Übersicht über die RNA-Seq Libraryvorbereitung
Die Twist RNA-Libraryvorbereitung bietet einen Workflow, der so optimiert wurde, dass eine Probe in nur 5 Stunden zur fertigen Library führt (links). Die gesamten Transkriptom-Librarys können für eine umfassende Analyse direkt sequenziert werden. Sie können auch als Input für den Twist RNA Target Enrichment Workflow mit unseren Target Enrichment Panels für RNA Exom, RNA Fusion oder kundenspezifischen RNA Enrichment Panels verwendet werden, die die NGS-Abdeckung auf kodierende Regionen fokussieren und so Genexpressionsanalysen, Fusionsdetektion und die Identifizierung von kodierenden Varianten mit einem einzigen Assay ermöglichen (rechts).
RNA-Seq Libraryvorbereitungs-Workflow
Ausgehend von der Gesamt-RNA als Input von 1 ng bis zu 1 ug kann der Workflow mit oder ohne das optionale Modul zur Abreicherung von ribosomaler RNA und Globin zur Entfernung unerwünschter RNA-Spezies durchgeführt werden. Die RNA wird fragmentiert und dann revers in cDNA transkribiert, gefolgt von einer einstufigen 2-Strang-Synthese und A-Tailing, was Zeit und Verfahrensschritte spart. Schließlich werden die Librarys durch Ligierung von hochwertigen Twist UMIs oder Universaladaptern (UDIs) und anschließende Amplifikation erstellt.
Dieses Produktblatt hebt die Fähigkeiten des Twist RNA-Exoms hervor und liefert wichtige Informationen, um bei der Genomsequenzierung hervorragende Ergebnisse zu erzielen.
In diesem Protokoll werden die Schritte zur Erstellung von Sequenzierungs-Libraries für das Target Enrichment beschrieben, einschließlich der Umwandlung von RNA und der Vorbereitung von cDNA-Libraries mit Twist UMIs.
In diesem Protokoll werden die Schritte zur Erstellung von Sequenzierungs-Libraries für das Target Enrichment beschrieben, einschließlich der Umwandlung von RNA und der Vorbereitung von cDNA-Libraries mit Twist UDIs.
Übersicht über die RNA-Seq Libraryvorbereitung
Die Twist RNA-Libraryvorbereitung bietet einen Workflow, der so optimiert wurde, dass eine Probe in nur 5 Stunden zur fertigen Library führt (links). Die gesamten Transkriptom-Librarys können für eine umfassende Analyse direkt sequenziert werden. Sie können auch als Input für den Twist RNA Target Enrichment Workflow mit unseren Target Enrichment Panels für RNA Exom, RNA Fusion oder kundenspezifischen RNA Enrichment Panels verwendet werden, die die NGS-Abdeckung auf kodierende Regionen fokussieren und so Genexpressionsanalysen, Fusionsdetektion und die Identifizierung von kodierenden Varianten mit einem einzigen Assay ermöglichen (rechts).
RNA-Seq Libraryvorbereitungs-Workflow
Ausgehend von der Gesamt-RNA als Input von 1 ng bis zu 1 ug kann der Workflow mit oder ohne das optionale Modul zur Abreicherung von ribosomaler RNA und Globin zur Entfernung unerwünschter RNA-Spezies durchgeführt werden. Die RNA wird fragmentiert und dann revers in cDNA transkribiert, gefolgt von einer einstufigen 2-Strang-Synthese und A-Tailing, was Zeit und Verfahrensschritte spart. Schließlich werden die Librarys durch Ligierung von hochwertigen Twist UMIs oder Universaladaptern (UDIs) und anschließende Amplifikation erstellt.
Dieses Produktblatt hebt die Fähigkeiten des Twist RNA-Exoms hervor und liefert wichtige Informationen, um bei der Genomsequenzierung hervorragende Ergebnisse zu erzielen.
In diesem Protokoll werden die Schritte zur Erstellung von Sequenzierungs-Libraries für das Target Enrichment beschrieben, einschließlich der Umwandlung von RNA und der Vorbereitung von cDNA-Libraries mit Twist UMIs.
In diesem Protokoll werden die Schritte zur Erstellung von Sequenzierungs-Libraries für das Target Enrichment beschrieben, einschließlich der Umwandlung von RNA und der Vorbereitung von cDNA-Libraries mit Twist UDIs.
RNA-Exom
Das Twist RNA-Exom bietet zusammen mit Twist RNA Library Prep und Twist Target Enrichment ein zuverlässiges Werkzeug zur Generierung von Transkriptom-Sequenzierungsdaten aus RNA, die aus verschiedenen Quellen, einschließlich FFPE, extrahiert wurde. RNA Exom erhöht das Signal und erfordert gleichzeitig weniger Sequenzierungs-Reads für die gleiche Anzahl nachgewiesener Gene. Dies ermöglicht den Nachweis schwach exprimierender Ziele, die für ein genaues Bild des Transkriptionszustands der biologischen Probe entscheidend sind. Darüber hinaus lässt der Exon-bewusste Designansatz des RNA-Exoms die Möglichkeit offen, Isoformen und Verbindungen nachzuweisen, die sonst bei typischen Designansätzen verloren gehen könnten. Diese vollständige Sequenzierungslösung kann hochkomplexe und einheitliche Sequenzierungs-Reads für die RNA-Sequenzierungsanalyse der proteinkodierenden Sequenzen des menschlichen Transkriptoms erzeugen.
Mehr Targets, weniger Reads
Twist RNA-Exom erkennt mehr Ziele mit weniger Reads über eine Reihe von RNA-Inputs mit FFPE und universeller menschlicher Referenz-RNA. Alle Libraries wurden mithilfe von Twist RNA Library Prep vorbereitet.
Dieses Poster beleuchtet die wichtigsten Fortschritte bei der RNA-Exom-Sequenzierung, die detaillierte Methoden und bahnbrechende Forschungsergebnisse bietet.
In diesem Anwendungshinweis erfahren Sie mehr über einen gezielten RNA-Sequenzierungs-Workflow, der die Ergebnisse der Genomforschung optimiert.
Dieses Produktblatt hebt die Fähigkeiten des Twist RNA-Exoms hervor und liefert wichtige Informationen, um bei der Genomsequenzierung hervorragende Ergebnisse zu erzielen.
RNA-Exom
Das Twist RNA-Exom bietet zusammen mit Twist RNA Library Prep und Twist Target Enrichment ein zuverlässiges Werkzeug zur Generierung von Transkriptom-Sequenzierungsdaten aus RNA, die aus verschiedenen Quellen, einschließlich FFPE, extrahiert wurde. RNA Exom erhöht das Signal und erfordert gleichzeitig weniger Sequenzierungs-Reads für die gleiche Anzahl nachgewiesener Gene. Dies ermöglicht den Nachweis schwach exprimierender Ziele, die für ein genaues Bild des Transkriptionszustands der biologischen Probe entscheidend sind. Darüber hinaus lässt der Exon-bewusste Designansatz des RNA-Exoms die Möglichkeit offen, Isoformen und Verbindungen nachzuweisen, die sonst bei typischen Designansätzen verloren gehen könnten. Diese vollständige Sequenzierungslösung kann hochkomplexe und einheitliche Sequenzierungs-Reads für die RNA-Sequenzierungsanalyse der proteinkodierenden Sequenzen des menschlichen Transkriptoms erzeugen.
Mehr Targets, weniger Reads
Twist RNA-Exom erkennt mehr Ziele mit weniger Reads über eine Reihe von RNA-Inputs mit FFPE und universeller menschlicher Referenz-RNA. Alle Libraries wurden mithilfe von Twist RNA Library Prep vorbereitet.
Dieses Poster beleuchtet die wichtigsten Fortschritte bei der RNA-Exom-Sequenzierung, die detaillierte Methoden und bahnbrechende Forschungsergebnisse bietet.
In diesem Anwendungshinweis erfahren Sie mehr über einen gezielten RNA-Sequenzierungs-Workflow, der die Ergebnisse der Genomforschung optimiert.
Dieses Produktblatt hebt die Fähigkeiten des Twist RNA-Exoms hervor und liefert wichtige Informationen, um bei der Genomsequenzierung hervorragende Ergebnisse zu erzielen.
RNA-Fusion
Genfusionen wirken häufig als onkogene Treibermutationen bei einer Vielzahl von Krebsarten. Ihre schnelle und genaue Erkennung kann klinische Maßnahmen beeinflussen und Behandlungsentscheidungen vorantreiben. Das Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel Kit ist ein RNA-basiertes Anreicherungspanel und bietet eine verbesserte zielgerichtete und empfindliche Methode zur Untersuchung von Genfusionen als herkömmliche Methoden.
Dieses Panel umfasst 160 Fusionsgene, die mit etwa 30 Krebsarten assoziiert sind. Die Fusionsgene wurden von CeGaT, einem führenden Unternehmen für genetische Diagnostik und Sequenzierung mit Sitz in Europa, ausgewählt. Das Design dient nicht nur dem Nachweis bekannter Genfusionen, sondern wird auch zur Identifizierung neuer Genfusionen verwendet.
Das Panel ist für die Verwendung mit dem Twist RNA Library Prep Kit optimiert und validiert, um einen kompletten End-to-End-Workflow mit außergewöhnlicher Leistung zu gewährleisten. Eine hohe Capture-Effizienz mit der RNA-basierten Anreicherung erhöht die Nachweisempfindlichkeit. Dieses Panel ist ideal für das Screening onkologischer Proben geeignet, um Behandlungsoptionen zu inspirieren oder neue Fusionen für die Tumorklassifizierung nachzuweisen.*
Panel-Design
- 160 fusionsassoziierte Gene mit 66 Genen im Breakpoint-Design
- 7394 Sonden
- Deckt eine Vielzahl unterschiedlicher Krebsarten ab
* Hinweis: Das Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB ist ISO-13485-zertifiziert.
Profitieren Sie von einem präzisen und effizienten RNA-Fusionsnachweis mit dem Twist und CeGaT RNA Fusion Panel, das für modernste Krebsforschung entwickelt wurde.
Verbessern Sie Ihre Forschung mit dem Twist CeGaT RNA Fusion Panel, das präzise RNA-Fusionsnachweise für fortschrittliche Krebsstudien liefert.
Sehen Sie sich an, wie ein RNA-basierter Workflow in Verbindung mit der molekularen Analyse von Tumorproben ein tieferes Verständnis der Tumorbiologie ermöglichen kann.
Meinungen der Wissenschaftler
RNA-Fusion
„Wir bei CeGaT möchten unseren Kunden eine umfassende und kostengünstige Tumordiagnostik bieten. Die Twist Target Enrichment-Technologie ist ein robuster Workflow, der es uns ermöglicht, Patientenproben mit mehr als 80 therapeutisch verwertbaren Fusionsvarianten in einem Hochdurchsatz-Labor-Workflow genau zu analysieren. Wir können Allel-Dropout-Probleme im Zusammenhang mit Amplikon-basierten Workflows vermeiden. Basierend auf unserer eigenen Validierung ermöglicht uns das Panel die klinische Berichterstattung und die Unterstützung von Behandlungsentscheidungen.**
Dr. Florian Battke, Director of Development, CeGaT GmbH
**Haftungsausschluss: Die Ergebnisse sind spezifisch für die Institution, an der sie erzielt wurden, und spiegeln möglicherweise nicht die Ergebnisse wider, die an anderen Institutionen erzielt werden können.
RNA-Fusion
Genfusionen wirken häufig als onkogene Treibermutationen bei einer Vielzahl von Krebsarten. Ihre schnelle und genaue Erkennung kann klinische Maßnahmen beeinflussen und Behandlungsentscheidungen vorantreiben. Das Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel Kit ist ein RNA-basiertes Anreicherungspanel und bietet eine verbesserte zielgerichtete und empfindliche Methode zur Untersuchung von Genfusionen als herkömmliche Methoden.
Dieses Panel umfasst 160 Fusionsgene, die mit etwa 30 Krebsarten assoziiert sind. Die Fusionsgene wurden von CeGaT, einem führenden Unternehmen für genetische Diagnostik und Sequenzierung mit Sitz in Europa, ausgewählt. Das Design dient nicht nur dem Nachweis bekannter Genfusionen, sondern wird auch zur Identifizierung neuer Genfusionen verwendet.
Das Panel ist für die Verwendung mit dem Twist RNA Library Prep Kit optimiert und validiert, um einen kompletten End-to-End-Workflow mit außergewöhnlicher Leistung zu gewährleisten. Eine hohe Capture-Effizienz mit der RNA-basierten Anreicherung erhöht die Nachweisempfindlichkeit. Dieses Panel ist ideal für das Screening onkologischer Proben geeignet, um Behandlungsoptionen zu inspirieren oder neue Fusionen für die Tumorklassifizierung nachzuweisen.*
Panel-Design
- 160 fusionsassoziierte Gene mit 66 Genen im Breakpoint-Design
- 7394 Sonden
- Deckt eine Vielzahl unterschiedlicher Krebsarten ab
* Hinweis: Das Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB ist ISO-13485-zertifiziert.
Meinungen der Wissenschaftler
RNA-Fusion
„Wir bei CeGaT möchten unseren Kunden eine umfassende und kostengünstige Tumordiagnostik bieten. Die Twist Target Enrichment-Technologie ist ein robuster Workflow, der es uns ermöglicht, Patientenproben mit mehr als 80 therapeutisch verwertbaren Fusionsvarianten in einem Hochdurchsatz-Labor-Workflow genau zu analysieren. Wir können Allel-Dropout-Probleme im Zusammenhang mit Amplikon-basierten Workflows vermeiden. Basierend auf unserer eigenen Validierung ermöglicht uns das Panel die klinische Berichterstattung und die Unterstützung von Behandlungsentscheidungen.**
Dr. Florian Battke, Director of Development, CeGaT GmbH
**Haftungsausschluss: Die Ergebnisse sind spezifisch für die Institution, an der sie erzielt wurden, und spiegeln möglicherweise nicht die Ergebnisse wider, die an anderen Institutionen erzielt werden können.
Profitieren Sie von einem präzisen und effizienten RNA-Fusionsnachweis mit dem Twist und CeGaT RNA Fusion Panel, das für modernste Krebsforschung entwickelt wurde.
Verbessern Sie Ihre Forschung mit dem Twist CeGaT RNA Fusion Panel, das präzise RNA-Fusionsnachweise für fortschrittliche Krebsstudien liefert.
Sehen Sie sich an, wie ein RNA-basierter Workflow in Verbindung mit der molekularen Analyse von Tumorproben ein tieferes Verständnis der Tumorbiologie ermöglichen kann.
Blog
Poster
Poster
Ein RNA-Exom-Panel zur Anreicherung von Transkriptvarianten unter Verwendung von cDNA-Libraries
Produktblatt
Anwendungshinweis
Anwendungshinweis
Evaluierung eines gezielten RNA-Sequenzierungs-Workflows zum Varianten-Calling aus FFPE-Proben bei NSCLC
Technischer Hinweis
Technischer Hinweis
Effizientes, Exon-bewusstes RNA-Capture für Genexpression und neuartige Fusionen
Datendateien
Sicherheitsdatenblatt
Protokoll
Protokoll
Twist rRNA und Globindepletion und RNA-Libraryvorbereitung mit dem UMI-Adapter System
Protokoll
Twist rRNA und Globindepletion und RNA-Libraryvorbereitung mit dem Universal-Adapter-System
Poster
Ein RNA-Exom-Panel zur Anreicherung von Transkriptvarianten unter Verwendung von cDNA-Libraries
Anwendungshinweis
Evaluierung eines gezielten RNA-Sequenzierungs-Workflows zum Varianten-Calling aus FFPE-Proben bei NSCLC
Technischer Hinweis
Effizientes, Exon-bewusstes RNA-Capture für Genexpression und neuartige Fusionen
Protokoll
Twist rRNA und Globindepletion und RNA-Libraryvorbereitung mit dem UMI-Adapter System
Protokoll
Twist rRNA und Globindepletion und RNA-Libraryvorbereitung mit dem Universal-Adapter-System
