Éliminer les biais et les motifs indésirables
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Présentation

La technologie de banque de variants de précision permet un criblage précis

La plateforme plateforme de synthèse d’ADN sur silicone massivement parallèle de Twist produit des oligonucléotides particulièrement uniformes et précis, 90 % des oligonucléotides étant représentés dans < 2,5 fois la moyenne, avec un faible taux d’erreur pour le secteur de 1:2 000 nt.

Associée à notre expertise bien établie en biologie moléculaire, la plateforme de synthèse des oligonucléotides de Twist permet de fabriquer des banques de gènes mutants extrêmement divers offrant une excellente représentation des variants et une composition définie par l’utilisateur hautement spécifique sans biais ou motifs indésirables. La technologie de banques de Twist permet une interrogation exhaustive des régions de séquences de variants.

Grande diversité et précision
Grande diversité et précision
Incorporez aisément plusieurs domaines de variants dans un ou plusieurs échafaudages.
Contrôle précis de l’utilisation des codons (les 64 codons), de la distribution des acides aminés et de la variation de longueur.
Qualité vérifiée
Qualité vérifiée
Contrôle de qualité rigoureux, y compris la vérification par NGS des régions modifiées.
Ratios de variants de séquence documentés
Distribution uniforme des variants définis par l’utilisateur
Pas de codons d’arrêt prématurés ou de codons indésirés
Flexibilité
Flexibilité
Conception de toutes les séquences, domaines et combinaisons uniques ou multiples - variants simples, par paires ou triples
Le système de synthèse modulaire permet l’itération de futures banques
Plus grande flexibilité que TRIM et l’approche par dégradation
La technologie de banque de variants de précision permet un criblage précis

Découvrez la capacité de Twist Bioscience à construire des banques complexes à haute diversité dans des régions confinées (par exemple, des CDR) et nous présentons des avancées technologiques qui permettent de construire des banques d’ADN synthétique avec une diversité répartie sur toute la longueur des constructions.

Regarder le webinaire

La technologie de banque de variants de précision permet un criblage précis

La plateforme plateforme de synthèse d’ADN sur silicone massivement parallèle de Twist produit des oligonucléotides particulièrement uniformes et précis, 90 % des oligonucléotides étant représentés dans < 2,5 fois la moyenne, avec un faible taux d’erreur pour le secteur de 1:2 000 nt.

Associée à notre expertise bien établie en biologie moléculaire, la plateforme de synthèse des oligonucléotides de Twist permet de fabriquer des banques de gènes mutants extrêmement divers offrant une excellente représentation des variants et une composition définie par l’utilisateur hautement spécifique sans biais ou motifs indésirables. La technologie de banques de Twist permet une interrogation exhaustive des régions de séquences de variants.

Grande diversité et précision
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Incorporez aisément plusieurs domaines de variants dans un ou plusieurs échafaudages.
Contrôle précis de l’utilisation des codons (les 64 codons), de la distribution des acides aminés et de la variation de longueur.
Qualité vérifiée
Qualité vérifiée
Contrôle de qualité rigoureux, y compris la vérification par NGS des régions modifiées.
Ratios de variants de séquence documentés
Distribution uniforme des variants définis par l’utilisateur
Pas de codons d’arrêt prématurés ou de codons indésirés
Flexibilité
Flexibilité
Conception de toutes les séquences, domaines et combinaisons uniques ou multiples - variants simples, par paires ou triples
Le système de synthèse modulaire permet l’itération de futures banques
Plus grande flexibilité que TRIM et l’approche par dégradation
La technologie de banque de variants de précision permet un criblage précis

Découvrez la capacité de Twist Bioscience à construire des banques complexes à haute diversité dans des régions confinées (par exemple, des CDR) et nous présentons des avancées technologiques qui permettent de construire des banques d’ADN synthétique avec une diversité répartie sur toute la longueur des constructions.

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DONNÉES
Des données de grande qualité

La plateforme de synthèse d’ADN sur silicone et la technologie de banque de Twist Bioscience procurent aux scientifiques des banques de qualité fournissant des données fiables en moins de temps. Comparée à deux autres technologies concurrentes (figure 1), la banque de Twist présente un écart de moins de 1 % par rapport à la fréquence des acides aminés prévue.  Outre la correspondance précise des ratios d’acides aminés, la plateforme de synthèse d’ADN conçue in silico de Twist intègre de manière transparente les motifs de liaison souhaitables et les variations de longueur dans des banques de domaines multiples, ce qui permet aux scientifiques de concevoir et de personnaliser avec précision des banques de variants offrant une analyse complète des espaces de variants.

Avec les banques Twist, les problèmes et défis typiques des banques NNK et TRIM n’ont pas lieu d’être. Chaque variant est imprimé base par base et passé au crible avant synthèse, ce qui permet d’éliminer les codons d’arrêt, les motifs de responsabilité, les mutations indésirables et tout biais indésirable, le tout au début du processus. La banque est ainsi enrichie des variants fonctionnels demandés, tandis que le criblage est réduit.

Nos banques de pointe, conçues avec précision, prêtes à l’emploi et très diversifiées, offrent aux scientifiques davantage de possibilités d’atteindre leurs objectifs de recherche.

Comparaison des technologies: NNK vs Trimer vs Twist
Des banques de meilleure qualité

Twist fait appel à son expertise en biologie moléculaire pour élaborer avec précision des banques de variants. Notre méthode de contrôle par base unique nous permet de produire des banques très diversifiées, sans motifs susceptibles de perturber votre processus de sélection. Nous proposons des banques entièrement personnalisées d’une qualité inégalée, avec les variants souhaités présents dans des proportions définies par l’utilisateur. Vous pouvez voir ici un exemple de CVL représentatif de cette qualité. Des variants dans sept positions séquentielles d’acides aminés ont été générés et tous présentent les variants attendus aux positions indiquées, avec presque tout le ratio souhaité :

Aux positions 1 et 6, l’acide aminé de type sauvage a été demandé à 40 % (position 1) et 30 % (position 7). Les 18 acides aminés restants ont tous été demandés à un taux ne dépassant pas 3,3 %.

En position 3 à 5, des résidus d’acides aminés ont été demandés et observés à 5,3 %.

Distribution banques de variants. et CVL
Banques de CDR définies par l’utilisateur

Nos banques de variants précises vous permettent de choisir les séquences CDR (complimentary defining regions) uniques que vous souhaitez voir incorporées dans la ou les structures choisies.

Chaque CDR peut bénéficier de l’optimisation des codons pour éviter la création de sites de restriction indésirables. L’apprentissage automatique fait désormais partie intégrante de la recherche scientifique et a été utilisé comme outil pour analyser des banques d’anticorps et identifier des combinaisons uniques de CDR qui donneraient, par exemple, une affinité et une spécificité plus élevées. 

Associées à la plateforme de synthèse sur silicone de Twist, les combinaisons de banques explicites générées par l’analyse peuvent être synthétisées et intégrées de manière continue dans une banque entièrement synthétique afin d’affiner l’exploration de l’espace des variants.

Banques de CDR définies par l’utilisateur

 

Banques soumises à un contrôle de qualité par NGS

Comme toutes les banques sont vérifiées par NGS, les données négatives permettent d’identifier les mutations qui n’améliorent pas les fonctions et qui peuvent être supprimées lors de l’itération suivant la conception de la banque.

Le tableau montre la fréquence des acides aminés (%) à sept sites de l'utilisation d'une région mutagénisée synthétisée. Des variants dans sept positions séquentielles d’acides aminés ont été générés avec 19 résidus d’acides aminés (la cystéine a été omise) dans les sept premiers sites. Voir le tableau des données de fréquence obtenues par NGS, la nuance de vert indiquant la déviation par rapport à la valeur attendue. Tous les variants escomptés ont été observés à toutes les positions et leur fréquence observée se situait à moins de 25 % de la valeur attendue (spécification), soit 5,3 %.

Distribution banques de variants. et CVL
Des données de grande qualité

La plateforme de synthèse d’ADN sur silicone et la technologie de banque de Twist Bioscience procurent aux scientifiques des banques de qualité fournissant des données fiables en moins de temps. Comparée à deux autres technologies concurrentes (figure 1), la banque de Twist présente un écart de moins de 1 % par rapport à la fréquence des acides aminés prévue.  Outre la correspondance précise des ratios d’acides aminés, la plateforme de synthèse d’ADN conçue in silico de Twist intègre de manière transparente les motifs de liaison souhaitables et les variations de longueur dans des banques de domaines multiples, ce qui permet aux scientifiques de concevoir et de personnaliser avec précision des banques de variants offrant une analyse complète des espaces de variants.

Avec les banques Twist, les problèmes et défis typiques des banques NNK et TRIM n’ont pas lieu d’être. Chaque variant est imprimé base par base et passé au crible avant synthèse, ce qui permet d’éliminer les codons d’arrêt, les motifs de responsabilité, les mutations indésirables et tout biais indésirable, le tout au début du processus. La banque est ainsi enrichie des variants fonctionnels demandés, tandis que le criblage est réduit.

Nos banques de pointe, conçues avec précision, prêtes à l’emploi et très diversifiées, offrent aux scientifiques davantage de possibilités d’atteindre leurs objectifs de recherche.

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Des banques de meilleure qualité

Twist fait appel à son expertise en biologie moléculaire pour élaborer avec précision des banques de variants. Notre méthode de contrôle par base unique nous permet de produire des banques très diversifiées, sans motifs susceptibles de perturber votre processus de sélection. Nous proposons des banques entièrement personnalisées d’une qualité inégalée, avec les variants souhaités présents dans des proportions définies par l’utilisateur. Vous pouvez voir ici un exemple de CVL représentatif de cette qualité. Des variants dans sept positions séquentielles d’acides aminés ont été générés et tous présentent les variants attendus aux positions indiquées, avec presque tout le ratio souhaité :

Aux positions 1 et 6, l’acide aminé de type sauvage a été demandé à 40 % (position 1) et 30 % (position 7). Les 18 acides aminés restants ont tous été demandés à un taux ne dépassant pas 3,3 %.

En position 3 à 5, des résidus d’acides aminés ont été demandés et observés à 5,3 %.

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Chaque CDR peut bénéficier de l’optimisation des codons pour éviter la création de sites de restriction indésirables. L’apprentissage automatique fait désormais partie intégrante de la recherche scientifique et a été utilisé comme outil pour analyser des banques d’anticorps et identifier des combinaisons uniques de CDR qui donneraient, par exemple, une affinité et une spécificité plus élevées. 

Associées à la plateforme de synthèse sur silicone de Twist, les combinaisons de banques explicites générées par l’analyse peuvent être synthétisées et intégrées de manière continue dans une banque entièrement synthétique afin d’affiner l’exploration de l’espace des variants.

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Comme toutes les banques sont vérifiées par NGS, les données négatives permettent d’identifier les mutations qui n’améliorent pas les fonctions et qui peuvent être supprimées lors de l’itération suivant la conception de la banque.

Le tableau montre la fréquence des acides aminés (%) à sept sites de l'utilisation d'une région mutagénisée synthétisée. Des variants dans sept positions séquentielles d’acides aminés ont été générés avec 19 résidus d’acides aminés (la cystéine a été omise) dans les sept premiers sites. Voir le tableau des données de fréquence obtenues par NGS, la nuance de vert indiquant la déviation par rapport à la valeur attendue. Tous les variants escomptés ont été observés à toutes les positions et leur fréquence observée se situait à moins de 25 % de la valeur attendue (spécification), soit 5,3 %.

Distribution banques de variants. et CVL
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Nous sommes impatients de vous assister dans la commande de vos SSVL. Veuillez cliquer sur le bouton « Obtenir un devis » ci-dessus, où vous serez invité à remplir un court formulaire et quelqu’un vous contactera sous peu pour vous aider à compléter votre commande. 

Si vous avez déjà créé un compte avec Twist, vous pouvez vous connecter et commencer à renseigner les détails de votre commande en ligne.
 

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