Adaptateurs UMI méthylés
- Quelle est la structure de l’adaptateur des UMI méthylés ?
- Combien de bases contiennent les séquences UMI ?
- Les séquences UMI sont-elles disponibles ?
- Les UMI méthylés sont-ils compatibles avec NEB EM-seq ?
- Avez-vous des conseils sur la façon de traiter les données de séquençage générées avec les UMI méthylés ?
- Les UMI méthylés sont-ils compatibles avec l’ADNg et avec l’ADNlc ?
Préparation de banque
- Est-ce que Twist propose des kits de préparation de banque utilisant la fragmentation enzymatique ?
- Est-ce que Twist propose des kits de préparation de banque utilisant la fragmentation mécanique ?
- Quel est le rapport adaptateur/fragments d’ADN à l’étape de ligation ?
- Si j’utilise une méthode de préparation de banque n’appartenant pas à Twist, quelle est la taille recommandée pour les inserts d’ADN ?
- Quelles sont les configurations de kit complet offertes par Twist pour la préparation et l’enrichissement de banques NGS ?
- Puis-je utiliser les kits de Twist pour créer des banques pour le séquençage du génome complet ?
- Les adaptateurs de Twist sont-ils compatibles avec les méthodes de fragmentation enzymatique et de fragmentation mécanique ?
- Est-il possible d’acheter séparément des composants individuels des kits d’enrichissement ?
Méthylation
- Quelle méthode de fragmentation puis-je utiliser dans ce processus ?
- Quelle est la taille d’insert recommandée ?
- Quelle est la taille finale de la banque ?
- Quel est le rendement final attendu pour ma banque ?
- Existe-t-il des contrôles internes pour tester la conversion de la méthylation ?
- Quel est le résultat minimal/maximal pour la préparation de la banque ?
- Puis-je utiliser le processus d’hybridation standard pour l’enrichissement ?
- Puis-je multiplexer les banques lors de la capture ? Si oui, quel est la quantité de banques requise ?
- Quelles modifications est-il possible d’apporter au protocole pour optimiser la capture hybride ?
- Quel est le nombre de cycles d’amplification recommandé après la capture ?
- Dois-je utiliser l’amplificateur de méthylation ?
Enrichissement ciblé
- Quelle est la quantité maximale d’ADN que je peux utiliser dans l’hybridation ? Puis-je ajouter plus de 1 500 ng d’ADN ?
- Quelles sont les séquences des amorces d’amplification après capture dans le kit NGS ?
- Quelle est la concentration des amorces d’amplification utilisées dans le PCR post-enrichissement ?
- Puis-je utiliser des Twist Universal Blockers avec d’autres adaptateurs ?
Général
Kit de préparation de banque 96-Plex Twist
- Quelles sont les tailles des kits ?
- Y a-t-il des consommables et des outils supplémentaires que le client doit fournir ?
- Comment commander un kit ?
- Puis-je commander les composants individuels du kit ?
- Quels sont les protocoles disponibles ?
- Quelle est la durée de conservation de ce kit ?
- Quel séquenceur dois-je utiliser avec ce kit ?
- Est-il possible de préparer moins de 96 échantillons à la fois ?
- Quelles sont les recommandations concernant l’apport d’ADN, sa qualité et sa quantité ?
- Des index doubles uniques sont-ils disponibles avec le kit ?
- Avez-vous des recommandations pour les concentrations de chargement ?
- Comment le kit s’adapte-t-il aux échantillons dont la teneur en GC varie ?
- Que recommandez-vous comme outil de démux ?
- Quelles séquences devons-nous utiliser pour l’ajustement des adaptateurs des banques 96-Plex ?
- Les banques 96-Plex peuvent-elles être regroupées pour le séquençage avec des banques à double indexation ?
- Est-il possible d’avoir une seule plaque d’échantillons dans une série de séquençage ?
- Y a-t-il des éléments à prendre en compte pour l’utilisation de cellules d’écoulement à motifs ?
