial local pour plus d’informations.
 

Nom du virus, identifiants Genbank, type de virus et longueur pour chaque virus inclus dans les Twist Respiratory Virus Controls. Des contrôles viraux supplémentaires peuvent être disponibles pour une synthèse personnalisée.

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