Générez 99 % des variants souhaités
Les cribles d’ingénierie des protéines faisant appel à des banques de variants à site unique permettent aux chercheurs d’explorer les régions de séquence d’une protéine et d’étudier la relation entre séquence, structure et fonction des protéines.
La conception de la SSVL de Twist s’appuie sur la synthèse en parallèle d’oligonucléotides à l’aide de la plateforme de synthèse d’ADN au silicone exclusive de Twist. Les banques de Twist sont vérifiées par NGS afin de confirmer que tous les variants souhaités sont présents dans les proportions souhaitées.
Découvrez comment les banques de variantes à site unique (SSVL) de Twist permettent d’analyser les régions de séquence pour identifier les résidus clés de la fonction et de la structure des protéines.
Générez 99 % des variants souhaités
Les cribles d’ingénierie des protéines faisant appel à des banques de variants à site unique permettent aux chercheurs d’explorer les régions de séquence d’une protéine et d’étudier la relation entre séquence, structure et fonction des protéines.
La conception de la SSVL de Twist s’appuie sur la synthèse en parallèle d’oligonucléotides à l’aide de la plateforme de synthèse d’ADN au silicone exclusive de Twist. Les banques de Twist sont vérifiées par NGS afin de confirmer que tous les variants souhaités sont présents dans les proportions souhaitées.
Découvrez comment les banques de variantes à site unique (SSVL) de Twist permettent d’analyser les régions de séquence pour identifier les résidus clés de la fonction et de la structure des protéines.
Les banques de saturation de site éliminent le biais de codon et les substitutions indésirables, contrairement aux approches traditionnelles telles que les méthodes par dégradation et NNK.
TRIM offre un faible rendement répétitif, conduisant à <50 % de produit de pleine longueur dans une banque classique, tandis que les banques Twist produisent davantage de variants exploitables, augmentant ainsi la taille effective de la banque.
| PCR à risque d’erreur | Dégradation
(NNK/NNS) |
Banques de variants à saturation de site (SSVL) Twist |
|
|---|---|---|---|
| Élimine le biais de séquence | Non | Non | Oui |
| Nombre de codons disponibles | Inconnu | 32 | Tous 64 |
| Évite les motifs indésirables | Non | Non | Oui |
| Permet l’optimisation des codons | Non | Non | Oui |
| Évite les codons d’arrêt | Non | Oui | Oui |
Les SSVL permettent un échantillonnage efficace des régions de séquence d’une protéine dans les analyses de criblage.
Cette figure montre la distribution observée des acides aminés sur 65 positions dans la protéine (19 variants prévus par position) lorsqu’elle est constituée de SSVL Twist par rapport à une PCR à risque d’erreurs. Les barres représentent une position d’acide aminé différente, chaque couleur indiquant la fréquence du variant observé. Tous les variants sont présents dans les proportions attendues dans la banque Twist.
Les banques de saturation de site éliminent le biais de codon et les substitutions indésirables, contrairement aux approches traditionnelles telles que les méthodes par dégradation et NNK.
TRIM offre un faible rendement répétitif, conduisant à <50 % de produit de pleine longueur dans une banque classique, tandis que les banques Twist produisent davantage de variants exploitables, augmentant ainsi la taille effective de la banque.
| PCR à risque d’erreur | Dégradation
(NNK/NNS) |
Banques de variants à saturation de site (SSVL) Twist |
|
|---|---|---|---|
| Élimine le biais de séquence | Non | Non | Oui |
| Nombre de codons disponibles | Inconnu | 32 | Tous 64 |
| Évite les motifs indésirables | Non | Non | Oui |
| Permet l’optimisation des codons | Non | Non | Oui |
| Évite les codons d’arrêt | Non | Oui | Oui |
Les SSVL permettent un échantillonnage efficace des régions de séquence d’une protéine dans les analyses de criblage.
Cette figure montre la distribution observée des acides aminés sur 65 positions dans la protéine (19 variants prévus par position) lorsqu’elle est constituée de SSVL Twist par rapport à une PCR à risque d’erreurs. Les barres représentent une position d’acide aminé différente, chaque couleur indiquant la fréquence du variant observé. Tous les variants sont présents dans les proportions attendues dans la banque Twist.
Nous sommes impatients de vous assister dans la commande de vos SSVL. Veuillez cliquer sur le bouton « Obtenir un devis » ci-dessus, où vous serez invité à remplir un court formulaire et quelqu’un vous contactera sous peu pour vous aider à compléter votre commande.
Si vous avez déjà créé un compte avec Twist, vous pouvez vous connecter et commencer à renseigner les détails de votre commande en ligne.
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Affiche
Une synthèse de précision des banques de variants permet une interrogation en profondeur d’un espace de variant à site unique
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