Haute sensibilité. Haute conversion. Faible entrée
Le kit de préparation de banque d’ADNlc avec mélange de polymérase TrueAmp de Twist prépare des banques de haute qualité à partir d’ADN acellulaire circulant.
Le kit de préparation de banque d’ADNlc de Twist constitue le meilleur outil de préparation de banque, offrant des performances stables avec une faible quantité d’échantillons et des taux de conversion élevés.
Performance technique pour des flux de travail d’ADNlc fiables et évolutifs
Le flux de travail d’ADNlc exploite l’équilibre GC technique et l’amplification haute fidélité. Cette conception offre un rendement d’amplification élevé tout en minimisant les erreurs introduites par PCR susceptibles de compromettre la détection des variants à basse fréquence.
Il en résulte des banques uniformes et de haute qualité dans un flux de travail rapide de 2 heures. Le contrôle de démarrage à chaud basé sur aptamère offre une stabilité à température ambiante pour une configuration automatisée, tandis que le mélange maître à tube unique 2× rationalise les flux de travail de WGS et d’enrichissement ciblé.
*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans le cadre de procédures diagnostiques ou cliniques
Amplification à faible biais et haute fidélité conçue pour les flux de travail NGS
EN SAVOIR PLUS
« Nous avons effectué une analyse génomique des mutations génétiques qui s’accumulent dans les organes solides et nous construisons un système de détection qui peut détecter de manière fiable les variants à faible fréquence des mutations somatiques. Le kit de préparation de banque d’ADNlc Twist, offre non seulement un rendement de banque comparable à la méthode conventionnelle à partir d’une petite quantité (1,5 ng) d’ADN fragmenté, même si nous réduisons d’un cycle PCR, mais augmente également la couverture moyenne de la séquence cible capturée existante de 30 % après avoir construit des lectures corrigées des erreurs à l’aide d’indices moléculaires uniques. Le processus de ligature de Twist est simple et rapide pour la préparation de banques et devrait permettre d’étendre l’application du codage à barres moléculaire dans les systèmes de traçabilité. » – Dr Nobuyuki Kakiuchi
Professeur associé, Projet Hakubi, Département de pathologie et de biologie des tumeurs, Troisième cycle de médecine, Université de Kyoto, Japon.
* Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.
Haute sensibilité. Haute conversion. Faible entrée
Le kit de préparation de banque d’ADNlc avec mélange de polymérase TrueAmp de Twist prépare des banques de haute qualité à partir d’ADN acellulaire circulant.
Le kit de préparation de banque d’ADNlc de Twist constitue le meilleur outil de préparation de banque, offrant des performances stables avec une faible quantité d’échantillons et des taux de conversion élevés.
Performance technique pour des flux de travail d’ADNlc fiables et évolutifs
Le flux de travail d’ADNlc exploite l’équilibre GC technique et l’amplification haute fidélité. Cette conception offre un rendement d’amplification élevé tout en minimisant les erreurs introduites par PCR susceptibles de compromettre la détection des variants à basse fréquence.
Il en résulte des banques uniformes et de haute qualité dans un flux de travail rapide de 2 heures. Le contrôle de démarrage à chaud basé sur aptamère offre une stabilité à température ambiante pour une configuration automatisée, tandis que le mélange maître à tube unique 2× rationalise les flux de travail de WGS et d’enrichissement ciblé.
*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans le cadre de procédures diagnostiques ou cliniques
Amplification à faible biais et haute fidélité conçue pour les flux de travail NGS
EN SAVOIR PLUS
« Nous avons effectué une analyse génomique des mutations génétiques qui s’accumulent dans les organes solides et nous construisons un système de détection qui peut détecter de manière fiable les variants à faible fréquence des mutations somatiques. Le kit de préparation de banque d’ADNlc Twist, offre non seulement un rendement de banque comparable à la méthode conventionnelle à partir d’une petite quantité (1,5 ng) d’ADN fragmenté, même si nous réduisons d’un cycle PCR, mais augmente également la couverture moyenne de la séquence cible capturée existante de 30 % après avoir construit des lectures corrigées des erreurs à l’aide d’indices moléculaires uniques. Le processus de ligature de Twist est simple et rapide pour la préparation de banques et devrait permettre d’étendre l’application du codage à barres moléculaire dans les systèmes de traçabilité. » – Dr Nobuyuki Kakiuchi
Professeur associé, Projet Hakubi, Département de pathologie et de biologie des tumeurs, Troisième cycle de médecine, Université de Kyoto, Japon.
* Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.
L’amplification haute fidélité avec des banques d’ADNlc à taux d’erreur similaires à ceux des banques sans PCR préparées avec la polymérase TrueAmp de Twist montre des taux d’erreur de substitution effectivement équivalents à ceux des banques d’ADNlc sans PCR pour toutes les modifications de base mesurées. Le flux de travail amplifié conserve le même profil d’erreur faible que celui observé dans la préparation sans PCR.
Figure 1 : Taux d’erreurs de substitution de base comparables avec et sans amplification TrueAmp. Le kit de préparation de banque d’ADNlc de Twist a été utilisé pour générer des banques avec le modèle de référence d’ADNlc Pan-Cancer v2 de Twist comme matériau d’entrée. Des adaptateurs pleine longueur unique à index double (UDI) de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition sans PCR et des adaptateurs universels de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition PCR. La condition PCR a été amplifiée à l’aide de 6 cycles avec le mélange de polymérase TrueAmp de Twist et les amorces UDI. Les banques ont été regroupées, séquencées et analysées. Des taux d’erreur comparables sont observés entre les banques sans PCR et TrueAmp.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé.
Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL ont été quantifiés grâce au QubitTM dsDNA Broad Range Kit.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation assurent une détection sensible et précise des variants avec une fréquence allélique de variants de 0,25 %.
Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant 217 sites de variant SNP dans le matériel standard Pan-Cancer. Les variants manqués sont calculés en additionnant les sites avec moins de 1 famille de variants divisés par le total des sites de variants détectables.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation offrent une plus grande complexité avec et sans déduplication UMI.
Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant des sites variants dans le matériel standard de l’ADN libre circulant avec une recommandation TE présente ou mise à jour.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé avec des échantillons d’ADN acellulaire natif.
Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL ont été quantifiés grâce au QubitTM dsDNA Broad Range Kit.
L’amplification haute fidélité avec des banques d’ADNlc à taux d’erreur similaires à ceux des banques sans PCR préparées avec la polymérase TrueAmp de Twist montre des taux d’erreur de substitution effectivement équivalents à ceux des banques d’ADNlc sans PCR pour toutes les modifications de base mesurées. Le flux de travail amplifié conserve le même profil d’erreur faible que celui observé dans la préparation sans PCR.
Figure 1 : Taux d’erreurs de substitution de base comparables avec et sans amplification TrueAmp. Le kit de préparation de banque d’ADNlc de Twist a été utilisé pour générer des banques avec le modèle de référence d’ADNlc Pan-Cancer v2 de Twist comme matériau d’entrée. Des adaptateurs pleine longueur unique à index double (UDI) de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition sans PCR et des adaptateurs universels de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition PCR. La condition PCR a été amplifiée à l’aide de 6 cycles avec le mélange de polymérase TrueAmp de Twist et les amorces UDI. Les banques ont été regroupées, séquencées et analysées. Des taux d’erreur comparables sont observés entre les banques sans PCR et TrueAmp.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé.
Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL ont été quantifiés grâce au QubitTM dsDNA Broad Range Kit.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation assurent une détection sensible et précise des variants avec une fréquence allélique de variants de 0,25 %.
Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant 217 sites de variant SNP dans le matériel standard Pan-Cancer. Les variants manqués sont calculés en additionnant les sites avec moins de 1 famille de variants divisés par le total des sites de variants détectables.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation offrent une plus grande complexité avec et sans déduplication UMI.
Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant des sites variants dans le matériel standard de l’ADN libre circulant avec une recommandation TE présente ou mise à jour.
Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé avec des échantillons d’ADN acellulaire natif.
Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL ont été quantifiés grâce au QubitTM dsDNA Broad Range Kit.
Webinaire
Webinaire
La capture ciblée via le kit de préparation de banque Twist cfDNA permet une détection sensible des mutations de l’ADN acellulaire
Webinaire
Prédire le pronostic à l'aide de l'ADN tumoral circulant dans le mélanome uvéal
Fiche produit
Fiche produit
Fiche produit du kit de préparation de banque d’ADNlc avec polymérase TrueAmp de Twist
Note technique
Affiche
Affiche
Kit de préparation de banques et flux de travail optimisés pour améliorer la sensibilité du séquençage de l’ADN libre circulant (ADNlc)
Document technique
Dépliant
Protocole
Protocole
Fiche de protocole de préparation de banque d’ADNlc de Twist avec le système d’adaptateur UMI de Twist
Protocole
ADNlc de Twist avec hybridation standard à enrichissement ciblé et polymérase TrueAmp
Webinaire
La capture ciblée via le kit de préparation de banque Twist cfDNA permet une détection sensible des mutations de l’ADN acellulaire
Webinaire
Prédire le pronostic à l'aide de l'ADN tumoral circulant dans le mélanome uvéal
Fiche produit
Fiche produit du kit de préparation de banque d’ADNlc avec polymérase TrueAmp de Twist
Affiche
Kit de préparation de banques et flux de travail optimisés pour améliorer la sensibilité du séquençage de l’ADN libre circulant (ADNlc)
Protocole
Fiche de protocole de préparation de banque d’ADNlc de Twist avec le système d’adaptateur UMI de Twist
Protocole
ADNlc de Twist avec hybridation standard à enrichissement ciblé et polymérase TrueAmp
