Un panel de exoma de ARN usado para enriquecer variantes de transcripción mediante bibliotecas de ADNc

La secuenciación total del ARN proporciona una vista relativamente sin sesgo del estado transcripcional de una población de células. Sin embargo, la mayoría de los experimentos de secuenciación total del ARN deben competir con un gran número de lecturas que no resultan de utilidad para el análisis de la expresión genética. Aquí presentamos experimentos de secuenciación de capturas mediante el nuevo panel de exoma de ARN de Twist, que utiliza una nueva estrategia de diseño dirigida específicamente a cada isoforma de codificación de proteínas en Gencode v41 Basic. Evaluamos el rendimiento del exoma del ARN en ARN degradado, en aplicaciones de expresión diferencial, y su capacidad para capturar nuevas variantes de transcripción. En general, proporcionamos pruebas de que la solución de enriquecimiento dirigido para la expresión genética Twist es una forma efectiva de perfilar la expresión genética y detectar fusiones genéticas.

Contenido de este póster
Una descripción de la nueva estrategia de diseño que tiene en cuenta los exones
Datos de rendimiento del exoma del ARN en muestras de ARN degradado y con poca entrada de masa
Rendimiento de la aplicación de la detección de variantes de fusión y la expresión diferencial
Proporcione sus datos para obtener el póster
Powered by Translations.com GlobalLink Web Software