Découverte dans le profilage de méthylation
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Présentation

Le panel du méthylome humain Twist cible 3,98 M sites CpG grâce à 123 Mb de contenu génomique pour cibler les marqueurs de méthylation biologiquement pertinents. Un contenu complet fait de ce panel un choix idéal pour que les chercheurs explorent la fraction de méthylation dans une plage diverse d’applications, des métastases cancéreuses, au développement humain et à la génomique fonctionnelle. 

Le panel est optimisé et son utilisation validée avec le Twist NGS Methylation Detection System pour obtenir un flux de travail de bout en bout complet avec les meilleures performances du secteur. Une efficacité de capture élevée augmente la sensibilité de détection sur l’ensemble de l’empreinte de l’épigénome tout en diminuant les coûts de séquençage. Le panel est idéal pour le criblage des échantillons de la cohorte et la découverte des régions méthylées différentiellement. 

 

Conception et efficacité du flux de travail
Conception et efficacité du flux de travail
Performances optimisées avec un flux de travail de bout en bout
Complexité accrue de la banque
Flexibilité de l’ajout de l’intégration du contenu
Couverture plus large versus microréseaux moyens
Couverture plus large versus microréseaux moyens
-Quatre fois plus de couverture de tous les sites CpG
Plus de couverture des bases d’îlots CpG
Selon les bases de données de référence mises à jour
 Avantage sur les microréseaux
Avantage sur les microréseaux
Appels plus élevés au niveau des régions méthylées différentiellement
Plus de couverture en amont et en aval des sites CpG adjacents
Conception et efficacité du flux de travail

Une solution complète qui produit des lectures de séquençage hautement complexes et uniformes pour l’analyse de méthylation. Le protocole de bout en bout y parvient en combinant un processus de conversion enzymatique innovant, un flux de travail à enrichissement ciblé optimisé et un processus de conception de panel hautement développé.
 

Flux de travail

Le panel du méthylome humain Twist cible 3,98 M sites CpG grâce à 123 Mb de contenu génomique pour cibler les marqueurs de méthylation biologiquement pertinents. Un contenu complet fait de ce panel un choix idéal pour que les chercheurs explorent la fraction de méthylation dans une plage diverse d’applications, des métastases cancéreuses, au développement humain et à la génomique fonctionnelle. 

Le panel est optimisé et son utilisation validée avec le Twist NGS Methylation Detection System pour obtenir un flux de travail de bout en bout complet avec les meilleures performances du secteur. Une efficacité de capture élevée augmente la sensibilité de détection sur l’ensemble de l’empreinte de l’épigénome tout en diminuant les coûts de séquençage. Le panel est idéal pour le criblage des échantillons de la cohorte et la découverte des régions méthylées différentiellement. 

 

Conception et efficacité du flux de travail
Conception et efficacité du flux de travail
Performances optimisées avec un flux de travail de bout en bout
Complexité accrue de la banque
Flexibilité de l’ajout de l’intégration du contenu
Couverture plus large versus microréseaux moyens
Couverture plus large versus microréseaux moyens
-Quatre fois plus de couverture de tous les sites CpG
Plus de couverture des bases d’îlots CpG
Selon les bases de données de référence mises à jour
 Avantage sur les microréseaux
Avantage sur les microréseaux
Appels plus élevés au niveau des régions méthylées différentiellement
Plus de couverture en amont et en aval des sites CpG adjacents
Conception et efficacité du flux de travail

Une solution complète qui produit des lectures de séquençage hautement complexes et uniformes pour l’analyse de méthylation. Le protocole de bout en bout y parvient en combinant un processus de conversion enzymatique innovant, un flux de travail à enrichissement ciblé optimisé et un processus de conception de panel hautement développé.
 

Flux de travail

Données
Couverture plus large versus microréseau moyen

Le méthylome humain Twist contient 3,98 M de sites CpG grâce à 123 Mb de contenu génomique et cible les marqueurs de méthylation biologiquement pertinents. Le panel est hautement ciblé pour capturer et détecter les régions à méthylation CpG les plus courantes, les plus annotées et les plus pertinentes dans le génome. 84% (17 915 988) des îlots CpG du génome sont identifiés grâce à l’enrichissement avec ce panel. 105 288 339 bases supplémentaires de rivages, de plateformes et de hautes mers ultérieurs de CpG et de paires de base sont couvertes.

Couverture plus large versus microréseau moyen
Avantage sur les microréseaux moyens

Un microréseau est conçu avec un contenu statique qui peut empêcher la découverte de nouvelles cibles d’intérêt épigénétiques. Les réseaux actuels sur le marché fournissent également une couverture limitée du méthylome sur l’ensemble de l’épigénome, ce qui laisse une large proportion de sites CpG méthylés non mesurés. L’approche d’enrichissement ciblé du méthylome humain Twist répond à ces limitations avec des panels à capture hybride qui permettent un contenu étendu et une résolution à base unique sur l’ensemble de lecture de la séquence fourni par les plateformes NGS.

Les microréseaux ont des limitations inhérentes aux extrémités de la détection de la méthylation attribuées à un bruit de fond élevé à l’extrémité inférieure et une saturation du signal à l’extrémité supérieure. En raison de la plage dynamique plus élevée fournie par NGS, le panel du méthylome humain Twist peut fournir un appel plus précis des régions méthylées différentiellement (DMR), en particulier aux extrémités inférieure et supérieure de la fraction de méthylation (figure 4). 

 

Avantage sur les microréseaux moyens
Performances

Le panel du méthylome humain Twist est conçu et optimisé en laboratoire humide pour fournir une efficacité de capture hybride précise, sensible et haute performance. Le panel parvient à une profondeur de la couverture de 90 % des bases à une couverture de 30x avec des spécificités de sonde élevées avec des taux de ciblage de 95 %. Le panel obtient également un repliement 80 de 1,54 fournissant une haute uniformité sur l’ensemble de la région cible en diminuant le delta entre les crêtes et les vallées des empilements d’appels de base. La complexité de la banque a été représentée de façon inverse par un taux de duplication < 4 % à une profondeur de séquençage d’une couverture brute de 150x. La mesure de l’efficacité de capture du panel globale fournit un niveau élevé de confiance dans la détection sur l’ensemble de la fraction de méthylation avec des coûts de séquençage minimisés.

 

Performances
Couverture plus large versus microréseau moyen

Le méthylome humain Twist contient 3,98 M de sites CpG grâce à 123 Mb de contenu génomique et cible les marqueurs de méthylation biologiquement pertinents. Le panel est hautement ciblé pour capturer et détecter les régions à méthylation CpG les plus courantes, les plus annotées et les plus pertinentes dans le génome. 84% (17 915 988) des îlots CpG du génome sont identifiés grâce à l’enrichissement avec ce panel. 105 288 339 bases supplémentaires de rivages, de plateformes et de hautes mers ultérieurs de CpG et de paires de base sont couvertes.

Couverture plus large versus microréseau moyen
Avantage sur les microréseaux moyens

Un microréseau est conçu avec un contenu statique qui peut empêcher la découverte de nouvelles cibles d’intérêt épigénétiques. Les réseaux actuels sur le marché fournissent également une couverture limitée du méthylome sur l’ensemble de l’épigénome, ce qui laisse une large proportion de sites CpG méthylés non mesurés. L’approche d’enrichissement ciblé du méthylome humain Twist répond à ces limitations avec des panels à capture hybride qui permettent un contenu étendu et une résolution à base unique sur l’ensemble de lecture de la séquence fourni par les plateformes NGS.

Les microréseaux ont des limitations inhérentes aux extrémités de la détection de la méthylation attribuées à un bruit de fond élevé à l’extrémité inférieure et une saturation du signal à l’extrémité supérieure. En raison de la plage dynamique plus élevée fournie par NGS, le panel du méthylome humain Twist peut fournir un appel plus précis des régions méthylées différentiellement (DMR), en particulier aux extrémités inférieure et supérieure de la fraction de méthylation (figure 4). 

 

Avantage sur les microréseaux moyens
Performances

Le panel du méthylome humain Twist est conçu et optimisé en laboratoire humide pour fournir une efficacité de capture hybride précise, sensible et haute performance. Le panel parvient à une profondeur de la couverture de 90 % des bases à une couverture de 30x avec des spécificités de sonde élevées avec des taux de ciblage de 95 %. Le panel obtient également un repliement 80 de 1,54 fournissant une haute uniformité sur l’ensemble de la région cible en diminuant le delta entre les crêtes et les vallées des empilements d’appels de base. La complexité de la banque a été représentée de façon inverse par un taux de duplication < 4 % à une profondeur de séquençage d’une couverture brute de 150x. La mesure de l’efficacité de capture du panel globale fournit un niveau élevé de confiance dans la détection sur l’ensemble de la fraction de méthylation avec des coûts de séquençage minimisés.

 

Performances
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UGS de produit

105517

Panel du méthylome humain Twist, 2 réactions

105520

Panel du méthylome humain Twist, 12 réactions

105521

Panel du méthylome humain Twist, 96 réactions
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