El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc con la mezcla de polimerasa TrueAmp Twist prepara bibliotecas de alta calidad a partir de ADN libre de células circulantes.
El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist proporciona nuestra solución de preparación de bibliotecas de más alta calidad, ya que ofrece un alto rendimiento con una baja entrada de muestras, así como tasas altas de conversión.
Rendimiento diseñado para flujos de trabajo de ADNlc fiables y escalables
El flujo de trabajo de ADNlc aprovecha el equilibrio de GC diseñado por ingeniería y la amplificación de alta fidelidad. Este diseño ofrece un alto rendimiento de amplificación a la vez que minimiza los errores introducidos por PCR que pueden comprometer la detección de variantes de baja frecuencia.
El resultado son bibliotecas uniformes y de alta calidad en un flujo de trabajo rápido de 2 horas. El control de arranque en caliente basado en aptámeros proporciona estabilidad a temperatura ambiente para la configuración automatizada, mientras que la mezcla maestra de tubo único 2× agiliza los flujos de trabajo de WGS y de enriquecimiento del objetivo.
* Solo para investigación. No utilizar en procedimientos diagnósticos o clínicos.
Mezcla de polimerasa TrueAmp Twist
Amplificación de sesgo bajo y alta fidelidad diseñada por ingeniería para flujos de trabajo de NGS
Testimonio de clientes
“Hemos estado realizando análisis genómicos de mutaciones genéticas que se acumulan en órganos sólidos y estamos construyendo un sistema de detección capaz de detectar con fiabilidad variantes de baja frecuencia de mutaciones somáticas. By using the Twist cfDNA Library preparation kit, we not only obtain a library yield comparable to the conventional method from a small amount (1.5 ng) of fragmented DNA even if we reduce one less PCR cycle, but also increase the average coverage of the existing target capture sequence by 30% after constructing error-corrected reads using unique molecular indices. Twist's ligation process is simple and quick for library preparation and is expected to expand the application of molecular barcoding in trace systems." - Dr. Nobuyuki Kakiuchi
Profesor asociado, Proyecto Hakubi, Departamento de Patología y Biología Tumoral, Facultad de Medicina, Universidad de Kioto, Japón
* Los resultados son específicos de la institución en la que se han obtenido y pueden no reflejar los resultados que puedan obtenerse en otras instituciones.
Amplificación de alta fidelidad con PCR
Amplificación de alta fidelidad con tasas de error similares a sin PCR Las bibliotecas de ADNlc preparadas con la polimerasa TrueAmp Twist muestran tasas de error de sustitución que son efectivamente equivalentes a las bibliotecas de ADNlc sin PCR en todos los cambios de base medidos. El flujo de trabajo amplificado mantiene el mismo perfil de error bajo observado en la preparación sin PCR.
Figura 1: Tasas de error de sustitución de base comparables con y sin amplificación TrueAmp. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist se utilizó para generar bibliotecas con el estándar de referencia pantumoral para ADNlc Twist v2 como material de entrada. Los adaptadores de índice doble único (UDI) de longitud completa Twist se utilizaron durante la ligadura para la condición sin PCR y los adaptadores universales Twist, durante la ligadura para la condición de PCR. La condición de PCR se amplificó utilizando 6 ciclos con mezcla de polimerasa TrueAmp Twist y cebadores de UDI. Las bibliotecas se agruparon, secuenciaron y analizaron. Se observan tasas de error comparables entre las bibliotecas sin PCR y TrueAmp.
Tasa de conversión más alta = rendimiento más alto
Tras la generación de bibliotecas, las muestras se diluyeron en 20 μl de agua y 1 μl se cuantificó con QubitTM dsDNA Broad Range Kit.
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Mayor sensibilidad y mayor precisión
Las bibliotecas se capturaron monoplexadas con un panel oncológico personalizado de 50 kb dirigido a los sitios de variantes de 217 SNP en el material estándar pantumoral. Las variantes ausentes se calculan sumando los sitios con menos de 1 familia de variantes y dividiendo el resultado entre el número de sitios de variantes detectables totales.
Duplexión mejorada = mayor complejidad
Las bibliotecas se capturaron monoplexadas con un panel oncológico personalizado de 50 kb dirigido a los sitios de variantes en el material estándar de ADNlc con recomendación de TE presente o actualizada.
Baja entrada probada con ADNlc
Tras la generación de bibliotecas, las muestras se diluyeron en 20 μl de agua y 1 μl se cuantificó con QubitTM dsDNA Broad Range Kit.
Twist Bioscience HQ
681 Gateway Blvd
South San Francisco, CA 94080
Genes
Grupos de oligonucleótidos
NGS
Bibliotecas de variantes
Descubrimiento de anticuerpos
Soluciones compatibles con las IVDR
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