Twist cfDNA Pan-Cancer
Reference Standards

Umfassender Tumorvarianten-Referenzstandard für Flüssigbiopsie-gestützte Untersuchungen

NGS-basierte Flüssigbiopsien finden rasant zunehmenden Einsatz in der Forschung, erfordern jedoch genaue und präzise Referenzstandards. Mit dem Twist Pan-Cancer Reference Standard erhalten Sie eine standardisierte Kontrolle von hoher Qualität, die sich sowohl zu Forschungszwecken eignet als auch zur Entwicklung von NGS-Assays auf Flüssigbiopsie-Basis. Außer zur Bestimmung der analytischen Nachweisgrenze (LoD) einzelner Tumorvarianten kann dieser Referenzstandard auch dazu verwendet werden, die Workflow-Qualität von NGS-Assays zu überprüfen sowie die Güte von Assayprozessen in Forschung und Entwicklung zu beurteilen.

Herkömmliche Referenzstandards sind nur auf eine begrenzte Variantenanzahl und -variation ausgelegt und verwenden üblicherweise aus Zelllinien stammende DNA, die jedoch unerwünschte Sequenzvarianten und unterschiedliche Fragmentlängen aufweisen kann. Der Twist cfDNA Pan-Cancer Reference Standard verfügt hingegen über zahlreiche und vielseitige Varianten für den Einsatz in der Forschung. Bei der Herstellung dieses Referenzstandards kommt eine genaue DNA-Varianten-Synthese mit präziser Kontrolle der spezifischen Varianten-Allel-Frequenzen (VAFs) zur Anwendung, bei der Größenverteilung und Fragmentierungsprofil zellfreier sowie zirkulierender Tumor-DNA möglichst genau nachgebildet werden. Hierdurch lassen sich leistungsstärkere Assays entwickeln.

Dieser Referenzstandard enthält synthetisch entwickelte Variantensequenzen, die zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA) nachempfunden sind. Hinzu kommt Hintergrund-DNA, die aus humaner zellfreier DNA (cfDNA) stammt und dieser ebenfalls möglichst genau nachempfunden ist. Die ctDNA-Sequenzen liegen als ~167 kartierte bp-Sequenzen vor, die natürlicher ctDNA möglichst genau nachempfunden sind. Sie umfassen 458 Einzelmutationen mit 132 klinisch verwendbaren Varianten und decken dabei 84 krebsassoziierte Gene ab.