Découvrez de nouveaux virus
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PRÉSENTATION DONNÉES ANALYSE DES DONNÉES COMMANDE ET SPÉCIFICATIONS RESSOURCES
PRÉSENTATION

Découvrir de nouvelles espèces virales

L’émergence pandémique du SARS-CoV-2 a mis en évidence la nécessité d’améliorer les outils de détection et de surveillance des nouveaux pathogènes viraux.

Le Twist Comprehensive Viral Research Panel offre une solution complète d’enrichissement ciblé qui permet aux chercheurs d’identifier et de caractériser rapidement les nouveaux virus et les virus très évolués dans divers types d’échantillons.

Détection
Détection complète de nouvelles espèces virales
Plus d’un million de sondes uniques ciblent 3 153 génomes viraux
Capture des virus à ADNss, ADNds, ARNds et ARNss
Découverte de virus
Découverte de nouveaux variants
La conception d’un panel exhaustif couvre les pathogènes viraux humains et non humains.
Les sondes longues offrent une tolérance élevée aux erreurs d’appariement pour la découverte de nouveaux variants.
Dépistage
Solution de bout en bout pour le dépistage des virus
Analyse simple avec One Codex
Génération rapide de rapports de données et de chiffres prêts à être publiés
DÉTECTER LES ESPÈCES VIRALES NOUVELLES ET ÉVOLUÉES

Le Twist Comprehensive Viral Research Panel couvre les séquences de référence de 3 153 virus, comprenant 15 488 souches différentes. Voici quelques exemples de virus qui peuvent être détectés :

Adénovirus

Coronavirus

Virus de l’herpès

Influenza A & B

Norovirus

Papillomavirus

Parvovirus

Picornavirus

Virus de la variole

Retrovirus

Rhabdovirus
 

Voir toutes les familles ici

Découvrir de nouvelles espèces virales

L’émergence pandémique du SARS-CoV-2 a mis en évidence la nécessité d’améliorer les outils de détection et de surveillance des nouveaux pathogènes viraux.

Le Twist Comprehensive Viral Research Panel offre une solution complète d’enrichissement ciblé qui permet aux chercheurs d’identifier et de caractériser rapidement les nouveaux virus et les virus très évolués dans divers types d’échantillons.

Détection
Détection complète de nouvelles espèces virales
Plus d’un million de sondes uniques ciblent 3 153 génomes viraux
Capture des virus à ADNss, ADNds, ARNds et ARNss
Découverte de virus
Découverte de nouveaux variants
La conception d’un panel exhaustif couvre les pathogènes viraux humains et non humains.
Les sondes longues offrent une tolérance élevée aux erreurs d’appariement pour la découverte de nouveaux variants.
Dépistage
Solution de bout en bout pour le dépistage des virus
Analyse simple avec One Codex
Génération rapide de rapports de données et de chiffres prêts à être publiés
DÉTECTER LES ESPÈCES VIRALES NOUVELLES ET ÉVOLUÉES

Le Twist Comprehensive Viral Research Panel couvre les séquences de référence de 3 153 virus, comprenant 15 488 souches différentes. Voici quelques exemples de virus qui peuvent être détectés :

Adénovirus

Coronavirus

Virus de l’herpès

Influenza A & B

Norovirus

Papillomavirus

Parvovirus

Picornavirus

Virus de la variole

Retrovirus

Rhabdovirus
 

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DONNÉES
Détection complète de nouveaux virus

Nous avons extrait des séquences de référence des bases de données RefSeq, FluDB et VIPR pour concevoir les 1 052 421 sondes uniques qui composent le Twist Comprehensive Viral Research Panel. 

Ce panel couvre largement toutes les familles de virus contenant au moins un virus dont on sait qu’il peut affecter l’homme, notamment les adénovirus, les coronavirus, les flavivirus, les norovirus et les virus de la grippe. 

Le panel couvre non seulement les virus qui affectent l’homme, mais également les virus animaux (par exemple, les coronavirus des chauves-souris). Cela permet de découvrir de nouvelles espèces virales, quelle que soit leur origine.

Grâce à son étendue, le Twist Comprehensive Viral Research Panel peut détecter des souches virales nouvelles et évoluées, y compris celles liées à une épidémie de grippe H1N1 chez les porcs en juin 2020.

Détection complète de nouveaux virus
Détecter des séquences virales particulièrement divergentes

La sélection naturelle des glycoprotéines spike du coronavirus et de l’hémagglutinine de la grippe (HA) chez les animaux a facilité la transmission du SARS-CoV-2 et de la grippe H1N1 à l’homme (zoonose). 

Nous montrons ici que le Twist Comprehensive Viral Research Panel peut permettre de détecter avec succès ces séquences difficiles à capturer, notamment la région spike d’un coronavirus récemment découvert (RoBat-CoV GCCDC1 Singapour) et un segment HA isolé d’une épidémie de grippe H1N1 survenue en juin 2020 chez des employés de l’industrie porcine. 

Notre panel a permis une couverture de plus de 99,8 % de chaque séquence à une profondeur d’au moins 1 fois.
 

Détecter des séquences virales particulièrement divergentes
Enrichissement de nouveaux virus

Nous avons défini la sensibilité au désappariement du Twist Comprehensive Viral Research Panel en générant une série de segments HA contenant des niveaux définis de variation de séquence allant de 5 % à 30 % par rapport à un segment HA de type sauvage.

La capture totale a été atteinte à une couverture de 1x dans des échantillons présentant une variation de séquence allant jusqu’à 10 %. Ensemble, ces données démontrent que le Twist Comprehensive Viral Research Panel peut capturer des séquences virales hautement évoluées. 

Enrichissement de nouveaux virus
Détection multiplex de divers virus

La détection multiplex de virus est possible avec le Twist Comprehensive Viral Research Panel, ce qui permet des applications métagénomiques dans divers types d’échantillons. 

Dans une analyse de co-infection, le panel a réussi à capturer quatre types de virus différents (Astrovirus - ARNss, virus BK - ADNds, Bocavirus - ADNss et Picobirnavirus - ARNds) introduits dans l’ARN humain avec seulement 1,2 M de lectures.   
 

Détection multiplex de divers virus
Détection complète de nouveaux virus

Nous avons extrait des séquences de référence des bases de données RefSeq, FluDB et VIPR pour concevoir les 1 052 421 sondes uniques qui composent le Twist Comprehensive Viral Research Panel. 

Ce panel couvre largement toutes les familles de virus contenant au moins un virus dont on sait qu’il peut affecter l’homme, notamment les adénovirus, les coronavirus, les flavivirus, les norovirus et les virus de la grippe. 

Le panel couvre non seulement les virus qui affectent l’homme, mais également les virus animaux (par exemple, les coronavirus des chauves-souris). Cela permet de découvrir de nouvelles espèces virales, quelle que soit leur origine.

Grâce à son étendue, le Twist Comprehensive Viral Research Panel peut détecter des souches virales nouvelles et évoluées, y compris celles liées à une épidémie de grippe H1N1 chez les porcs en juin 2020.

Détection complète de nouveaux virus
Détecter des séquences virales particulièrement divergentes

La sélection naturelle des glycoprotéines spike du coronavirus et de l’hémagglutinine de la grippe (HA) chez les animaux a facilité la transmission du SARS-CoV-2 et de la grippe H1N1 à l’homme (zoonose). 

Nous montrons ici que le Twist Comprehensive Viral Research Panel peut permettre de détecter avec succès ces séquences difficiles à capturer, notamment la région spike d’un coronavirus récemment découvert (RoBat-CoV GCCDC1 Singapour) et un segment HA isolé d’une épidémie de grippe H1N1 survenue en juin 2020 chez des employés de l’industrie porcine. 

Notre panel a permis une couverture de plus de 99,8 % de chaque séquence à une profondeur d’au moins 1 fois.
 

Détecter des séquences virales particulièrement divergentes
Enrichissement de nouveaux virus

Nous avons défini la sensibilité au désappariement du Twist Comprehensive Viral Research Panel en générant une série de segments HA contenant des niveaux définis de variation de séquence allant de 5 % à 30 % par rapport à un segment HA de type sauvage.

La capture totale a été atteinte à une couverture de 1x dans des échantillons présentant une variation de séquence allant jusqu’à 10 %. Ensemble, ces données démontrent que le Twist Comprehensive Viral Research Panel peut capturer des séquences virales hautement évoluées. 

Enrichissement de nouveaux virus
Détection multiplex de divers virus

La détection multiplex de virus est possible avec le Twist Comprehensive Viral Research Panel, ce qui permet des applications métagénomiques dans divers types d’échantillons. 

Dans une analyse de co-infection, le panel a réussi à capturer quatre types de virus différents (Astrovirus - ARNss, virus BK - ADNds, Bocavirus - ADNss et Picobirnavirus - ARNds) introduits dans l’ARN humain avec seulement 1,2 M de lectures.   
 

Détection multiplex de divers virus
Analyse des données
Analyse d’un codex unique

Le Twist Comprehensive Viral Research Panel comprend l’accès à l’outil d’analyse web One Codex. En outre, cet outil basé sur le cloud permet aux utilisateurs de documenter leurs travaux de recherche de nouveaux virus à l’aide de rapports imprimables et de graphiques prêts à être publiés. 

One Codex simplifie l’analyse des données de séquence obtenues à l’aide du Twist Comprehensive Viral Research Panel. Après avoir téléchargé les données de séquence à l’aide d’une interface simple de type glisser-déposer, les utilisateurs peuvent générer un rapport détaillant les résultats de la recherche de nouveaux virus en quelques minutes. Les utilisateurs peuvent également personnaliser le procédé bioinformatique avec leurs propres seuils de détection et interprétations. 

L’achat du Twist Comprehensive Viral Research Panel est accompagné de tout ce qui est nécessaire pour commencer à analyser vos résultats avec One Codex, y compris un code d’activation et des instructions détaillées. Pour en savoir plus sur cette plateforme d’analyse microbienne simplifiée, rendez-vous sur onecodex.com.
 

Analyse d’un codex unique
Analyse d’un codex unique

Le Twist Comprehensive Viral Research Panel comprend l’accès à l’outil d’analyse web One Codex. En outre, cet outil basé sur le cloud permet aux utilisateurs de documenter leurs travaux de recherche de nouveaux virus à l’aide de rapports imprimables et de graphiques prêts à être publiés. 

One Codex simplifie l’analyse des données de séquence obtenues à l’aide du Twist Comprehensive Viral Research Panel. Après avoir téléchargé les données de séquence à l’aide d’une interface simple de type glisser-déposer, les utilisateurs peuvent générer un rapport détaillant les résultats de la recherche de nouveaux virus en quelques minutes. Les utilisateurs peuvent également personnaliser le procédé bioinformatique avec leurs propres seuils de détection et interprétations. 

L’achat du Twist Comprehensive Viral Research Panel est accompagné de tout ce qui est nécessaire pour commencer à analyser vos résultats avec One Codex, y compris un code d’activation et des instructions détaillées. Pour en savoir plus sur cette plateforme d’analyse microbienne simplifiée, rendez-vous sur onecodex.com.
 

Analyse d’un codex unique
COMMANDE ET SPÉCIFICATIONS
UGS DE PRODUIT

103545

Twist Comprehensive Viral Research Panel avec le logiciel One Codex, 2 réactions, Kit

103547

Twist Comprehensive Viral Research Panel avec le logiciel One Codex, 12 réactions, Kit

103458

Twist Comprehensive Viral Research Panel avec le logiciel One Codex, 96 réactions, Kit
SPÉCIFICATIONS

Étape du procédé

Enrichissement ciblé

Format

ADNds

Taille du panel

36,8 Mb

Contenu

Séquences virales

Conception des bases de données

FluDB, RefSeq, VIPRdb

Conservation

Conserver entre -5 et -30°C
UGS DE PRODUIT

103545

Twist Comprehensive Viral Research Panel avec le logiciel One Codex, 2 réactions, Kit

103547

Twist Comprehensive Viral Research Panel avec le logiciel One Codex, 12 réactions, Kit

103458

Twist Comprehensive Viral Research Panel avec le logiciel One Codex, 96 réactions, Kit
SPÉCIFICATIONS

Étape du procédé

Enrichissement ciblé

Format

ADNds

Taille du panel

36,8 Mb

Contenu

Séquences virales

Conception des bases de données

FluDB, RefSeq, VIPRdb

Conservation

Conserver entre -5 et -30°C
RESSOURCES