La puissance de la synthèse d’ADN à base de silicium

Twist Bioscience’s high precision, silicon-based high-throughput gene synthesis platform enables us to produce high quality gene fragments starting at 7¢ (USD) per bp and NGS-verified sequence perfect clonal genes starting at 9¢ (USD) per bp. Qu'est-ce que cela signifie pour vous ? Synthèse rapide et précise d'ADN à l'échelle dont vous avez besoin et au prix que vous souhaitez.

Qu’offrons-nous ?

L’offre gènes de Twist Bioscience vous donne la flexibilité d’obtenir l’ADN que vous souhaitez, comme vous le souhaitez. Voyez plus grand, élargissez votre domaine de développement et accélérez la découverte. Vous n'êtes toujours pas convaincu ? Parlez-en à l'un de nos experts résidents !

Mode de fonctionnement

Normally, genes are synthesized with one gene per 96 well plate. Here at Twist, we have perfected gene synthesis and with our proprietary platform is able to synthesize 9600 genes per one silicon-based chip in a single run. This means we can produce 1 gene or 100,000 genes in parallel, in the same amount of time.

Obtenez vos gènes plus rapidement que jamais sans compromettre l'intégrité ou la qualité de la séquence avec Twist Bioscience. Voici ce qu'il faut faire :

Il vous suffit de concevoir votre séquence personnalisée et notre plateforme de synthèse de gène de haute qualité fera le reste.

Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Non destiné à être utilisé dans des procédures de diagnostic.
 

* Calculated Twist internal data using Dr. Oligo benchmark January 2021 and validated by SRI Quality System Registrar and Silinnov Consulting in 2023

* Cet outil est fourni uniquement à titre indicatif. Les avantages escomptés, l’assistance, les calculs d’avantages et les autres résultats ne sont que des estimations, et cette estimation ne constitue ni une proposition ni un devis.

Témoignages

 

Témoignages

Chez Clariant, nous avons intégré plusieurs de nos vecteurs internes pour divers organismes hôtes de Twist. Nous tirons parti du taux de réussite élevé et des délais de rotation rapides de Twist pour la synthèse de gènes et le clonage personnalisé. En externalisant la plupart de nos travaux de routine en biologie moléculaire, nous voulons concentrer notre force de recherche et accélérer nos délais de développement.

Dr HELGE JOCHENS

Clariant

La qualité est excellente, et je constate que le clonage avec ces gènes réussit plus souvent du premier coup qu’avec des fragments d’ADN d’autres sociétés.

DR. AMANDA PORTILLO

Institut des systèmes et de la biologie de synthèse

Nous avons vraiment apprécié le portail de commande en ligne, qui vous indique immédiatement si Twist Bioscience Bioscience peut fabriquer votre gène. Nous avons introduit nos séquences et les algorithmes de Twist Bioscience ont tout de suite indiqué « oui, pourquoi pas ? ». Il s’est avéré que pour Twist Bioscience, réaliser ces séquences difficiles était facile.

DR. PHILIPPE MARLIERE

Institut des systèmes et de la biologie de synthèse

TCRlib Logo

Commander en ligne est désormais plus facile. Regardez notre vidéo « Mode d’emploi » et découvrez comment passer une commande de gènes en ligne à partir de notre plateforme d’e-commerce

Gènes clonaux

La plateforme de Twist est en mesure de synthétiser des centaines de milliers de gènes chaque mois pour répondre à tous vos besoins en matière d’ADN. Notre plateforme de synthèse d’ADN sur silicone nous permet de créer à l’échelle des gènes clonaux très précis, à la séquence parfaite, de différentes longueurs et complexités, qui sont tous vérifiés par NGS. With our Express Genes service, clonal genes can be synthesized and shipped out to you in as fast as 4 days.* La préparation de plasmides sur mesure est aussi simple qu’un clic, avec de nombreuses options pour garantir la réponse de notre ADN aux exigences de vos expériences.

icône Notre service gènes Express

Twist Bioscience’s Express Genes service provides you with the same NGS-verified, sequence perfect Clonal Genes you would expect from our standard Clonal Genes but with the added bonus of an all time fast order to ship turnaround time of 4-7 business days.

Découvrez ci-dessous l’intégralité de notre offre de gènes clonaux :

tables de service de gènes express

Obtenez de l’ADN en express dès aujourd’hui

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AVANTAGES

Faible coût - Haute qualité

 
  • À partir de 9 centimes (USD) par bp
  • Pas de frais supplémentaires de sous-clonage ou de complexité de l’ADN
  • À partir de 10 jours ouvrables
  • Fabriqué aux États-Unis

ADN de votre choix

 
  • Gènes de 0,3 à 5 kb clonés dans un plasmide de votre choix
  • Choisissez un vecteur du catalogue Twist Bioscience ou envoyez-nous le vôtre
  • 4 prep scales (50ng – 2µg | 2µg – 10µg | 10µg – 100µg | 100µg – 1mg)
  • Options de normalisation et de suppression des endotoxines proposées

Synthèse progressive

 
  • Aucune limite de commande
  • Même délai d’exécution quelle que soit la taille de la commande

Développement durable

 
  • Émissions de CO2e nettement inférieures à la norme du secteur
  • Les gènes Twist DNA aident nos clients à respecter leurs propres engagements en matière de changement climatique
  • Les gènes Twist DNA aident nos clients à réduire leurs émissions de GHG

Données

Gènes clonaux à séquence parfaite

Une représentation graphique de notre vérification NGS standard effectuée sur chaque gène clonal. Le gène clonal dans cette représentation est un exemple de clone sans erreur. La profondeur de lecture est indiquée pour le plasmide entier et aucun SNP ou indel n’a été détecté.


*Conditions générales : Eligible Express Genes ship in 4-7 business days. Ce délai varie selon la complexité et la longueur de la séquence. Il convient d’ajouter un délai d’exécution et d’expédition supplémentaire aux commandes à livrer dans d’autres pays que les États-Unis. Les délais d’exécution des gènes clonaux sont susceptibles d’être modifiés en fonction des personnalisations et de la complexité. Average turnaround time for Clonal Genes is 10 business days. L’intégration de nouveaux vecteurs, tant pour les gènes Express que pour les gènes clonaux, prendra plus de temps. Le calculateur de tarif ne concerne que l’offre de fragments de gènes et de gènes clonaux ; il n’inclut pas le prix du service gènes Express.

Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Non destiné à être utilisé dans des procédures de diagnostic.

FAQ

Oui, des frais supplémentaires de 10 $ par gène s’appliquent.

You can find the pricing table for Clonal Gene products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under .

Twist can clone gene synthesis products of up to 7,000 bp into any of our catalog vectors. We also offer cloning into your own custom vector.

No - at this time, Twist does not have vectors for expression in plants; however, we can onboard a custom vector as long as it meets our requirements.

Des certificats d’analyse (certificates of analysis, COA) sont disponibles pour les commandes traitées. You can find the COA for Clonal Gene products in your account by clicking here.
 

Utilisation de l’IA et de gènes clonaux pour concevoir des protéines qui inhibent la capacité d’un pathogène à voler le fer du sang

Rejoignez le Dr Rhys Grinter de l’Université de Melbourne pour découvrir comment l’IA/ML et les gènes clonaux Twist permettent la conception et le criblage rapides de liants protéiques qui bloquent le piratage de l’hème bactérien.

Fragments de gènes

L’ADN est la pierre angulaire de la biologie moléculaire, mais travailler avec de l’ADN de mauvaise qualité gaspille un temps et des ressources précieux. Les fragments de gènes Twist offrent une synthèse de gènes abordable, fiable et rapide sans coûts cachés. By minimizing the need for colony screening with our 1:7500 error rate, our Gene Fragments help streamline cloning workflows, saving you resources downstream.


Order Now or Get the Product Sheet.

AVANTAGES

Rapide et économique

 
  • À partir de 7 centimes (USD) par bp
  • Aucun coût caché
  • Expédié sous 2 à 4 jours ouvrés*
  • Fabriqué aux États-Unis

Conçu pour votre flux de travail

 
  • Longueur : 300 bp à 5 000 bp
  • Rendement : 100 ng à 1 µg
  • Taux d’erreur le plus faible du secteur estimé à 1:7500

ADN de votre choix

 
  • La personnalisation n’a aucun impact sur le coût ou le délai de livraison.
  • Ajouter des adaptateurs d’amplification pour l’amplification d’un seul ensemble d’amorces
  • Choisissez entre la livraison en tubes ou en plaques
  • Options de remise en suspension dans le tampon et de normalisation
  • Pas de minimum ou de maximum de commande

Développement durable

 
  • Émissions de CO2e nettement inférieures à la norme du secteur
  • Les gènes Twist DNA aident nos clients à respecter leurs propres engagements en matière de changement climatique
  • Les gènes Twist DNA aident nos clients à réduire leurs émissions de GHG

Données

La technologie de synthèse d’ADN de Twist dépasse les concurrents avec des taux d’erreur extrêmement bas.

Au cours d’une comparaison directe des produits de fragments de gènes, Twist a toujours affiché le taux d’erreur le plus faible. Le graphique de gauche représente le taux d’erreur moyen pour les séquences de gènes commandées auprès de Twist et Integrated DNA Technologies, Inc. (IDT). Les résultats montrent que les fragments de gènes Twist ont une plus grande précision de séquence que les eBlocks et les gBlocks. La précision de la fidélité des séquences est en moyenne deux fois plus élevée pour les fragments de gènes Twist que pour les gBlocks.

Plus de gènes parfaits chez Twist

Les fragments de gènes Twist donnent systématiquement le plus haut pourcentage de clones parfaits, ce qui vous permet d’économiser du temps et de l’argent dans vos recherches. The graph to the left shows a direct comparison of the percentage of sequence perfect clones across a wide variety of gene lengths and sequences for 3 different gene products. Data was generated using a set of 63 sequences with a wide variety of gene lengths to reflect the diversity of gene lengths required for various real-world synthetic biology applications.

* Ce délai fait référence à un temps de traitement et de manutention typique dans nos installations avant la remise de votre commande au transporteur.

FAQ

You can find the pricing table for Gene Fragment products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under .

Les méthodes suivantes sont disponibles pour cloner des fragments de gènes avec des adaptateurs :

Restriction digestion/Ligation - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning

Type IIS or Golden Gate - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning TOPO cloning (blunt-end) - the adapter sequences will be cloned in as well

Gateway cloning - add attB sites to the ends of your sequence

For more information, click here.

Pour les Adapter-On Gene Fragments, des adaptateurs universels sont synthétisés sur les extrémités de chaque fragment. Les adaptateurs font 21 à 22 nucléotides de long. Les fragments comportant ces adaptateurs sont compatibles avec un certain nombre de méthodes d’assemblage, à savoir digestion/ligation par restriction, Gateway, Golden Gate et clonage TOPO.

Il est possible d’ajouter des sites de restriction dans les adaptateurs pour supprimer des adaptateurs. La méthode de clonage TOPO fonctionne, mais conserve les adaptateurs. 
SÉQUENCES D’ADAPTATEURS

  • Pour les commandes reçues avant le 9 août 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • Adaptateur 3’ : AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • Pour les commandes reçues entre le 9 août 2021 et le 1er novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • Adaptateur 3’ : AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ – CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG – 3’

 

  • Pour les commandes reçues après le 2 novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • Adaptateur 3’ : CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ – CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA – 3’

 

*Les adaptateurs sont de courtes séquences ajoutées à chaque extrémité de l’insert dans le cadre de notre procédé de synthèse. Des fragments de gènes sans ces adaptateurs sont également disponibles lors du processus de commande. 

Si vous avez des questions concernant votre commande, veuillez nous contacter à l’adresse suivante customersupport@twistbioscience.com

 

 

Oui, les fragments de gènes subissent un nettoyage par billes ; cependant, de petites quantités de fragments courts peuvent être transmises.

  • Pour les commandes reçues avant le 9 août 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • Adaptateur 3’ : AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • Pour les commandes reçues entre le 9 août 2021 et le 1er novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • Adaptateur 3’ : AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ – CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG – 3’

 

  • Pour les commandes reçues après le 2 novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • Adaptateur 3’ : CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ – CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA – 3’

 

*Les adaptateurs sont de courtes séquences ajoutées à chaque extrémité de l’insert dans le cadre de notre procédé de synthèse. Des fragments de gènes sans ces adaptateurs sont également disponibles lors du processus de commande.


If you have any questions about your order, please contact us at customersupport@twistbioscience.com

Comment Resurrect Bio alimente la découverte de caractéristiques végétales guidée par l’IA avec des gènes clonaux et des fragments de gènes

Dr. Binnian of Resurrect Bio shares how her team uses AI-driven gene design and Twist Genes to tackle plant immunity challenges, rapidly screening thousands of sequences from in silico prediction to in planta validation.

Fiche produit des gènes clonaux

Twist Bioscience transforme la synthèse de gènes, un processus au cœur de la biologie de synthèse et moléculaire. Notre plateforme d’écriture de l’ADN sur silicone accroît fortement le débit et l’évolutivité de la synthèse de gène tout en réduisant le délai de traitement et le prix par base.

 

Fiche produit des fragments de gènes

Les fragments de gènes de Twist Bioscience améliorent votre processus de clonage en minimisant le criblage des colonies. Ainsi, vous gagnez du temps et économisez de l’argent en réduisant fortement les coûts de clonage et de séquençage.

Élaborer une meilleure chaîne de production d’ADN
Arzeda s’appuie sur la technologie de Labcyte, TeselaGen et Twist Bioscience pour accélérer son processus de biologie de synthèse.
Accélérer la recherche d’anticorps en relation avec les maladies rares
Chargé par l’agence DARPA d’un objectif ambitieux, à savoir développer une réponse rapide pour aider le corps médical à lutter contre les maladies virales sur le terrain, le Vanderbilt University Medical Center a déjà réduit le temps nécessaire au développement d’anticorps de manière significative. Des gènes synthétiques à haut débit de Twist Bioscience ont permis au laboratoire d’accélérer ce processus.

Ingénierie de voie par le biais de la synthèse de gène 5 kb
Un cycle rapide conception-élaboration-test est essentiel pour les applications d’ingénierie métabolique dans lesquelles les chercheurs reprogramment des microorganismes afin de produire des molécules d’intérêt non originelles. Pour produire ces molécules, les chercheurs ajoutent généralement un gène ou une voie entière de gènes dans un organisme hôte. Ces gènes codent des protéines ou des enzymes qui, lorsqu’elles sont exprimées dans un hôte microbien, convertissent un substrat commun en une molécule d’intérêt.
Conseils de Twist relatifs aux gènes : Comment concevoir votre gène
Twist Bioscience utilise une plateforme de synthèse d’ADN sur silicone pour produire de l’ADN synthétique de haute qualité. Grâce à notre plateforme de commande en ligne, concevoir et commander des gènes auprès de Twist Bioscience est un processus simple. Ce document fournit des conseils sur la façon d’optimiser et de personnaliser les gènes clonaux et les fragments de gènes de Twist Bioscience pour diverses applications.
Conseils pour les gènes Twist Bioscience - Conformes aux exigences de longueur minimale pour les gènes dans des vecteurs personnalisés
Lorsque vous envoyez une séquence à synthétiser, l’algorithme d’évaluation vérifie la séquence pour déterminer si elle peut être synthétisée. En premier lieu, il vérifie notamment si la séquence respecte l’exigence de longueur minimale de 300 bp. Aidez-vous de ce document pour concevoir vos gènes lorsqu’ils ne respectent pas les exigences de longueur minimale.
De la conception jusqu’à la protéine : Expression de protéine acellulaire à l’aide de Twist Gene Fragments

Amyris discute des plateformes de nouvelle génération pour l’optimisation des souches 
Regardez ce webinaire montrant comment les gènes Twist Bioscience permettent à cette entreprise innovante de mener à bien ses efforts d’ingénierie microbienne. https://www.twistbioscience.com/genes_bioengineeringwebinar_sunilchandran

Directives sur la remise en suspension d’ADN de Twist
Directives relatives au clonage de fragments de gènes
Twist Bioscience's Gene Fragments are double-stranded DNA, 300 to… 5000 base pairs in length. Ces fragments de haute qualité sont fournis avec des séquences d’adaptateurs 5’ et 3’ uniques.
Instructions de manipulation des stocks de glycérol Twist

Des protéines anti-CRISPR à large spectre facilitent le transfert horizontal de gènes
Prédiction guidée par l’apprentissage automatique in silico de clonotypes réactifs à l’antigène, basée sur les changements de l’abondance clonale par le biais du biopanning.
Structure cristalline de l’endoribonucléase Nsp15 NendoU du SARS-CoV-2
Évolution continue des variants de SpCas9 compatibles avec les PAM non-G
La sélection convergente dans les répertoires d’anticorps est révélée par l’apprentissage en profondeur.
Le canal hétéromérique LRRC8A:C est un transporteur de cGAMP et l’importateur dominant de cGAMP dans les cellules du système vasculaire humain
La conception de protéines de novo permet l’induction précise d’anticorps fonctionnels in vivo
Lecture in situ des codes-barres de l’ADN et des modifications d’une seule base facilitée par la transcription in vitro
Une approche globale pour la conception de novo de protéines fonctionnelles

Général

Twist Bioscience expédie ses produits ADN desséchés ou remis en suspension dans des tubes de microcentrifugation de 2 mL ou en plaques de 96 ou de 384 puits. L’ADN desséché est expédié à température ambiante et l’ADN remis en suspension est expédié congelé.

L’ADN à double brin et les oligonucléotides à simple brin sont stables dans la plupart des conditions de stockage standard en laboratoire. Il convient cependant de tenir compte des bonnes pratiques suivantes pour préserver la haute qualité de l’ADN synthétisé par Twist Bioscience.

  • Twist recommande de stocker l’ADN desséché pendant les durées suivantes en fonction des conditions de stockage.
    • Température ambiante pendant 3 mois.
    • 4 °C pendant 12 mois.
    • -20 °C pendant 24 mois.
    • -80 °C pour un stockage à long terme.
  • Directives pour la remise en suspension
    • Pour la remise en suspension, centrifugez brièvement le tube ou la plaque avant l’ouverture et remettez en suspension dans un tampon Tris-EDTA (TE) non nucléasique à pH 8,0 ou dans 10 mM de Tris-HCl, pH 8,0, jusqu’à la concentration désirée.
    • Une concentration d’au moins 10 ng/μL est recommandée pour la dilution de la pâte, mais la concentration optimale devra être déterminée en fonction de l’application que vous désirez.
    • Préparez les aliquotes de dilution de pâte et séparez les aliquotes de travail pour limiter les risques de contamination et réduire le nombre de cycles de congélation/décongélation. Utilisez les aliquotes de travail dès que possible après la préparation et limitez le plus possible l’exposition à des températures élevées.
  • ADN remis en suspension
    • Certains produits peuvent être remis en suspension. Votre ADN peut arriver dans l’un des tampons suivants. Nous conseillons de centrifuger brièvement le tube ou la plaque avant ouverture.
      • Tampon d’élution (2 mM Tris-Cl, pH 8,5)
      • Tampon TE (10 mM Tris-Cl, pH 8,0, 1 mM EDTA)
      • Tampon TE EDTA faible (10 mM Tris-Cl, pH 8,0, 0,1 mM EDTA)
      • Eau       
        • Nous déconseillons le stockage prolongé dans l’eau.
    • Twist conseille de stocker l’ADN remis en suspension pendant les durées suivantes en fonction des conditions de stockage.
      • Température ambiante pendant 3 mois.
      • 4 °C pendant 12 mois.
      • -20 °C pendant 24 mois.
      • -80 °C pour un stockage à long terme.

Tous nos produits de synthèse de gènes clonaux sont vérifiés par séquence de NGS.

Les fragments de gènes ne sont pas vérifiés par NGS. Avec un faible taux d’erreur dans la synthèse de gène, nous estimons que vous devrez séquencer environ 3, 4 ou 6 colonies pour des fragments de gènes de 600, 1 200 ou 1 800 bps respectivement pour obtenir un clone à séquence parfaite sûr à 99 %.

Les produits de gènes sont généralement livrés en tant que produit desséché (sauf mention contraire).

Les gènes clonaux sont livrés clonés dans l’un des vecteurs du catalogue de Twist ou dans votre propre vecteur personnalisé. Les fragments de gènes sont livrés sous forme de séquences linéaires à double brin (avec ou sans adaptateurs flanquants).

Nous fournissons les séquences de gènes sur des plaques de 96/384 puits. Pour les petites commandes (moins de 10), les gènes peuvent être livrés en tubes sans coût supplémentaire. Pour les commandes de dix gènes ou plus, les demandes de commande en tube s’accompagnent de frais supplémentaires de 50 $ par commande.

Les produits ADN de Twist sont desséchés et expédiés en plaques de 96/384 puits ou en tubes de microcentrifugation de 2 mL. Bien que les produits ADN à double brin soient stables dans la plupart des conditions de stockage standard, nous conseillons ce qui suit pour préserver la haute qualité de l’ADN :

  • Après réception, centrifugez brièvement le tube ou la plaque et remettez l’ADN en suspension dans un tampon Tris-EDTA (TE) non nucléasique à pH 8,0 ou dans 10 mM de Tris-HCl, pH 8,0, jusqu’à la concentration désirée.
  • Nous déconseillons la remise en suspension dans de l’eau.
  • Une concentration d’au moins 10 ng/ul est recommandée pour une solution de pâte, mais la concentration optimale devra être déterminée en fonction de l’application que vous désirez.
  • Préparez les aliquotes de pâte et séparez les aliquotes de travail pour limiter les risques de contamination et réduire le nombre de cycles de congélation/décongélation.
  • Pour un stockage à long terme, congelez l’ADN à -20 °C pendant une année au maximum ou à -80 °C pour une conservation encore plus longue.

Resuspension guideline can be found here

Gènes clonaux

You can find the pricing table for Gene Fragment products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under .

Les méthodes suivantes sont disponibles pour cloner des fragments de gènes avec des adaptateurs :

Restriction digestion/Ligation - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning

Type IIS or Golden Gate - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning TOPO cloning (blunt-end) - the adapter sequences will be cloned in as well

Gateway cloning - add attB sites to the ends of your sequence

For more information, click here.  

Pour les Adapter-On Gene Fragments, des adaptateurs universels sont synthétisés sur les extrémités de chaque fragment. Les adaptateurs font 21 à 22 nucléotides de long. Les fragments comportant ces adaptateurs sont compatibles avec un certain nombre de méthodes d’assemblage, à savoir digestion/ligation par restriction, Gateway, Golden Gate et clonage TOPO.

Il est possible d’ajouter des sites de restriction dans les adaptateurs pour supprimer des adaptateurs. La méthode de clonage TOPO fonctionne, mais conserve les adaptateurs. 
SÉQUENCES D’ADAPTATEURS

  • Pour les commandes reçues avant le 9 août 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • Adaptateur 3’ : AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • Pour les commandes reçues entre le 9 août 2021 et le 1er novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • Adaptateur 3’ : AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ – CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG – 3’

 

  • Pour les commandes reçues après le 2 novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • Adaptateur 3’ : CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ – CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA – 3’

 

*Les adaptateurs sont de courtes séquences ajoutées à chaque extrémité de l’insert dans le cadre de notre procédé de synthèse. Des fragments de gènes sans ces adaptateurs sont également disponibles lors du processus de commande. 

Si vous avez des questions concernant votre commande, veuillez nous contacter à l’adresse suivante customersupport@twistbioscience.com

Oui, les fragments de gènes subissent un nettoyage par billes ; cependant, de petites quantités de fragments courts peuvent être transmises.

  • Pour les commandes reçues avant le 9 août 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • Adaptateur 3’ : AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • Pour les commandes reçues entre le 9 août 2021 et le 1er novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • Adaptateur 3’ : AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ – CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG – 3’

 

  • Pour les commandes reçues après le 2 novembre 2021, les séquences adaptatrices sont les suivantes :
    • Adaptateur 5' : CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • Adaptateur 3’ : CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ – CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA – 3’

 

*Les adaptateurs sont de courtes séquences ajoutées à chaque extrémité de l’insert dans le cadre de notre procédé de synthèse. Des fragments de gènes sans ces adaptateurs sont également disponibles lors du processus de commande.


If you have any questions about your order, please contact us at customersupport@twistbioscience.com

Optimisation des codons

La liste suivante répertorie les organismes pris en charge pour l’optimisation des codons sur notre site Web :

  • Arabidopsis thaliana
  • Aspergillus niger
  • Aspergillus oryzae
  • Bacillus subtilis
  • Brassica napus
  • Caenorhabditis elegans
  • Cricetulus griseus (CHO)
  • Drosophila melanogaster
  • Escherichia coli
  • Glycine max
  • Homo sapiens
  • Hypocrea jecorina
  • Medicago sativa
  • Mus musculus
  • Nicotiana tabacum
  • Petunia x hybrida
  • Pichia pastoris
  • Pisum sativum
  • Rattus norvegicus
  • Saccharomyces cerevisiae
  • Solanum tuberosum
  • Spodoptera frugiperda
  • Streptomyces coelicolor A3(2)
  • Sus scrofa
  • Toxoplasma gondii
  • Xenopus laevis
  • Yarrowia lipolytica
  • Zea mays

If you do not see your specific organism, contact customersupport@twistbioscience.com

À l’heure actuelle, nous ne sommes pas en mesure de synthétiser des gènes évalués comme étant Impossibles. Plusieurs facteurs font que notre algorithme évalue un gène comme étant Impossible et les paramètres particuliers sont spécifiques à la séquence du gène. Notre algorithme exclusif a été développé en utilisant l’apprentissage machine. Outre l’apprentissage machine, notre algorithme tient compte des facteurs suivants :

  • Pourcentage de GC entre 25 et 65 %
  • Longueur max. d’homopolymère < 10
  • Faible homologie

Une combinaison unique de ce qui précède aboutit à une évaluation de la séquence de gènes spécifique comme étant Impossible.

Pour conserver l’expression protéique sauvage :

  • Nous évitons d’utiliser des codons rares (ceux dont la fréquence est < 8 %).
  • Nous nous assurons que les séquences ne comportent pas de structures en épingle à cheveux (ΔG < -8) dans les 48 premières paires de bases des séquences résultantes.
  • Nous vérifions les deux brins pour nous assurer qu’ils ne contiennent pas de site de restriction enzymatique que vous nous avez demandé d’éviter.
  • Nous évitons d’introduire des séquences de promoteurs internes dans les séquences d’expression en évitant de créer des sites de liaison sigma70 forts.
  • Nous évitons les séquences qui créent des sites de liaison de ribosome forts (GGAGG et TAAGGAG).
  • Nous évitons les séquences qui créent des séquences de terminaison (TTTTT ou AAAAA).

Pour améliorer la probabilité de réussite de la fabrication :

  • Nous n’introduisons pas de répétitions d’une longueur supérieure à 20 paires de bases.
  • Nous évitons les suites homonucléotidiques de 10 bases ou plus.
  • Nous évitons les séquences ajustées qui créent un pourcentage global de GC inférieur à 25 % ou supérieur à 65 % et les fenêtres de GC locales (50 bp) de moins de 35 % ou plus de 65 %.

Veuillez noter que l’optimisation des codons est utile pour améliorer les chances de réussite de la synthèse, pas de l’expression protéique.  

Conception de séquence

Les problèmes de synthèse sont principalement dus à des structures répétitives, à une teneur en GC extrême et à des homopolymères. Pour déterminer les chances de réussite, nous nous appuyons sur une méthode d’apprentissage automatique. Par conséquent, la plupart du temps, le rejet d’une séquence ne s’explique pas par un motif unique. La complexité ou le rejet résultent plutôt d’un ensemble de caractéristiques qui portent une séquence au-delà d’un certain niveau de complexité. Les seules règles strictes sont les suivantes :

  • Éviter les homopolymères >= 14 bp

  • Ne pas inclure de CcdB (système toxine-antitoxine de type II)

Si vous faites face à un problème, nous vous recommandons de supprimer ou de minimiser les répétitions, les régions à teneur extrême en GC et les homopolymères. Nous mettrons en évidence les zones préoccupantes si votre séquence s’avère complexe, impossible à construire ou contient des séquences qui entrent en conflit avec nos processus internes.

Une fois que vous aurez envoyé vos séquences de gènes à notre site Web, ces séquences seront automatiquement évaluées pour déterminer la faisabilité de l’assemblage :

Standard: No errors have been found. Il a été déterminé que la séquence de gènes présente globalement une complexité « standard » (par exemple, longueur, teneur en GC, homologie, etc.). 

Complex: No errors have been found. Certaines séquences sont complexes (longueur, teneur en GC, homologie, etc.), mais la synthèse de votre gène ne devrait pas poser de problème. Dans de rares cas, les séquences peuvent être soumises à un délai d’exécution plus long ou à un risque d’échec de production.

Error: Gene sequence contains errors. Veuillez cliquer sur la séquence pour obtenir plus de détails sur la manière de les résoudre.

Not Accepted: The sequence contains elements that make it impossible for us to synthesize. Veuillez consulter les explications détaillées qui accompagnent le message d’erreur ou vous référer aux « Directives de conception ».

À propos du système d’évaluation

Notre système d’évaluation repose sur un modèle d’apprentissage automatique qui analyse et combine plusieurs paramètres de séquence (pourcentage global de GC, longueur maximale des homopolymères, longueur maximale des répétitions, longueur des séquences, densité des répétitions, etc.). Ce modèle a été développé à partir de nos données historiques de production et permet une estimation plus précise du succès de la production de gènes et d’anticorps.

À propos des messages ISSUE

Warnings: Are associated with the risk of failure, predicted by the machine learning model. Un nombre plus élevé d’avertissements est plus susceptible d’entraîner un score « Non accepté ».

Errors: Are not associated with gene complexity, and they can be fixed by correcting the gene design

Notre site Web accepte les séquences d’acides aminés et les convertit en séquences d’ADN à des fins de synthèse.  Sur la page de chargement des séquences, sélectionnez l’option Séquence d’acides aminés.


 Assurez-vous que votre saisie contient uniquement des caractères à une lettre pour les acides aminés. Nous ne prenons en charge que les 20 caractères de codage standard à une lettre.

La présence du signe « * » à la fin de vos séquences d’acides aminés indique un codon de terminaison (nous n’ajoutons pas automatiquement de codon de terminaison).

En fonction du tableau d’utilisation des codons que vous choisissez, les codons les plus fréquemment utilisés seront sélectionnés.            

Si vous ne voyez pas votre organisme spécifique, contactez customersupport@twistbioscience.com pour obtenir de l’aide.

Remarque sur les gènes clonaux : les vecteurs d’expression de Twist ne contiennent pas tous un mécanisme d’expression standard en amont du point d’insertion. We recommend double-checking the sequence of your final plasmid construct by clicking "Download Sequences"after selecting your desired vector. 

Les clients ont le choix entre commander des pools d’oligonucléotides, des fragments de gènes et des gènes clonaux.

Les oligonucléotides (ADN linéaire simple brin) dans des pools d’oligonucléotides ont une taille pouvant aller de 20 bp à 300 bp.

Les fragments de gènes sont de l’ADN linéaire double brin d’une taille pouvant aller de 300 à 5 000 bp (longueur).

Les gènes clonaux sont de l’ADN double brin qui a été cloné dans l’un des vecteurs de Twist ou dans un vecteur personnalisé fourni par le client. La plage de longueurs des gènes clonaux peut aller de 300 à 5 000 bp.

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