Conexión de genotipos de rasgos de plantas con fenotipos mediante la secuenciación con barrido del genoma completo (SGC)

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Presentado por
Jason Johns
Jason Johns
Doctorando, Universidad de California, Santa Bárbara

Cubierto en este seminario web
Los mapas genéticos de alta calidad se pueden construir de forma eficaz mediante la secuenciación con barrido del genoma completo.
Los mapas genéticos y los análisis de loci de caracteres cuantitativos (QTL) se pueden emplear para identificar regiones genómicas responsables de fenotipos.
Gracias a la preparación de bibliotecas de Twist, el cribado de marcadores genéticos resulta eficaz y rentable en muchas muestras.

One of the primary applications of genomics is to connect genotype to phenotype. Linkage mapping utilizes recombination to identify regions of the genome that code for traits of interest. Our lab has used the cost-effective high-throughput Twist 96-Plex Library Prep (Riptide) kit in multiple crosses to perform whole-genome skim sequencing and create high-quality genetic maps. These genetic maps have been used to identify regions of the genome and, using quantitative trait locus (QTL) analysis, specific candidate genes responsible for various plant traits. I will demonstrate our process from raw genomic DNA to a genetic map and QTL. This process can be applied to and adapted for any diploid system.

 

* Los resultados son específicos de la institución en la que se han obtenido y pueden no reflejar los resultados que puedan obtenerse en otras instituciones.

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