Untersuchen Sie den Sequenzabschnitt Ihres Proteins
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Übersicht

Erzeugen Sie 99 % der gewünschten Varianten

Protein Engineering-Analysen, die SSVL verwenden, ermöglichen es Forschern, den Sequenzabschnitt eines Proteins zu untersuchen und die Beziehung zwischen Sequenz und Proteinstruktur sowie Funktion zu erforschen.


Der Aufbau einer SSVL von Twist nutzt die parallele Oligonukleotid-Synthese unter Verwendung von Twists proprietärer silikonbasierter DNA-Syntheseplattform. Twist Libraries sind NGS-verifiziert, womit bestätigt wird, dass alle gewünschten Varianten in den richtigen Verhältnissen vorhanden sind.

Präzise ausgebaute Variant Libraries
Präzise ausgebaute Variant Libraries
Komplette Kontrolle über Codonverwendung (alle 64 Codons verfügbar)
Hohe Homogenität der Variantenrepräsentation an jeder Position
Keine unerwünschten Codons oder vorzeitigen Stoppcodons
Verifizierte Qualität
Verifizierte Qualität
Rigorose Qualitätskontrolle
Bestätigte Homogenität der Variantenrepräsentation durch NGS
Repräsentation jeder Stelle normalisiert durch Masse
Flexibilität
Flexibilität
Eine Position pro Well in einer 96-Well-Platte oder alle Positionen gepoolt in einem Einzelröhrchen
Analyse von 1 bis 20 verschiedenen Aminosäuren an jeder Position
Basenbasierte Präzision erleben

Erfahren Sie mehr darüber, wie Single Site Variant Libraries (SSVL) von Twist die Interrogation des Sequenzabschnitts ermöglichen, um wesentliche Rückstände bei der Proteinstruktur und -funktion zu identifizieren.

Webinar ansehen

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Protein Engineering-Analysen, die SSVL verwenden, ermöglichen es Forschern, den Sequenzabschnitt eines Proteins zu untersuchen und die Beziehung zwischen Sequenz und Proteinstruktur sowie Funktion zu erforschen.


Der Aufbau einer SSVL von Twist nutzt die parallele Oligonukleotid-Synthese unter Verwendung von Twists proprietärer silikonbasierter DNA-Syntheseplattform. Twist Libraries sind NGS-verifiziert, womit bestätigt wird, dass alle gewünschten Varianten in den richtigen Verhältnissen vorhanden sind.

Präzise ausgebaute Variant Libraries
Präzise ausgebaute Variant Libraries
Komplette Kontrolle über Codonverwendung (alle 64 Codons verfügbar)
Hohe Homogenität der Variantenrepräsentation an jeder Position
Keine unerwünschten Codons oder vorzeitigen Stoppcodons
Verifizierte Qualität
Verifizierte Qualität
Rigorose Qualitätskontrolle
Bestätigte Homogenität der Variantenrepräsentation durch NGS
Repräsentation jeder Stelle normalisiert durch Masse
Flexibilität
Flexibilität
Eine Position pro Well in einer 96-Well-Platte oder alle Positionen gepoolt in einem Einzelröhrchen
Analyse von 1 bis 20 verschiedenen Aminosäuren an jeder Position
Basenbasierte Präzision erleben

Erfahren Sie mehr darüber, wie Single Site Variant Libraries (SSVL) von Twist die Interrogation des Sequenzabschnitts ermöglichen, um wesentliche Rückstände bei der Proteinstruktur und -funktion zu identifizieren.

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DATEN
Untersuchung des Sequenzabschnitts

Site Saturation Libraries eliminieren im Gegensatz zu herkömmlichen Methoden wie Degenerations- und NNK-Ansätzen Codon Bias und unerwünschte Substitutionen. 

Die wiederholte Ausbeute bei TRIM ist schlecht und führt zu <50 % Produkten voller Länge in einer typischen Library. Twist-Libraries hingegen erreichen mehr nutzbare Varianten und vergrößern so die effektive Größe der Library.

  Fehleranfälliger PCR Degeneration 

(NNK/NNS)

SSVLs
von Twist
Eliminiert Sequenzverzerrungen Nein Nein Ja
Anzahl der verfügbaren Codons Unbekannt 32 Alle 64
Beugt ungewünschten Motiven vor Nein Nein Ja
Ermöglicht Codonoptimierung Nein Nein Ja
Vermeidet Stoppcodons Nein Ja Ja

 

Sehr homogene Variant Libraries

SSVL ermöglichen die effiziente Probennahme des Sequenzabschnitts eines Proteins in Screening-Assays.

Diese Abbildung zeigt die beobachtete Verteilung der Aminosäuren über 65 Positionen im Protein (19 beabsichtigte Varianten pro Position), wenn sie mit Twist SSVL im Vergleich zu einem fehleranfälligen PCR erstellt wurden. Die Balken stellen verschiedene Aminosäure-Positionen dar, wobei jede Farbe die beobachtete Variantenfrequenz indiziert. Alle Varianten stehen in den erwarteten Verhältnissen in der Twist-Library zur Verfügung.

SSVL-Verteilung

 

Untersuchung des Sequenzabschnitts

Site Saturation Libraries eliminieren im Gegensatz zu herkömmlichen Methoden wie Degenerations- und NNK-Ansätzen Codon Bias und unerwünschte Substitutionen. 

Die wiederholte Ausbeute bei TRIM ist schlecht und führt zu <50 % Produkten voller Länge in einer typischen Library. Twist-Libraries hingegen erreichen mehr nutzbare Varianten und vergrößern so die effektive Größe der Library.

  Fehleranfälliger PCR Degeneration 

(NNK/NNS)

SSVLs
von Twist
Eliminiert Sequenzverzerrungen Nein Nein Ja
Anzahl der verfügbaren Codons Unbekannt 32 Alle 64
Beugt ungewünschten Motiven vor Nein Nein Ja
Ermöglicht Codonoptimierung Nein Nein Ja
Vermeidet Stoppcodons Nein Ja Ja

 

Sehr homogene Variant Libraries

SSVL ermöglichen die effiziente Probennahme des Sequenzabschnitts eines Proteins in Screening-Assays.

Diese Abbildung zeigt die beobachtete Verteilung der Aminosäuren über 65 Positionen im Protein (19 beabsichtigte Varianten pro Position), wenn sie mit Twist SSVL im Vergleich zu einem fehleranfälligen PCR erstellt wurden. Die Balken stellen verschiedene Aminosäure-Positionen dar, wobei jede Farbe die beobachtete Variantenfrequenz indiziert. Alle Varianten stehen in den erwarteten Verhältnissen in der Twist-Library zur Verfügung.

SSVL-Verteilung

 

Bestellung

Wir freuen uns darauf, Ihnen bei der Bestellung Ihrer SSVL zu helfen. Bitte klicken Sie auf die Schaltfläche „Angebot anfordern“ oben. Von dort werden Sie aufgefordert, ein kurzes Formular auszufüllen. Kurz darauf wird jemand mit Ihnen Kontakt aufnehmen, um Ihre Bestellung abzuschließen.

Wenn Sie bereits ein Konto mit Twist haben, können Sie sich dort anmelden und Ihre Bestelldetails online ausfüllen.
 

Wir freuen uns darauf, Ihnen bei der Bestellung Ihrer SSVL zu helfen. Bitte klicken Sie auf die Schaltfläche „Angebot anfordern“ oben. Von dort werden Sie aufgefordert, ein kurzes Formular auszufüllen. Kurz darauf wird jemand mit Ihnen Kontakt aufnehmen, um Ihre Bestellung abzuschließen.

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