Twist NGS Methylation Detection System

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Le Twist NGS Methylation Detection System offre une solution de préparation d’échantillons complète et performante permettant d’identifier les régions méthylées du génome humain. Le flux de travail implique un processus enzymatique unique de New England Biolabs® qui détériore beaucoup moins l’ADN, ainsi que la conception du panel de méthylation personnalisé de Twist.

Qu’il s’agisse de recherche sur la différenciation cellulaire ou de dépistage du cancer dans les biopsies liquides, le système offre la détection de méthylation la plus efficace qui soit.

Une solution de bout en bout

Conversion enzymatique de pointe des cytosines non méthylées
Capture uniforme avec des sondes Twist personnalisées de haute performance
Amélioration des taux de ciblage avec des réactifs optimisés

Préparation de banque innovante

De meilleurs résultats grâce à des banques plus complexes et à de meilleurs équilibres de GC
Détecte 15 % de CpG supplémentaire par rapport à la conversion au bisulfite
Les échantillons sont moins endommagés, ce qui permet d’utiliser des échantillons plus complexes
Intégration aisée du flux de travail dans les programmes d’analyse de méthylation par séquençage existants

Réactifs d’hybridation optimisés

Ajustez le moment de l’hybridation sans compromettre la performance
Amélioration des taux de ciblage grâce à l’activateur de méthylation
Hybridation en moins de 4 heures

Panels personnalisés hautement efficaces*

Une conception sophistiquée, une synthèse précise et un contrôle qualité détaillé garantissent l’uniformité de la capture et la reproductibilité
Capture simultanée d’ADN sens, antisens, méthylé et non méthylé
Performances exceptionnelles pour toutes les tailles de panels, les régions cibles et les critères de multiplexage
Ajoutez ou améliorez facilement le contenu du panel

*Vendu séparément

Comprendre la complexité de la méthylation

Le chef de produit Twist et un scientifique d’application NEB vous présentent une vue d’ensemble du processus NEB-to-Twist. Découvrez les avantages de la conversion enzymatique et de l’approche de conception de sondes de conversion pré-capture Twist ainsi que les possibilités du flux de travail à des types d’échantillons cliniquement pertinents.

Outils permettant d’améliorer l’efficacité de l’analyse de méthylation par séquençage pour une meilleure résolution dans les études épigénétiques

Explorez en détail le nouveau procédé d’analyse de méthylation par séquençage de Twist, conçu en partenariat avec New England Biolabs. Comprenez pourquoi il permet de renforcer la confiance dans l’identification des bases méthylées.

Kit NEBNext® EM-seq™ pour l’analyse de méthylation par séquençage ciblé Twist

En partenariat avec New England Biolabs (NEB), Twist propose un nouveau procédé d’analyse de méthylation par séquençage qui améliore la qualité des banques et supprime la nécessité d’un traitement au bisulfite pendant la préparation.

Le procédé comporte une conversion enzymatique des cytosines non méthylées (voir figure) pour identifier les sites de méthyl-cytosine (5mC) et d’hydroxyméthyl-cytosine (5hmC).

La conversion enzymatique permet de produire des banques plus intactes et mieux représentées et, en fin de compte, de détecter la méthylation de manière plus sensible. Le système de préparation des banques est adapté au séquençage du génome entier et à l’enrichissement en aval avec les panels de méthylation Twist.

La conversion EM-seq implique une série d’étapes enzymatiques pour convertir les cytosines non méthylées en uraciles. Le résultat final est le même que celui de la conversion au bisulfite classique, ce qui fait d’EM-seq un outil compatible avec les programmes d’analyse existants faisant appel à Bismark et bwa-meth.

Système d’hybridation rapide Twist et panels de méthylation personnalisés

Le Kit Fast Hybridization and Wash de Twist offre des performances exceptionnelles et une flexibilité optimale. Il est possible de perfectionner les réactifs et les étapes afin de régler les paramètres de séquençage en aval et de réduire le temps de manipulation et l’utilisation des pipettes.

Conçus à l’aide d’un algorithme très sophistiqué, les panels de méthylation personnalisés Twist capturent les cibles avec une efficacité exceptionnelle sur une large gamme de tailles de cibles. Ensemble, ces composants assurent la meilleure capture hybride possible des régions d’intérêt personnalisées.

Activateur de méthylation Twist

La capture hors cible se produit fréquemment dans les flux de travail d’analyse de méthylation par séquençage, car le processus de conversion réduit la complexité de la séquence de l’échantillon pendant la préparation de la banque.

Pour maximiser la capture des échantillons post-conversion, Twist NGS Methylation Detection System comporte un produit de blocage exclusif conçu spécifiquement pour la détection de la méthylation. Appelé Methylation Enhancer, ce réactif réduit jusqu’à la moitié la capture hors cible.

Détection très sensible des régions méthylées différentiellement

Les niveaux de méthylation varient considérablement dans le génome humain, et les régions différentiellement méthylées (DMR) permettent d’identifier certains cancers.

Pour tester les effets des niveaux de méthylation sur les performances du Twist NGS Methylation Detection System, des banques de niveaux de méthylation variables (de 0 à 100 % de méthylation) ont été créées en combinant de l’ADN génomique hypo- et hyperméthylé dans des proportions définies. Cette analyse a montré que les effets du niveau de méthylation sur les paramètres de séquençage final étaient minimes.

Le Twist NGS Methylation Detection System capture également les régions hypo- et hyperméthylées avec une grande sensibilité.