Mpox-Virus-Kontrollen

Die synthetischen humanen Mpox-Virus(hMPXV)-Kontrollen von Twist basieren auf Sequenzen aus Kladen von hMPXV, vormals bekannt als Affenpocken, aus dem Kongobecken (CB) oder Westafrika (WA) und decken ≥80 % des viralen Genoms ab. Daher unterstützen diese Kontrollen das Design von benutzerdefinierten Assays, die auf Regionen des Genoms abzielen, die für die Orthopoxvirus-Forschung relevant sind, und können sowohl für Amplikon- als auch Capture-basierte Nachweismethoden verwendet werden. Die hMPXV-Kontrollen von Twist wurden validiert und sind mit den von der CDC empfohlenen Echtzeit-PCR-Testverfahren zum Nachweis von Mpox kompatibel. Kontrolle 1 und Kontrolle 2 bestehen aus 154 bzw. 151 überlappenden 1,8-kb-Fragmenten, die das Genom in einem Intervall von 900 bp kartieren. Jede Kontrolle ist vorhanden in Kopien und wird in einer Konzentration von ca. 100.000 Kopien/μl bereitgestellt. Die Abbildung rechts zeigt eine taxonomische Beziehung zwischen den WA- und CB-Kladen des hMPXV sowie anderen Orthopoxviren. Bitte wenden Sie sich an Ihren örtlichen Vertriebsmitarbeiter, um weitere Informationen zu erhalten.

Hinweis: Die synthetischen humanen Twist Mpox-Virus(hMPXV)-Kontrollen
sind nicht ISO-13485-zertifiziert.

 

Virusname, Genbank-IDs, Virustyp und Längen

Die Virusname-Genbank-IDs, der Virustyp und die Länge für jedes Virus in den Twist Respiratory Virus-Kontrollen

Verwandte Ressourcen

Verwendung von Positivkontrollen bei der Qualitätskontrolle

Twist hat synthetische RNA-Kontrollen für mehrere Virusgenome erstellt. Diese Varianten wurden ausgewählt, um einen weiten Bereich der Sequenzdiversität abzudecken. Jede Kontrolle besteht aus sechs nicht überlappenden 5-kb-Fragmenten, die aus Twist Gene Fragments erzeugt und dann in ssRNA transkribiert wurden. Diese Kontrollen decken mehr als 99,9 % der Basen des SARS-CoV-2-Virusgenoms ab. Die Mehrzahl der Kontrollen wird im Standardformat bereitgestellt, das aus 100 μl bei einer Konzentration von ungefähr einer Million Kopien pro Mikroliter besteht. Twist bietet bestimmte Kontrollen auch im Assay Ready- und verkapselten Format an, die als getrocknetes Pellet geliefert werden. Die Assay Ready-Kontrollen werden mit ungefähr zwei Millionen Kopien pro Röhrchen geliefert. The Encapsulated Controls are supplied at approximately 50,000 copies per tube. Die synthetische Twist Assay Ready SARS-CoV-2-RNA-Kontrolle wurde in Zusammenarbeit mit der US-amerikanischen Gesundheitsbehörde CDC entwickelt und in den CDC-Influenza-SARS-CoV-2-Multiplex-Assay (Flu SC2) integriert, der gleichzeitig auf Influenza A, B und SARS-CoV-2 testet. Die synthetische Twist Assay SARS-CoV-2-RNA-Kontrolle ist jetzt auch für Nicht-CDC-Kunden verfügbar. 

Die verkapselten Kontrollprodukte von Twist bieten eine einzigartige Lager- und Liefermethode für die bewährten synthetischen SARS-CoV-2-RNA-Kontrollen von Twist. So wie die Proteinverkapselung von Viren eine stabilere molekulare Speicherung ermöglicht, wird bei den verkapselten Kontrollprodukten von Twist eine neue Methode, bei der eine Metallkapsel um ein getrocknetes Pellet herum versiegelt wird, zur Erhöhung der Stabilität der RNA-Kontrollen genutzt. Dank der erhöhten Stabilität können diese bei Raumtemperatur versendet und gelagert werden, was die Kosten reduziert und die globale Zugänglichkeit verbessert. The Encapsulated Controls are sold in a rack of 16 or 96 tubes, are single use, and have a 5-year shelf life from the date of manufacture.

Available SARS-CoV-2 Controls

Best Practices für die Verwendung von Assay Ready- und verkapselten Kontrollen

Für die Lagerung und Verwendung von Assay Ready- bzw. verkapselten SARS-CoV-2-Kontrollen bitte die folgenden Dokumente lesen:


This product has not been FDA cleared or approved, but has been authorized for emergency use by FDA under an EUA for use by authorized laboratories; This product has been authorized only for the detection of nucleic acid from SARS-CoV-2, along with the identification and differentiation of SARS-CoV-2 PANGO lineages and the identification of specific SARS-CoV-2 genomic mutations, not for any other viruses or pathogens; and, the emergency use of this product is only authorized for the duration of the declaration that circumstances exist justifying the authorization of emergency use of in vitro diagnostics for detection and/or diagnosis of COVID-19 under Section 564(b)(1) of the Federal Food, Drug and Cosmetic Act, 21 U.S.C. § 360bbb-3(b)(1), unless the declaration is terminated or authorization is revoked sooner.

TEILNUMMER KONTROLLE GenBank/GISAID ID GISAID-NAME
102019 Kontrolle 1 MT007544.1 Australien/VIC01/2020
102024 Kontrolle 2 MN908947.3 Wuhan-Hu-1
103925 Assay Ready-Kontrolle 2 MN908947.3 Wuhan-Hu-1
104422 Verkapselte Kontrolle 2 (16) MN908947.3 Wuhan-Hu-1
104426 Verkapselte Kontrolle 2 (96) MN908947.3 Wuhan-Hu-1
102860 Kontrolle 3 LC528232.1 Japan/Hu_DP_Kng_19-020/2020
102862 Kontrolle 4 MT106054.1 USA/TX1/2020
102917 Kontrolle 5 MT188340 USA/MN2-MDH2/2020
102918 Kontrolle 6 MT118835 USA/CA9/2020
103087 Kontrolle 7 EPI_ISL_418227 Frankreich/HF2393/2020
103511 Kontrolle 8 MT066176 Taiwan/NTU02/2020
103512 Kontrolle 9 MT152824 USA/WA2/2020
103513 Kontrolle 10 EPI_ISL_414648 USA/CA-PC101P/2020
103514 Kontrolle 11 EPI_ISL_417739 Island/5/2020
103515 Kontrolle 12 EPI_ISL_420244 England/SHEF-C05B2/2020
103533 Kontrolle 13 EPI_ISL_421184 Belgien/ULG-10004/2020
103907 Kontrolle 14
Alpha
EPI_ISL_710528 England/205041766/2020
103926 Assay Ready-Kontrolle 14
Alpha (B.1.1.7)
EPI_ISL_710528 England/205041766/2020
103909 Kontrolle 15
Alpha
EPI_ISL_601443 England/MILK-9E05B3/2020
103927

Assay Ready-Kontrolle 15
Alpha (B.1.1.7)

EPI_ISL_601443 England/MILK-9E05B3/2020
104043 Kontrolle 16
Beta (B.1.351)
EPI_ISL_678597 Südafrika/KRISP-EC-K005299/2020
104044 Kontrolle 17
Gamma (P.1)
EPI_ISL_792683 Japan (Brasilien) /IC-0564/2021
104338

Kontrolle 18
Kappa (B.1.617.1)

EPI_ISL_1662307 Indien/CT-ILSGS00361/2021
104529

Kontrolle 19
Iota (B.1.526)

EPI_ISL_1300881 USA/NY-MSHSPSP-PV24650/2020
104530 Kontrolle 20 (B.1.427) EPI_ISL_730092 USA/CA-ALSR-4704/2020
104531

Kontrolle 21
Epsilon (B.1.429)

EPI_ISL_672365 USA/CA-CZB-12943/2020
104532 Kontrolle 22 (B1.1.519) EPI_ISL_933685 Mexico/CMX-InDRE_208/2021

104533

Kontrolle 23
Delta (B.1.617.2)
EPI_ISL_1544014 Indien/MH-NCCS-P1162000182735/2021
104534 Kontrolle 24
(B.1.617.3)
EPI_ISL_1939891 Indien/MH-SEQ-221_S66_R1_001/2021
104538

Kontrolle 28  
Delta (AY.1)

EPI_ISL_2695467 Portugal/PT9543/2021
104423 Verkapselte Kontrolle 28 (16) Delta (AY.1) EPI_ISL_2695467 Portugal/PT9543/2021
104427 Verkapselte Kontrolle 28 (96) Delta (AY.1) EPI_ISL_2695467 Portugal/PT9543/2021
104539

Kontrolle 29  
Delta (AY.2)

EPI_ISL_2693246 USA/WA-CDC-UW21061750277/2021
105204 Kontrolle 48 (B.1.1.529/BA.1) EPI_ISL_6841980 Hong Kong/HKU-211129-001/2021
104424 Verkapselte Kontrolle 48 (16)
(B.1.1.529/BA.1)
EPI_ISL_6841980 Hong Kong/HKU-211129-001/2021
104428 Verkapselte Kontrolle 48 (96)
(B.1.1.529/BA.1)
EPI_ISL_6841980

Hong Kong/HKU-211129-001/2021

105345 Kontrolle 50 (B.1.1.529 und BA.2) EPI_ISL_7190366 Australia/QLD2568/2021
105346 Kontrolle 51 (B.1.1.529 und BA.2) EPI_ISL_7718520 England/MILK-2DF642C/2021
105865 Kontrolle 62 (B.2.12.1) EPI_ISL_12248637.1 Denmark/DCGC-493190/2022
105857 Kontrolle 63 (B.2.12.1)

 EPI_ISL_12303256.1

USA/NY-CDC-LC0579415/2022
106196 Kontrolle 64 (BA.5) EPI_ISL_12516495 hCoV-19/England/LSPA-3DC1269/2022
106197 Kontrolle 65 (BA.5) EPI_ISL_12620611 hCoV-19/USA/TN-ASC-210769476/2022
106198 Kontrolle 66 (BA.4) EPI_ISL_12454576 hCoV-19/USA/TX-HMH-M-96682/2022
106199 Kontrolle 67 (BA.4) EPI_ISL_12605687 hCoV-19/USA/CA-CDC-QDX36065390/202

106929

Kontrolle 70

EPI_ISL_14829147

hCoV-19/USA/MI-CDC-QDX40579621/2022

106930

Kontrolle 71

EPI_ISL_15381979

hCoV-19/Australia/SA464919/2022

Verfügbare Atemwegsvirus-Kontrollen
 

Die Twist Synthetic Respiratory Virus-Kontrollen decken ein breites Spektrum von RNA- und DNA-Viren ab, die für die Erforschung von Atemwegserkrankungen relevant sind. Diese Kontrollen sind auf den Inhalt des Twist Respiratory Virus Research Panel (PN 103067) abgestimmt und eignen sich zur Verwendung mit Twist Fixed Panel NGS-Workflows oder zur Verwendung mit RT-PCR- oder qPCR-Versuchen Ihres eigenen Designs. 

Diese Abbildung zeigt eine ausgewählte taxonomische Struktur von Viren, die von den Twist Respiratory Virus Controls abgedeckt werden. Die Tabelle zeigt die GenBank-IDs, den Virustyp und die Länge für jede Kontrolle. Für die kundenspezifische Synthese stehen möglicherweise zusätzliche Viruskontrollen zur Verfügung. Bitte wenden Sie sich an Ihren örtlichen Vertriebsmitarbeiter, um weitere Informationen zu erhalten.

Virusname, Genbank-IDs, Virustyp und Längen

Virus name Genbank IDs, virus type, and length for each virus included in the Twist Respiratory Virus Controls. Additional viral controls may be available for custom synthesis.

Wenden Sie sich an Ihren örtlichen Vertriebsmitarbeiter, um weitere Informationen zu erhalten.

Teilenummer Name Zugang Virustyp Länge (Basen)
103001 Twist Synthetic Influenza H1N1 (2009) RNA-Kontrolle NC_026431, NC_026432,
NC_026433, NC_026434,
NC_026435, NC_026436,
NC_026437, NC_026438
ssRNA (- Sense) 13158
103002 Temperatur: Twist Synthetic Influenza H3N2 RNA-Kontrolle NC_007366, NC_007367,
NC_007368, NC_007369,
NC_007370, NC_007371,
NC_007372, NC_007373
ssRNA (- Sense) 14452
103003 Twist Synthetic Influenza B RNA-Kontrolle NC_002204, NC_002205,
NC_002206, NC_002207,
NC_002208, NC_002209,
NC_002210, NC_002211
ssRNA (- Sense) 14452
103004 Twist Synthetic Human Bocavirus 1 DNA-Kontrolle MG953830.1 ssDNA 5164
103005 Twist Synthetisches Humanes Enterovirus 68 RNA-Kontrolle NC_038308.1 ssRNA (+ Sense) 7367
103006 Twist Synthetic Human Rhinovirus 89 RNA-Kontrolle NC_001617.1 ssRNA (+ Sense) 7152
103007 Twist Synthetic Mumps Virus RNA-Kontrolle NC_002200.1 ssRNA (- Sense) 15384
103008 Twist Synthetic Human Parainfluenza Virus 1 RNA-Kontrolle NC_003461.1 ssRNA (- Sense) 15600
103009 Twist Synthetic Masernvirus RNA-Kontrolle NC_001498.1 ssRNA (- Sense) 15894
103010 Twist Synthetic Human Parainfluenza Virus 4 RNA-Kontrolle NC_021928.1 ssRNA (- Sense) 17052
103011 Twist Synthetic Human Coronavirus 229E RNA-Kontrolle NC_002645.1 ssRNA (+ Sense) 27317
103012 Twist Synthetic Human Coronavirus NL63 RNA-Kontrolle NC_005831.2 ssRNA (+ Sense) 27553
103013 Twist Synthetic Human Coronavirus OC43 RNA-Kontrolle NC_006213.1 ssRNA (+ Sense) 30741
103730 Twist Respiratory Virus Controls (13 Stück) N/A N/A N/A
109012 Twist Synthetic Influenza A (H5N1) RNA-Kontrolle OR051630.1, OR051629.1 ssRNA (- Sense) HA-Segment: 1.695, NA-Segment: 1.410

   Taking Control In H5N1 Bird Flu Research With Synthetic DNA                                                                                                                                     Read more

Respiratory Virus Controls                                                                                                                                                                                                      Download

Twist Synthetic Infectious Disease Controls Product List                                                                                                                                                         Download

Synthetic SARS-CoV-2 Control Variant Information                                                                                                                                                                   Download

Synthetic SARS-CoV-2 RNA Controls                                                                                                                                                                                         Download

NGS-basiertes Target Capture für den Nachweis und die Charakterisierung von SARS-CoV-2
NGS-Zielanreicherung von viralen Krankheitserregern mit dem Twist Respiratory Virus Research Panel

Twist Assay Ready Synthetic Controls

Richtlinie zur Lagerung und Handhabung von verkapselten SARS-CoV-2-RNA-Kontrollen von Twist
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