Les virus mutent rapidement et des centaines de mutations ont été détectées dans le génome du SARS-CoV-2, dont certaines peuvent augmenter les taux d’infection, comme cela a été récemment signalé pour la nouvelle souche B1.1.7. Les nouvelles mutations peuvent également affecter la précision des tests de diagnostic, l’efficacité des vaccins, et peuvent être associées à des phénotypes cliniquement pertinents (gravité de la maladie, réponse au traitement). 

Le séquençage du génome entier du virus peut facilement révéler de nouvelles mutations et contribuer ainsi à une meilleure compréhension de la virulence et à la détermination des voies de transmission dans le monde.