Identification de la source de l’infection
Identification de la source de l’infection
Identification de la source de l’infection
PRÉSENTATION DONNÉES ANALYSE DES DONNÉES COMMANDES ET SPÉCIFICATIONS RESSOURCES
Présentation

Détection de plusieurs agents pathogènes
viraux à partir
d’un seul échantillon

Les symptômes de l’infection par le SARS-CoV-2 peuvent varier considérablement d’un patient à l’autre. De plus, les symptômes du SARS-CoV-2 se confondent avec ceux d’autres maladies respiratoires. C’est pourquoi il est difficile de déterminer si ces symptômes sont strictement associés au SARS-CoV-2, s’ils sont le résultat d’une ou plusieurs autres maladies respiratoires ou s’ils sont dus à une combinaison des deux. Le Twist Respiratory Virus Research Panel permet de détecter un grand nombre d’agents pathogènes, ce qui permet aux chercheurs non seulement de déterminer avec précision la cause des symptômes d’un patient, mais aussi de rechercher les agents pathogènes les plus susceptibles de coinfecter le SARS-CoV-2.

 

Détection complète des agents pathogènes respiratoires
Détection complète des agents pathogènes respiratoires
Conçu pour cibler plusieurs virus en une seule capture
Ciblage par rapport aux séquences de référence de 29 virus respiratoires humains courants
Détection fiable des co-infections
Détection fiable des co-infections
Distingue les symptômes du COVID-19 de ceux d’autres maladies respiratoires
Détection et caractérisation de plusieurs virus par réaction
Hautement sensible à de faibles charges virales
Hautement sensible à de faibles charges virales
Collecte de données à partir d’échantillons nasopharyngés
Détection de charges dès 100 copies virales
DÉTECTION DES VIRUS RESPIRATOIRES HUMAINS COMMUNS

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est ciblé par rapport aux séquences de référence de 29 virus respiratoires humains courants, notamment :

  • Coronavirus (CoV)
  • Influenza virus
  • Adénovirus
  • Bocavirus (hBoV)
  • Entérovirus
  • Métapneumovirus
  • Parainfluenza (hPIV)
  • Rhinovirus humain (HRV)
  • Morbillivirus de la rougeole (MeV)
  • Virus des oreillons (MuV)
  • Virus de la rubéole
  • Virus respiratoire syncytial (RSV)

Des sondes supplémentaires ont été conçues pour incorporer la diversité de 77 souches supplémentaires de rhinovirus et pour cibler divers génomes représentant chaque épidémie majeure de grippe A et B depuis 2000.

Lire la note d’application

Détection de plusieurs agents pathogènes
viraux à partir
d’un seul échantillon

Les symptômes de l’infection par le SARS-CoV-2 peuvent varier considérablement d’un patient à l’autre. De plus, les symptômes du SARS-CoV-2 se confondent avec ceux d’autres maladies respiratoires. C’est pourquoi il est difficile de déterminer si ces symptômes sont strictement associés au SARS-CoV-2, s’ils sont le résultat d’une ou plusieurs autres maladies respiratoires ou s’ils sont dus à une combinaison des deux. Le Twist Respiratory Virus Research Panel permet de détecter un grand nombre d’agents pathogènes, ce qui permet aux chercheurs non seulement de déterminer avec précision la cause des symptômes d’un patient, mais aussi de rechercher les agents pathogènes les plus susceptibles de coinfecter le SARS-CoV-2.

 

Détection complète des agents pathogènes respiratoires
Détection complète des agents pathogènes respiratoires
Conçu pour cibler plusieurs virus en une seule capture
Ciblage par rapport aux séquences de référence de 29 virus respiratoires humains courants
Détection fiable des co-infections
Détection fiable des co-infections
Distingue les symptômes du COVID-19 de ceux d’autres maladies respiratoires
Détection et caractérisation de plusieurs virus par réaction
Hautement sensible à de faibles charges virales
Hautement sensible à de faibles charges virales
Collecte de données à partir d’échantillons nasopharyngés
Détection de charges dès 100 copies virales
DÉTECTION DES VIRUS RESPIRATOIRES HUMAINS COMMUNS

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est ciblé par rapport aux séquences de référence de 29 virus respiratoires humains courants, notamment :

  • Coronavirus (CoV)
  • Influenza virus
  • Adénovirus
  • Bocavirus (hBoV)
  • Entérovirus
  • Métapneumovirus
  • Parainfluenza (hPIV)
  • Rhinovirus humain (HRV)
  • Morbillivirus de la rougeole (MeV)
  • Virus des oreillons (MuV)
  • Virus de la rubéole
  • Virus respiratoire syncytial (RSV)

Des sondes supplémentaires ont été conçues pour incorporer la diversité de 77 souches supplémentaires de rhinovirus et pour cibler divers génomes représentant chaque épidémie majeure de grippe A et B depuis 2000.

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DONNÉES
Détecter les agents pathogènes respiratoires humains courants avec un seul test

Compilées à partir de la base de données GenBank, les 41 047 sondes de ce panel permettront aux chercheurs de distinguer les symptômes du COVID-19 de ceux d’autres maladies respiratoires, liées ou non à la grippe. Le Twist Respiratory Panel permet l’enrichissement de ces séquences virales pour la NGS haute résolution. Cette méthode conduit à une détection très sensible de seulement 100 copies de matériel viral avec un enrichissement de plus de 5000 fois, même à partir d’échantillons difficiles, et à une couverture de plus de 99,9 % du génome à un facteur 1 ou plus après enrichissement.

 

Arbre taxonomique des contrôles viraux respiratoires NGS
Détection de standards viraux de différentes familles de virus

Chaque contrôle synthétique viral Twist a été introduit dans 50 ng d’ARN porteur humain à 1 000 000 de copies avant la synthèse de l’ADNc. Pour chaque standard, nous indiquons le pourcentage de lectures virales ciblées, l’enrichissement par rapport à l’entrée, la couverture médiane du génome, le pourcentage de bases avec une couverture d’au moins 30x et la longueur de la matrice. Les génomes viraux sont classés par longueur de matrice (de la plus petite à la plus longue) parmi tous les segments du génome. Dans la plupart des cas, nous avons constaté que plus de 70 % des lectures provenaient de génomes viraux dans ces banques, ce qui représente un enrichissement d’au moins 2 500 fois par rapport au contenu de l’entrée.

 Détection de standards viraux de différentes familles de virus
Multiplex pour un débit plus élevé et un coût moindre

Comparaison du pourcentage de lectures virales sur cible capturées au moyen des contrôles synthétiques viraux Twist à différents titres viraux, par le biais d’une réaction d’hybridation multiplex et uniplex. Le premier graphique montre les comparaisons effectuées à l’aide d’une réaction d’hybridation multiplex et uniplex avec un million de copies par banque, tandis que le deuxième graphique montre une comparaison similaire avec 100, 10 000 et 1 000 000 de copies par banque. Chaque contrôle viral a été capturé selon le procédé standard d’enrichissement ciblé de Twist et le Twist Respiratory Virus Research Panel. Ces données démontrent que la capture de 8 plexes donne un enrichissement efficace comparable à celui d’un seul plexe lors de l’utilisation du Twist Respiratory Virus Research Panel.

Multiplexage NGS du contrôle viral respiratoire NGS
Détecter les agents pathogènes respiratoires humains courants avec un seul test

Compilées à partir de la base de données GenBank, les 41 047 sondes de ce panel permettront aux chercheurs de distinguer les symptômes du COVID-19 de ceux d’autres maladies respiratoires, liées ou non à la grippe. Le Twist Respiratory Panel permet l’enrichissement de ces séquences virales pour la NGS haute résolution. Cette méthode conduit à une détection très sensible de seulement 100 copies de matériel viral avec un enrichissement de plus de 5000 fois, même à partir d’échantillons difficiles, et à une couverture de plus de 99,9 % du génome à un facteur 1 ou plus après enrichissement.

 

Arbre taxonomique des contrôles viraux respiratoires NGS
Détection de standards viraux de différentes familles de virus

Chaque contrôle synthétique viral Twist a été introduit dans 50 ng d’ARN porteur humain à 1 000 000 de copies avant la synthèse de l’ADNc. Pour chaque standard, nous indiquons le pourcentage de lectures virales ciblées, l’enrichissement par rapport à l’entrée, la couverture médiane du génome, le pourcentage de bases avec une couverture d’au moins 30x et la longueur de la matrice. Les génomes viraux sont classés par longueur de matrice (de la plus petite à la plus longue) parmi tous les segments du génome. Dans la plupart des cas, nous avons constaté que plus de 70 % des lectures provenaient de génomes viraux dans ces banques, ce qui représente un enrichissement d’au moins 2 500 fois par rapport au contenu de l’entrée.

 Détection de standards viraux de différentes familles de virus
Multiplex pour un débit plus élevé et un coût moindre

Comparaison du pourcentage de lectures virales sur cible capturées au moyen des contrôles synthétiques viraux Twist à différents titres viraux, par le biais d’une réaction d’hybridation multiplex et uniplex. Le premier graphique montre les comparaisons effectuées à l’aide d’une réaction d’hybridation multiplex et uniplex avec un million de copies par banque, tandis que le deuxième graphique montre une comparaison similaire avec 100, 10 000 et 1 000 000 de copies par banque. Chaque contrôle viral a été capturé selon le procédé standard d’enrichissement ciblé de Twist et le Twist Respiratory Virus Research Panel. Ces données démontrent que la capture de 8 plexes donne un enrichissement efficace comparable à celui d’un seul plexe lors de l’utilisation du Twist Respiratory Virus Research Panel.

Multiplexage NGS du contrôle viral respiratoire NGS
Analyse des données
Analyse d’un codex unique

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est livré avec un accès à l’outil One Codex basé sur le cloud. Idéal pour la recherche et les applications cliniques, cet outil peut servir à créer des visuels prêts à être publiés et des rapports imprimables pour les laboratoires préparant des tests développés en laboratoire.

Dans le cadre de l’utilisation du Twist Respiratory Virus Research Panel, la plateforme d’analyse One Codex est accessible à tous les clients. Cette plateforme est idéale pour la recherche et les applications cliniques, y compris la production de visuels prêts à être publiés, de rapports partageables et d’autres outils d’analyse. Lors de l’achat du panel, vous recevrez des instructions de mise en service et des crédits pour l’analyse d’échantillons sur la plateforme One Codex. Pour en savoir plus sur cette solution d’analyse d’échantillons microbiens, consultez le site Un Codex.

Interface utilisateur One Codex
Analyse d’un codex unique

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est livré avec un accès à l’outil One Codex basé sur le cloud. Idéal pour la recherche et les applications cliniques, cet outil peut servir à créer des visuels prêts à être publiés et des rapports imprimables pour les laboratoires préparant des tests développés en laboratoire.

Dans le cadre de l’utilisation du Twist Respiratory Virus Research Panel, la plateforme d’analyse One Codex est accessible à tous les clients. Cette plateforme est idéale pour la recherche et les applications cliniques, y compris la production de visuels prêts à être publiés, de rapports partageables et d’autres outils d’analyse. Lors de l’achat du panel, vous recevrez des instructions de mise en service et des crédits pour l’analyse d’échantillons sur la plateforme One Codex. Pour en savoir plus sur cette solution d’analyse d’échantillons microbiens, consultez le site Un Codex.

Interface utilisateur One Codex
Commandes et spécifications
UGS DE PRODUIT

103066

Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 2 réactions, Kit

103067

Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 12 réactions, Kit

103068

Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 96 réactions, Kit
SPÉCIFICATIONS

Format

ADNds

Taille du panel

41047 sondes

Contenu

Basé sur 29 séquences de référence du virus respiratoire

Conception des bases de données

RefSeq & GenBank

Espace de stockage à

-5 à -30 °C

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est uniquement destiné à la recherche et soumis à des restrictions supplémentaires telles qu’elles sont définies dans les Conditions générales d’approvisionnement de Twist.

UGS DE PRODUIT

103066

Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 2 réactions, Kit

103067

Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 12 réactions, Kit

103068

Twist Respiratory Virus Research Panel associé au logiciel One Codex, 96 réactions, Kit
SPÉCIFICATIONS

Format

ADNds

Taille du panel

41047 sondes

Contenu

Basé sur 29 séquences de référence du virus respiratoire

Conception des bases de données

RefSeq & GenBank

Espace de stockage à

-5 à -30 °C

Le Twist Respiratory Virus Research Panel est uniquement destiné à la recherche et soumis à des restrictions supplémentaires telles qu’elles sont définies dans les Conditions générales d’approvisionnement de Twist.

RESSOURCES