Nom du virus, identifiants Genbank, type de virus et longueur pour chaque virus inclus dans les Twist Respiratory Virus Controls
Fiable. Précis. Sûr.
Les contrôles synthétiques du virus humain de la mpox (hMPXV) de Twist sont fondés sur des séquences provenant des clades du bassin du Congo (BC) ou de l’Afrique de l’Ouest (AO) du hMPXV, auparavant appelé variole du singe, et assurent une couverture ≥ 80 % du génome viral. Par conséquent, ces contrôles permettent la conception d’analyses personnalisées ciblant des régions du génome pertinentes pour la recherche sur les orthopoxvirus et peuvent être utilisés pour les méthodes de détection basées sur l’amplicon et la capture. Les contrôles hMPXV de Twist ont été validés et sont compatibles avec les procédures de test PCR en temps réel recommandées par le contrôle de prévention des maladies (Center for disease control, CDC) pour la détection de la mpox. Le contrôle 1 et le contrôle 2 sont composés de fragments 154 et 151 se chevauchant de 1,8 kb, respectivement, qui parcourent le génome à un intervalle de 900 pb. Chaque contrôle est présent en copies et fourni à une concentration d’environ 100 000 copies/uL. La figure de droite montre une relation taxonomique entre les clades AO et BC de hMPXV ainsi que d’autres orthopoxvirus. Veuillez contacter votre représentant commercial local pour plus d’informations.
Remarque : Les contrôles synthétiques Twist du virus humain de la mpox (hMPXV) ne sont pas
certifiés ISO-13485
Nom du virus, identifiants Genbank, type de virus et longueur pour chaque virus inclus dans les Twist Respiratory Virus Controls
Panel de séquençage pan-viral
Caractérisation génomique du virus de la mpox chez l’homme au Nigéria
Diversité génomique du virus Mpox du clade I en République démocratique du Congo, 2018 - 2024 : prédominance de la transmission zoonotique
Le séquençage des eaux usées révèle la dynamique communautaire et variante du virome humain collectif
Épidémie humaine prolongée d’une nouvelle lignée du clade I du virus MPXV dans l’est de la République démocratique du Congo
Diversité génomique intra- et inter-hôtes du virus mpox
Utilisation de la sérologie multiplex mpox dans l’identification des cas et les enquêtes sur les épidémies en République démocratique du Congo (RDC)
Contrôles synthétiques
L’utilisation de contrôles positifs dans le contrôle de la qualité
Twist Bioscience a créé des contrôles d’ARN synthétique pour plusieurs génomes viraux. Ces variants ont été sélectionnés pour couvrir une gamme étendue de diversité de séquences. Chaque contrôle consiste en six fragments de 5 kb non superposés, générés à partir de fragments de gènes Twist Bioscience puis transcrits en ARNss. Ces contrôles permettent de couvrir plus de 99,9 % des bases du génome viral du SARS-CoV-2. La majorité des contrôles sont fournis dans le format standard qui correspond à 100 μL à une concentration d’environ un million de copies par microlitre. Twist propose également des contrôles au format prêt pour analyse ou encapsulé présentés sous forme de pastilles desséchées. Les contrôles prêts pour l’analyse sont fournis à environ deux millions de copies par tube. The Encapsulated Controls are supplied at approximately 50,000 copies per tube. Le contrôle synthétique de l’ARN du SARS-CoV-2 Twist Bioscience prêt pour analyse a été développé en partenariat avec le CDC américain et intégré à l’analyse multiplex CDC Influenza SARS-CoV-2 (Flu SC2), qui teste simultanément la grippe A, la grippe B et le SARS-CoV-2. Le contrôle synthétique de l’ARN du SARS-CoV-2 Twist Bioscience prêt pour analyse est maintenant disponible pour les clients extérieurs au CDC.
Les produits de contrôle encapsulés de Twist offrent une méthode de stockage et de livraison unique pour les contrôles synthétiques ARN du SARS-CoV-2 établis par Twist. Tout comme l'encapsulation des virus par des protéines permet un stockage moléculaire plus stable, les produits Encapsulated Control de Twist s'appuient sur une nouvelle méthode pour sceller une capsule métallique autour d'une pastille desséchée pour améliorer la stabilité des contrôles ARN. Grâce à cette stabilité accrue, ils peuvent être expédiés et stockés à température ambiante, ce qui réduit les coûts et améliore l'accessibilité au niveau mondial. The Encapsulated Controls are sold in a rack of 16 or 96 tubes, are single use, and have a 5-year shelf life from the date of manufacture.
Pour le stockage et l'utilisation des contrôles prêts pour analyse ou encapsulés SARS-CoV-2, veuillez consulter les documents suivants :
This product has not been FDA cleared or approved, but has been authorized for emergency use by FDA under an EUA for use by authorized laboratories; This product has been authorized only for the detection of nucleic acid from SARS-CoV-2, along with the identification and differentiation of SARS-CoV-2 PANGO lineages and the identification of specific SARS-CoV-2 genomic mutations, not for any other viruses or pathogens; and, the emergency use of this product is only authorized for the duration of the declaration that circumstances exist justifying the authorization of emergency use of in vitro diagnostics for detection and/or diagnosis of COVID-19 under Section 564(b)(1) of the Federal Food, Drug and Cosmetic Act, 21 U.S.C. § 360bbb-3(b)(1), unless the declaration is terminated or authorization is revoked sooner.
| PART # | CONTRÔLE | GenBank/GISAID ID | NOM DU GISAID |
|---|---|---|---|
| 102019 | Contrôle 1 | MT007544.1 | Australia/VIC01/2020 |
| 102024 | Contrôle 2 | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 103925 | Contrôles prêts pour analyse 2 | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 104422 | Contrôle encapsulé 2 (16) | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 104426 | Contrôle encapsulé 2 (96) | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 102860 | Contrôle 3 | LC528232.1 | Japan/Hu_DP_Kng_19-020/2020 |
| 102862 | Contrôle 4 | MT106054.1 | USA/TX1/2020 |
| 102917 | Contrôle 5 | MT188340 | USA/MN2-MDH2/2020 |
| 102918 | Contrôle 6 | MT118835 | USA/CA9/2020 |
| 103087 | Contrôle 7 | EPI_ISL_418227 | France/HF2393/2020 |
| 103511 | Contrôle 8 | MT066176 | Taiwan/NTU02/2020 |
| 103512 | Contrôle 9 | MT152824 | USA/WA2/2020 |
| 103513 | Contrôle 10 | EPI_ISL_414648 | USA/CA-PC101P/2020 |
| 103514 | Contrôle 11 | EPI_ISL_417739 | Iceland/5/2020 |
| 103515 | Contrôle 12 | EPI_ISL_420244 | England/SHEF-C05B2/2020 |
| 103533 | Contrôle 13 | EPI_ISL_421184 | Belgium/ULG-10004/2020 |
| 103907 | Contrôle 14 Alpha |
EPI_ISL_710528 | England/205041766/2020 |
| 103926 | Contrôle prêt pour l’analyse 14 Alpha (B.1.1.7) |
EPI_ISL_710528 | England/205041766/2020 |
| 103909 | Contrôle 15 Alpha |
EPI_ISL_601443 | England/MILK-9E05B3/2020 |
| 103927 |
Contrôle prêt pour l’analyse 15 |
EPI_ISL_601443 | England/MILK-9E05B3/2020 |
| 104043 | Contrôle 16 Beta (B.1.351) |
EPI_ISL_678597 | South Africa/KRISP-EC-K005299/2020 |
| 104044 | Contrôle 17 Gamma (P.1) |
EPI_ISL_792683 | Japon (Brésil) /IC-0564/2021 |
| 104338 |
Contrôle 18 |
EPI_ISL_1662307 | Inde/CT-ILSGS00361/2021 |
| 104529 |
Contrôle 19 |
EPI_ISL_1300881 | USA/NY-MSHSPSP-PV24650/2020 |
| 104530 | Contrôle 20 (B.1.427) | EPI_ISL_730092 | USA/CA-ALSR-4704/2020 |
| 104531 |
Contrôle 21 |
EPI_ISL_672365 | USA/CA-CZB-12943/2020 |
| 104532 | Contrôle 22 (B.1.1.519) | EPI_ISL_933685 | Mexico/CMX-InDRE_208/2021 |
|
104533 |
Contrôle 23 Delta (B.1.617.2) |
EPI_ISL_1544014 | Inde/MH-NCCS-P1162000182735/2021 |
| 104534 | Contrôle 24 (B.1.617.3) |
EPI_ISL_1939891 | Inde/MH-SEQ-221_S66_R1_001/2021 |
| 104538 |
Contrôle 28 |
EPI_ISL_2695467 | Portugal/PT9543/2021 |
| 104423 | Contrôle encapsulé 28 (16) Delta (AY.1) | EPI_ISL_2695467 | Portugal/PT9543/2021 |
| 104427 | Contrôle encapsulé 28 (96) Delta (AY.1) | EPI_ISL_2695467 | Portugal/PT9543/2021 |
| 104539 |
Contrôle 29 |
EPI_ISL_2693246 | USA/WA-CDC-UW21061750277/2021 |
| 105204 | Contrôle 48 (B.1.1.529/BA.1) | EPI_ISL_6841980 | Hong Kong/HKU-211129-001/2021 |
| 104424 | Contrôle encapsulé 48 (16) (B.1.1.529/BA.1) |
EPI_ISL_6841980 | Hong Kong/HKU-211129-001/2021 |
| 104428 | Contrôle encapsulé 48 (96) (B.1.1.529/BA.1) |
EPI_ISL_6841980 |
Hong Kong/HKU-211129-001/2021 |
| 105345 | Contrôle 50 (B.1.1.529+BA.2) | EPI_ISL_7190366 | Australia/QLD2568/2021 |
| 105346 | Contrôle 51 (B.1.1.529+BA.2) | EPI_ISL_7718520 | England/MILK-2DF642C/2021 |
| 105865 | Contrôle 62 (B.2.12.1) | EPI_ISL_12248637.1 | Denmark/DCGC-493190/2022 |
| 105857 | Contrôle 63 (B.2.12.1) |
EPI_ISL_12303256.1 |
USA/NY-CDC-LC0579415/2022 |
| 106196 | Contrôle 64 (BA.5) | EPI_ISL_12516495 | hCoV-19/England/LSPA-3DC1269/2022 |
| 106197 | Contrôle 65 (BA.5) | EPI_ISL_12620611 | hCoV-19/USA/TN-ASC-210769476/2022 |
| 106198 | Contrôle 66 (BA.4) | EPI_ISL_12454576 | hCoV-19/USA/TX-HMH-M-96682/2022 |
| 106199 | Contrôle 67 (BA.4) | EPI_ISL_12605687 | hCoV-19/USA/CA-CDC-QDX36065390/202 |
|
106929 |
Contrôle 70 |
EPI_ISL_14829147 |
hCoV-19/USA/MI-CDC-QDX40579621/2022 |
|
106930 |
Contrôle 71 |
EPI_ISL_15381979 |
hCoV-19/Australia/SA464919/2022 |
Les contrôles de virus respiratoires synthétiques Twist Bioscience portent sur un grand nombre de virus à ARN et à ADN en rapport avec la recherche sur les maladies respiratoires. Ces contrôles sont conformes au contenu du Twist Respiratory Virus Research Panel (PN 103067) et conviennent aux procédés NGS du Twist Fixed Panel ou aux expériences RT-PCR ou qPCR que vous aurez conçues.
Cette figure montre un arbre taxonomique sélectionné des virus inclus dans les Twist Respiratory Virus Controls. Le tableau indique les identifiants GenBank, le type de virus et la longueur de chaque contrôle. Des contrôles viraux supplémentaires peuvent être disponibles pour une synthèse personnalisée. Veuillez contacter votre représentant commercial local pour plus d’informations.
Nom du virus identification Genbank, type de virus et longueurs
Virus name Genbank IDs, virus type, and length for each virus included in the Twist Respiratory Virus Controls. Additional viral controls may be available for custom synthesis.
Pour en savoir plus, contactez votre représentant commercial local.
| Numéro de pièce | Nom | Obtention | Type de virus | Longueur (bases) |
| 103001 | Twist Synthetic Influenza H1N1 (2009) RNA control | NC_026431, NC_026432, NC_026433, NC_026434, NC_026435, NC_026436, NC_026437, NC_026438 |
ARNss (sens -) | 13158 |
| 103002 | Température : Twist Synthetic Influenza H3N2 RNA control | NC_007366, NC_007367, NC_007368, NC_007369, NC_007370, NC_007371, NC_007372, NC_007373 |
ARNss (sens -) | 14452 |
| 103003 | Twist Synthetic Influenza B RNA control | NC_002204, NC_002205, NC_002206, NC_002207, NC_002208, NC_002209, NC_002210, NC_002211 |
ARNss (sens -) | 14452 |
| 103004 | Twist Synthetic Human bocavirus 1 DNA control | MG953830.1 | ADNss | 5164 |
| 103005 | Contrôle synthétique de 68 ARN de l’enterovirus humain Twist | NC_038308.1 | ARNss (sens +) | 7367 |
| 103006 | Twist Synthetic Human rhinovirus 89 RNA control | NC_001617.1 | ARNss (sens +) | 7152 |
| 103007 | Twist Synthetic Mumps virus RNA control | NC_002200.1 | ARNss (sens -) | 15384 |
| 103008 | Twist Synthetic Human parainfluenza virus 1 RNA control | NC_003461.1 | ARNss (sens -) | 15600 |
| 103009 | Twist Synthetic Measles virus RNA control | NC_001498.1 | ARNss (sens -) | 15894 |
| 103010 | Twist Synthetic Human parainfluenza virus 4 RNA control | NC_021928.1 | ARNss (sens -) | 17052 |
| 103011 | Twist Synthetic Human coronavirus 229E RNA control | NC_002645.1 | ARNss (sens +) | 27317 |
| 103012 | Twist Synthetic Human coronavirus NL63 RNA control | NC_005831.2 | ARNss (sens +) | 27553 |
| 103013 | Twist Synthetic Human coronavirus OC43 RNA control | NC_006213.1 | ARNss (sens +) | 30741 |
| 103730 | Twist Respiratory Virus Controls (13 unités) | S.O. | S.O. | S.O. |
| 109012 | Twist Synthetic Influenza A (H5N1) RNA Control | OR051630.1, OR051629.1 | ARNss (sens -) | Segment de HA : 1 695, segment de NA : 1 410 |
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