Performance exceptionnelle quelle que soit l’échelle
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PRÉSENTATION POOLS D’OLIGONUCLÉOTIDES NOUVEAUX POOLS D’OLIGONUCLÉOTIDES CLONÉS APPLICATIONS RESSOURCES
Présentation

Performance quelle que soit l’échelle

Notre plateforme de synthèse d’ADN révolutionnaire, basée sur le silicone, est capable de produire plus d’un million d’oligos d’ADNss uniques en une seule fois. Chaque puce contient des milliers de clusters distincts, chacun contenant 121 surfaces adressables individuellement capables de synthétiser une séquence d’oligonucléotide unique. Une représentation de la technologie des puces en silicone se trouve ci-dessous.

En raison de l’ampleur de la capacité de synthèse d’ADN sur la puce, il n’y a pratiquement aucune limite au nombre d’oligonucléotides uniques qui peuvent être assemblés dans un pool. Ne limitez pas le résultat de votre application, commandez des pools d’oligonucléotides spécifiquement adaptés à votre expérience. 

Performance quelle que soit l’échelle

 

Plus d’espace pour l’innovation
 

Ne soyez pas limité par la longueur. Encodez les éléments et les séquences dont vous avez besoin, y compris les promoteurs, les exhausteurs, les guides et les sondes, le tout dans une architecture étendue. Avec des longueurs d’oligo allant jusqu’à 300 nt, il est possible de coder plusieurs éléments dans une seule structure, ce qui vous permet d’en faire plus avec chaque oligonucléotide.

 

Plus d’espace pour l’innovation

 


Criblage réussi en une seule fois
 

L’uniformité inégalée du pool sans biais permet d’obtenir plus de cibles uniques par crible. Cela signifie que moins d’efforts sont nécessaires pour obtenir la couverture de données dont vous avez besoin, ce qui vous fait gagner du temps et de l’argent.

Criblage réussi en une seule fois

 


Soyez sûr(e) de vos données
 

Grâce à la précision et à l’uniformité des pools d’oligonucléotides Twist Bioscience, vous pouvez être sûr(e) de la qualité de vos résultats expérimentaux. Ne perdez pas un seul élément de données en raison d’erreurs de synthèse ou du manque d’efficacité. Assurez la meilleure représentation des oligonucléotides et un faible taux d’erreur pour les oligonucléotides de toute longueur jusqu’à 300 nt, et les pools de toute taille. Optimisez ces pools d’oligo de qualité exceptionnelle à l’échelle et à la longueur précises requises pour votre application.

 

Des données sûres

DES QUESTIONS ?

Dites-nous ce sur quoi vous souhaitez obtenir plus d’informations. Nous sommes là pour vous aider !

Nous contacter

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Notre plateforme de synthèse d’ADN révolutionnaire, basée sur le silicone, est capable de produire plus d’un million d’oligos d’ADNss uniques en une seule fois. Chaque puce contient des milliers de clusters distincts, chacun contenant 121 surfaces adressables individuellement capables de synthétiser une séquence d’oligonucléotide unique. Une représentation de la technologie des puces en silicone se trouve ci-dessous.

En raison de l’ampleur de la capacité de synthèse d’ADN sur la puce, il n’y a pratiquement aucune limite au nombre d’oligonucléotides uniques qui peuvent être assemblés dans un pool. Ne limitez pas le résultat de votre application, commandez des pools d’oligonucléotides spécifiquement adaptés à votre expérience. 

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Ne soyez pas limité par la longueur. Encodez les éléments et les séquences dont vous avez besoin, y compris les promoteurs, les exhausteurs, les guides et les sondes, le tout dans une architecture étendue. Avec des longueurs d’oligo allant jusqu’à 300 nt, il est possible de coder plusieurs éléments dans une seule structure, ce qui vous permet d’en faire plus avec chaque oligonucléotide.

 

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Criblage réussi en une seule fois
 

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Grâce à la précision et à l’uniformité des pools d’oligonucléotides Twist Bioscience, vous pouvez être sûr(e) de la qualité de vos résultats expérimentaux. Ne perdez pas un seul élément de données en raison d’erreurs de synthèse ou du manque d’efficacité. Assurez la meilleure représentation des oligonucléotides et un faible taux d’erreur pour les oligonucléotides de toute longueur jusqu’à 300 nt, et les pools de toute taille. Optimisez ces pools d’oligo de qualité exceptionnelle à l’échelle et à la longueur précises requises pour votre application.

 

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POOLS D’OLIGONUCLÉOTIDES

Pools d’oligonucléotides
 

Les Twist Oligo Pools sont des ensembles très divers d’oligonucléotides à simple brin synthétisés à l’aide de notre technologie d’écriture de l’ADN sur silicone. Notre plateforme de synthèse permet la production massivement parallèle de centaines de milliers d’oligonucléotides précis et de haute qualité par cycle, ce qui permet de générer des pools d’oligonucléotides complexes et diversifiés pour des applications telles que le criblage CRISPR.

Comment cela fonctionne-t-il ? 
 

Vous nous fournissez vos séquences d’oligonucléotides et nous synthétisons les banques de pools d’oligonucléotides conçus par l’utilisateur, ce qui vous permet de consacrer votre temps à l’expérimentation et à la découverte. 

Banques

Synthèse d’oligonucléotides extrêmement uniforme
 

Les données de contrôle de qualité NGS provenant d’un pool d’oligonucléotides standard contenant 23 000 oligonucléotides 90-mer montrent l’uniformité du pool à une couverture de lecture de 300x. Le tableau correspondant indique les paramètres d’uniformité pour ce pool. Les oligonucléotides Twist Bioscience sont synthétisés sans biais avec une grande uniformité et une représentation complète des oligonucléotides.

Comptage de lectures d’oligonucléotides

Analyse de séquençage des pool d’oligonucléotides
 

L’analyse de séquençage des pools d’oligonucléotides générés par Twist Bioscience et d’un concurrent de type matrice démontre que les pools d’oligonucléotide Twist Bioscience contiennent 100 % des séquences escomptées et un pourcentage plus élevé de séquences correctes que le pool du concurrent.

Analyse


Spécifications
 

Longueur oligonucléotide Jusqu’à 300 nt
Taille du pool d'oligonucléotides Aucune limite sur la taille du pool d’oligonucléotides
Rendement >0,2 fmol de chaque oligonucléotide
Uniformité >90 % oligonucléotides représentés dans un écart < 2,0x de la moyenne
Taux d’erreur Jusqu’à 1 : 3000
Délais d’exécution À partir de 5 jours ouvrables
Prix Prix parmi les meilleurs du secteur

 

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Pools d’oligonucléotides
 

Les Twist Oligo Pools sont des ensembles très divers d’oligonucléotides à simple brin synthétisés à l’aide de notre technologie d’écriture de l’ADN sur silicone. Notre plateforme de synthèse permet la production massivement parallèle de centaines de milliers d’oligonucléotides précis et de haute qualité par cycle, ce qui permet de générer des pools d’oligonucléotides complexes et diversifiés pour des applications telles que le criblage CRISPR.

Comment cela fonctionne-t-il ? 
 

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Banques

Synthèse d’oligonucléotides extrêmement uniforme
 

Les données de contrôle de qualité NGS provenant d’un pool d’oligonucléotides standard contenant 23 000 oligonucléotides 90-mer montrent l’uniformité du pool à une couverture de lecture de 300x. Le tableau correspondant indique les paramètres d’uniformité pour ce pool. Les oligonucléotides Twist Bioscience sont synthétisés sans biais avec une grande uniformité et une représentation complète des oligonucléotides.

Comptage de lectures d’oligonucléotides

Analyse de séquençage des pool d’oligonucléotides
 

L’analyse de séquençage des pools d’oligonucléotides générés par Twist Bioscience et d’un concurrent de type matrice démontre que les pools d’oligonucléotide Twist Bioscience contiennent 100 % des séquences escomptées et un pourcentage plus élevé de séquences correctes que le pool du concurrent.

Analyse


Spécifications
 

Longueur oligonucléotide Jusqu’à 300 nt
Taille du pool d'oligonucléotides Aucune limite sur la taille du pool d’oligonucléotides
Rendement >0,2 fmol de chaque oligonucléotide
Uniformité >90 % oligonucléotides représentés dans un écart < 2,0x de la moyenne
Taux d’erreur Jusqu’à 1 : 3000
Délais d’exécution À partir de 5 jours ouvrables
Prix Prix parmi les meilleurs du secteur

 

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Nouveaux pools d’oligonucléotides clonés

Nouveaux pools d’oligonucléotides clonés

La qualité des pools d’oligonucléotides est la base d’une expérience réussie. Les erreurs de synthèse ou de clonage peuvent facilement fausser la qualité des pools d’oligonucléotides, entraînant une sur- ou une sous-représentation des séquences souhaitées. Twist propose désormais un processus de clonage optimisé qui vous permet d’éviter davantage les difficultés liées à l’essai des conditions d’amplification de la PCR, à la sélection des polymérases et des paires d’amorces appropriées, ainsi qu’à la conception d’un flux de travail de clonage. Évitez les problèmes et laissez Twist synthétiser et cloner des pools d’oligonucléotides pour vous.  

 

Comment cela fonctionne-t-il ? 

Vous nous fournissez vos séquences d’oligonucléotides et nous synthétisons et clonons les banques de pools d’oligonucléotides conçus par l’utilisateur, ce qui vous permet de consacrer votre temps à l’expérimentation et à la découverte. 

clone

 

 

Uniformité des pools d’oligonucléotides linéaires et clonés

 

uniformité

Un pool d’oligonucléotides composé de 15 154 oligonucléotides a été synthétisé et amplifié pour évaluer l’uniformité du pool, ainsi que le pourcentage d’oligonucléotides ciblés et le pourcentage d’abandons. Le pool amplifié a ensuite été cloné dans un vecteur personnalisé en utilisant les stratégies de clonage internes de Twist. Une comparaison des données NGS du pool avant et après clonage montre que le pourcentage d’oligonucléotides ciblés reste >96 %, sans aucun abandon et avec une différence de 0,1 entre les deux ratios 90e/10e percentile.
 

Pools d’oligonucléotides clonés de haute qualité 

 

Cloné

La figure 1 A et la figure 1 B résument les données recueillies à partir de pools d’oligonucléotides linéaires et clonés composés de 15154 oligonucléotides. Ces graphiques montrent le contenu GC de chaque oligonucléotide (axe x) et le nombre normalisé pour cet oligonucléotide particulier (axe y). Cela montre qu’il y a peu de biais dans les oligonucléotides basés sur la teneur en GC, et que le pool d’oligonucléotides est uniformément distribué en nombre, avec peu d’abandons. Le 95e/5e percentile indique que 90 % des oligonucléotides se situent dans un intervalle de x multiplicateurs de la moyenne. Pour les pools d’oligonucléotides linéaires (figure 1A), 90 % se situent dans une fourchette de 2x la moyenne. Après le clonage (figure 1B), 90 % restent dans les 2x la moyenne, ce qui montre que la qualité et l’uniformité du pool d’oligonucléotides sont maintenues tout au long du processus de clonage de Twist.


Spécifications 

 

Longueur oligonucléotide Jusqu’à 100 nt
Rendement À partir de 50 ug
Uniformité La synthèse uniforme assure une excellente représentation
des oligonucléotides avec >95 % des oligonucléotides cibles représentés.
Délais d’exécution 6 à 8 semaines pour les nouveaux vecteurs, et 4 à 6 semaines pour les vecteurs embarqués
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La qualité des pools d’oligonucléotides est la base d’une expérience réussie. Les erreurs de synthèse ou de clonage peuvent facilement fausser la qualité des pools d’oligonucléotides, entraînant une sur- ou une sous-représentation des séquences souhaitées. Twist propose désormais un processus de clonage optimisé qui vous permet d’éviter davantage les difficultés liées à l’essai des conditions d’amplification de la PCR, à la sélection des polymérases et des paires d’amorces appropriées, ainsi qu’à la conception d’un flux de travail de clonage. Évitez les problèmes et laissez Twist synthétiser et cloner des pools d’oligonucléotides pour vous.  

 

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clone

 

 

Uniformité des pools d’oligonucléotides linéaires et clonés

 

uniformité

Un pool d’oligonucléotides composé de 15 154 oligonucléotides a été synthétisé et amplifié pour évaluer l’uniformité du pool, ainsi que le pourcentage d’oligonucléotides ciblés et le pourcentage d’abandons. Le pool amplifié a ensuite été cloné dans un vecteur personnalisé en utilisant les stratégies de clonage internes de Twist. Une comparaison des données NGS du pool avant et après clonage montre que le pourcentage d’oligonucléotides ciblés reste >96 %, sans aucun abandon et avec une différence de 0,1 entre les deux ratios 90e/10e percentile.
 

Pools d’oligonucléotides clonés de haute qualité 

 

Cloné

La figure 1 A et la figure 1 B résument les données recueillies à partir de pools d’oligonucléotides linéaires et clonés composés de 15154 oligonucléotides. Ces graphiques montrent le contenu GC de chaque oligonucléotide (axe x) et le nombre normalisé pour cet oligonucléotide particulier (axe y). Cela montre qu’il y a peu de biais dans les oligonucléotides basés sur la teneur en GC, et que le pool d’oligonucléotides est uniformément distribué en nombre, avec peu d’abandons. Le 95e/5e percentile indique que 90 % des oligonucléotides se situent dans un intervalle de x multiplicateurs de la moyenne. Pour les pools d’oligonucléotides linéaires (figure 1A), 90 % se situent dans une fourchette de 2x la moyenne. Après le clonage (figure 1B), 90 % restent dans les 2x la moyenne, ce qui montre que la qualité et l’uniformité du pool d’oligonucléotides sont maintenues tout au long du processus de clonage de Twist.


Spécifications 

 

Longueur oligonucléotide Jusqu’à 100 nt
Rendement À partir de 50 ug
Uniformité La synthèse uniforme assure une excellente représentation
des oligonucléotides avec >95 % des oligonucléotides cibles représentés.
Délais d’exécution 6 à 8 semaines pour les nouveaux vecteurs, et 4 à 6 semaines pour les vecteurs embarqués
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Applications

Banques d’ARN guides pour les cribles CRISPR

Les cribles CRISPR comportent l’élimination, l’interférence ou la modulation précises et à haut débit de l’activité des gènes, ce qui permet de révéler des interactions génotype-phénotype complexes. Les pool d’oligonucléotides sont conçus pour coder plusieurs molécules d’ARN guide par gène.  

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Un contrôle total sur la conception de la banque de guides, évitant les guides non désirés, le gaspillage de séquençage et les ratios limités de guides par gène.
  • L’association d’enzymes Cas haute fidélité et d’une synthèse très précise pour des cribles haute fidélité avec des effets hors cible minimaux.
  • Des pools incroyablement uniformes et sans biais permettent d’obtenir un rapport signal/bruit amplifié pour une détection maximale des résultats, ce qui réduit les coûts en aval.
  • Les oligonucléotides allant jusqu’à 300 nt libèrent de l’espace pour des éléments expérimentaux supplémentaires. Il est facile d’ajouter des guides multiples par oligonucléotide, des homologies génomiques ou des promoteurs minimaux.

Criblages CRISPR de nouvelle génération basés sur la transcriptomique en cellule unique

Regardez notre webinaire : Criblages CRISPR de nouvelle génération basés sur la transcriptomique en cellule unique

Banques de données génomiques relatives aux puces à sonde recouvrantes

Les banques de puces permettent une étude complète de la fonctionnalité génomique. Les pools d’oligonucléotides peuvent coder des jeux ordonnés de peptides, des séquences codant des ARNm ou des fragments de génome.

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Le « tiling » détermine les régions génomiques d’intérêt. Réduire le bruit expérimental en excluant les séquences indésirables à l’étape de la conception.
  • Les séquences complexes, répétitives ou palindromiques qui ne peuvent généralement pas être synthétisées sous forme de gènes peuvent être codées dans des oligonucléotides.
  • Les structures peptidiques plus importantes ou les architectures de génomes peuvent être codées dans des oligos de 300 nt de long.
  • La synthèse uniforme minimise le suréchantillonnage nécessaire à un criblage complet.

Identification des facteurs de virulence du coronavirus pour le développement de vaccins à ARN

Lisez notre article : Identification des facteurs de virulence du coronavirus pour le développement de vaccins à ARN avec la méthode fate-seq basée sur le pool d’oligonucléotides de Twist Bioscience.

Cribles de contrôle génétique à haut débit

La compréhension des éléments génétiques contrôlant l’expression et la régulation des gènes trouve une large application dans la biologie de synthèse et le développement de traitements potentiels des maladies. Les pool d’oligonucléotides permettent de réaliser des cribles à haut débit du contrôle génétique, notamment le profilage de l’expression génétique et les applications basées sur les rapporteurs. 

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Des pools de haute qualité permettent de vérifier la fonctionnalité de chaque base.
  • Une grande uniformité signifie que vous criblerez moins pour trouver vos réponses.
  • Des pools de 300 nt vous donnent la possibilité d’ajouter plusieurs éléments ou régions d’homologie.

Criblage épitranscriptomique sur TechNetworks

Regardez notre webinaire : Criblage épitranscriptomique sur TechNetworks

Hybridation in situ en fluorescence

L’hybridation in situ par fluorescence (FISH) permet de visualiser directement l’abondance et l’organisation spatiale des acides nucléiques dans les échantillons biologiques. Les pool d’oligonucléotides peuvent coder des sondes qui, lorsqu’elles sont liées à des marqueurs fluorescents, permettent une visualisation programmable et réglable d’un grand nombre de cibles.

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Développement rapide de sondes FISH
  • Le contrôle de la séquence permet un ciblage efficace
  • Des oligonucléotides plus longs permettent un ciblage plus spécifique

Production rapide et efficace de sondes FISH à l’aide de pools d’oligonucléotides, avec Nicola Crosetto

Regardez notre webinaire : Production rapide et efficace de sondes FISH à l’aide de pools d’oligonucléotides, avec Nicola Crosetto

Banques d’ARN guides pour les cribles CRISPR

Les cribles CRISPR comportent l’élimination, l’interférence ou la modulation précises et à haut débit de l’activité des gènes, ce qui permet de révéler des interactions génotype-phénotype complexes. Les pool d’oligonucléotides sont conçus pour coder plusieurs molécules d’ARN guide par gène.  

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Un contrôle total sur la conception de la banque de guides, évitant les guides non désirés, le gaspillage de séquençage et les ratios limités de guides par gène.
  • L’association d’enzymes Cas haute fidélité et d’une synthèse très précise pour des cribles haute fidélité avec des effets hors cible minimaux.
  • Des pools incroyablement uniformes et sans biais permettent d’obtenir un rapport signal/bruit amplifié pour une détection maximale des résultats, ce qui réduit les coûts en aval.
  • Les oligonucléotides allant jusqu’à 300 nt libèrent de l’espace pour des éléments expérimentaux supplémentaires. Il est facile d’ajouter des guides multiples par oligonucléotide, des homologies génomiques ou des promoteurs minimaux.

Criblages CRISPR de nouvelle génération basés sur la transcriptomique en cellule unique

Regardez notre webinaire : Criblages CRISPR de nouvelle génération basés sur la transcriptomique en cellule unique

Banques de données génomiques relatives aux puces à sonde recouvrantes

Les banques de puces permettent une étude complète de la fonctionnalité génomique. Les pools d’oligonucléotides peuvent coder des jeux ordonnés de peptides, des séquences codant des ARNm ou des fragments de génome.

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Le « tiling » détermine les régions génomiques d’intérêt. Réduire le bruit expérimental en excluant les séquences indésirables à l’étape de la conception.
  • Les séquences complexes, répétitives ou palindromiques qui ne peuvent généralement pas être synthétisées sous forme de gènes peuvent être codées dans des oligonucléotides.
  • Les structures peptidiques plus importantes ou les architectures de génomes peuvent être codées dans des oligos de 300 nt de long.
  • La synthèse uniforme minimise le suréchantillonnage nécessaire à un criblage complet.

Identification des facteurs de virulence du coronavirus pour le développement de vaccins à ARN

Lisez notre article : Identification des facteurs de virulence du coronavirus pour le développement de vaccins à ARN avec la méthode fate-seq basée sur le pool d’oligonucléotides de Twist Bioscience.

Cribles de contrôle génétique à haut débit

La compréhension des éléments génétiques contrôlant l’expression et la régulation des gènes trouve une large application dans la biologie de synthèse et le développement de traitements potentiels des maladies. Les pool d’oligonucléotides permettent de réaliser des cribles à haut débit du contrôle génétique, notamment le profilage de l’expression génétique et les applications basées sur les rapporteurs. 

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Des pools de haute qualité permettent de vérifier la fonctionnalité de chaque base.
  • Une grande uniformité signifie que vous criblerez moins pour trouver vos réponses.
  • Des pools de 300 nt vous donnent la possibilité d’ajouter plusieurs éléments ou régions d’homologie.

Criblage épitranscriptomique sur TechNetworks

Regardez notre webinaire : Criblage épitranscriptomique sur TechNetworks

Hybridation in situ en fluorescence

L’hybridation in situ par fluorescence (FISH) permet de visualiser directement l’abondance et l’organisation spatiale des acides nucléiques dans les échantillons biologiques. Les pool d’oligonucléotides peuvent coder des sondes qui, lorsqu’elles sont liées à des marqueurs fluorescents, permettent une visualisation programmable et réglable d’un grand nombre de cibles.

Les avantages du produit sont les suivants :

  • Développement rapide de sondes FISH
  • Le contrôle de la séquence permet un ciblage efficace
  • Des oligonucléotides plus longs permettent un ciblage plus spécifique

Production rapide et efficace de sondes FISH à l’aide de pools d’oligonucléotides, avec Nicola Crosetto

Regardez notre webinaire : Production rapide et efficace de sondes FISH à l’aide de pools d’oligonucléotides, avec Nicola Crosetto

Ressources
Ce que les scientifiques ont à dire
« 
Les pools d’oligonucléotides d’ADNss de Twist sont bien adaptés à la fabrication de structures d’ARN groupées en raison de leur grande uniformité, de leur faible taux d’erreur et de leurs longueurs allant jusqu’à 300 nt. Ces caractéristiques permettent de cribler les interactions ARN-petites molécules avec une précision et une efficacité élevées.
Kaoru R. Komatsu
Directeur délégué et Directeur technique • xFOREST Therapeutics Co., Ltd
« 
Nous avons trouvé dans les pool d’oligonucléotides de Twist Bioscience un moyen rapide, pratique et flexible de synthétiser des banques CRISPR personnalisées de haute qualité pour nos recherches.
Stephen Pettit
Chercheur • Institute of Cancer Research, R-U
« 
Nous travaillons sur des analyses de rapporteurs massivement parallèles (massively parallel reporter assays, MPRA) axées sur l’identification des fonctions de régulation des gènes par des substitutions d’une seule base, de sorte qu’une haute fidélité des oligonucléotides est essentielle. Le séquençage du pool que nous avons obtenu de Twist a été d’une qualité stupéfiante, avec deux fois moins de mutations que ce à quoi nous nous attendions.
Bernie Mulvey
Doctorant en médecine - École de médecine de l’Université de Washington - St. Louis, MO, États-Unis

Enfin un processus simple de commande d’ADN

 

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