Solutions Twist de flux de travail pour le séquençage de l’ARN

Les produits ARN de Twist constituent une solution NGS complète qui génère des banques uniformes de séquençage pour le séquençage de l’ARN. Les flux de travail complets permettent d’atteindre cet objectif en combinant, de manière rationalisée et efficace, des kits de préparation de banque, des doubles index uniques (UDI) de haute qualité, des identificateurs moléculaires uniques, un enrichissement ciblé et optimisé, et un algorithme propriétaire de conception de panels tenant compte des exons.

Flux de travail Twist pour le séquençage de l’ARN ciblé

• Créez des panels personnalisés pour ne séquencer que les transcriptions importantes d’ARN
• Combinez la préparation de banque d’ARN Twist, l’hybridation Twist et les panels d’enrichissement ciblé de l’ARN
• Améliorez la sensibilité des cibles clés, même dans l’ARN dégradé de faible qualité provenant de FFPE

Flux de travail Twist pour le séquençage du transcriptome entier

• Mesurez les niveaux d’expression de l’ARNm, des longs ARN non codants (lncRNA) et d’autres classes d’ARN
• Préparez des banques à partir d’ARN total extrait d’échantillons frais et FFPE
• Combinez la préparation de banque d’ARN Twist avec le kit de déplétion Twist rRNA & Globin Depletion Kit
• Préparez une banque d’ARN en moins de 5 heures

Ressources associées

• Fiche produit : Solutions de flux de travail Twist pour le séquençage de l’ARN
• Protocole : Protocole de déplétion de l’ARN et de préparation de banque d’ARN avec les Twist Universal Adapters
• Protocole : Protocole de déplétion de l’ARN et de préparation de banque d’ARN avec les Twist UMI Adapters
• Protocole : Préparation de banque d’ARN avec le Twist Universal Adapter System
• Protocole : Préparation de banque d’ARN avec le Twist UMI Adapter System

Exome d’ARN

L’exome d’ARN Twist RNA Exome, associé à la préparation de banque d’ARN Twist RNA Library Prep et à l’enrichissement ciblé Twist Target Enrichment, constitue un outil fiable pour générer des données de séquençage du transcriptome à partir d’ARN extrait de diverses sources, y compris les FFPE. L’exome d’ARN augmente le signal tout en nécessitant moins de lectures de séquençage pour le même nombre de gènes détectés. Cela permet de détecter des cibles faiblement exprimées qui sont essentielles pour obtenir une image précise de l’état transcriptionnel de l’échantillon biologique. De plus, l’approche de conception tenant compte des exons de l’exome d’ARN permet de détecter des isoformes et des jonctions qui seraient autrement perdues avec les méthodes habituelles. Cette solution complète de séquençage peut produire des lectures de séquençage très complexes et uniformes pour l’analyse par séquençage de l’ARN des séquences codantes de protéines du transcriptome humain.

Plus de cibles, moins de lectures

L’exome d’ARN Twist RNA Exome détecte plus de cibles avec moins de lectures sur une variété de sources d’ARN avec des échantillons FFPE et de l’ARN humain universel de référence. Toutes les banques ont été préparées grâce à Twist RNA Library Prep.

Ressources associées

• Fiche produit : Twist RNA Exome
• Fichiers de données : Fichier BED de l’exome d’ARN
• Affiche : Un panel d'exomes ARN utilisé pour enrichir les variants de transcription à l'aide de banques d'ADNc

Fusion d’ARN

Les fusions de gènes agissent souvent comme des mutations drivers oncogènes dans une grande variété de types de cancer. Leur détection rapide et précise permet d’éclairer les actions cliniques et d’orienter les décisions thérapeutiques. Le panel de fusion d’ARN Twist Alliance CeGaT est un panel d’enrichissement basé sur l’ARN qui propose une approche plus ciblée et sensible que les méthodes conventionnelles pour étudier les fusions de gènes.

Ce panel comprend 160 gènes de fusion associés à environ 30 types de cancer. Les gènes de fusion ont été sélectionnés par CeGaT, une société de diagnostic et séquençage génétiques de premier plan située en Europe. Ce modèle ne sert pas seulement à détecter les fusions de gènes connues, mais aussi à en identifier de nouvelles.

Le panel est optimisé et testé pour être utilisé avec le Twist RNA Library Prep Kit afin de garantir un flux de travail complet de bout en bout et des performances exceptionnelles. L’efficacité élevée de la capture grâce à l’enrichissement basé sur l’ARN augmente la sensibilité de la détection. Ce panel est idéal pour le dépistage d’échantillons oncologiques afin d’informer sur les options de traitement ou de découvrir de nouvelles fusions pour la classification des tumeurs.*

Conception du panel

• 160 gènes associés à la fusion avec 66 gènes dans la conception du point d’interruption
• 7394 sondes
• Couvre une grande variété de types de cancer

* Remarque : Le panel de fusion d’ARN Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB est certifié ISO-13485.

Ressources associées

• Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – Gènes
• Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – Cibles de fusion
• Solutions d’analyse CeGaT