Capture d’ARN efficace, tenant compte des exons, pour l’expression des gènes et les nouvelles fusions

Le nouveau RNA Exome panel de Twist utilise une nouvelle stratégie de conception tenant compte des exons pour cibler les isoformes codant pour des protéines connues et permettre la découverte de nouveaux gènes de fusion. Nous avons évalué la performance du panel, en montrant que les abondances relatives des transcrits sont préservées après la capture hybride. Nous avons également amélioré l’efficacité du séquençage et démontré la capacité de capturer de nouvelles variantes structurelles, telles que les fusions d’ARN courantes dans les cancers. Nous discutons de notre approche bio-informatique pour évaluer la performance de capture d’ARN et des défis dans l’analyse des expériences de séquençage de l’ARN.

Abordé dans cette note technique
En savoir plus sur la stratégie de conception tenant compte des exons.
Comprendre la stratégie de conception de Twist ARN Exome.
Évaluer les performances du séquençage de l’ARN ciblé.
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