You can find the pricing table for Gene Fragment products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under Account.

Sie können die folgenden Methoden verwenden, um Genfragmente mithilfe von Adaptern zu klonieren:

Restriction digestion/Ligation - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning

Type IIS or Golden Gate - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning TOPO cloning (blunt-end) - the adapter sequences will be cloned in as well

Gateway cloning - add attB sites to the ends of your sequence

For more information, click here.  

Bei Adapter-On Gene Fragments werden universelle Adapter an den Enden jedes Fragments synthetisiert. Die Adapter weisen eine Länge von 21 bis 22 Nukleotiden auf. Fragmente mit diesen Adaptern sind mit einer Reihe von Assemblierungsmethoden kompatibel: Restriction Digestion/Ligation, Gateway, Golden Gate und TOPO-Klonierung.

Das Hinzufügen von Restriktionsstellen innerhalb der Adapter kann verwendet werden, um Adapter zu entfernen. Die TOPO-Klonierung ist erfolgreich, jedoch bleiben alle Adapter aktiviert. 
ADAPTERSEQUENZEN

• Bestellungen, die vor dem 9. August 2021 eingehen, haben die folgenden Adaptersequenzen:
  • 5'-Adapter: GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
  • 3’-Adapter: AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
  • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

• Bestellungen, die nach dem 9. August 2021 bis zum 1. November 2021 eingehen, haben die folgenden Adaptersequenzen:
  • 5'-Adapter: CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
  • 3’-Adapter: AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
  • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

• Bestellungen, die nach dem 2. November 2021eingehen, haben die folgenden Adaptersequenzen:
  • 5'-Adapter: CAATCCGCCCTCACTACAACCG
  • 3’-Adapter: CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
  • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

*Adapter sind kurze Sequenzen, die jedem Ende des Fragments als Teil unseres Syntheseprozesses hinzugefügt werden. Genfragmente ohne diese Adapter können während des Bestellvorgangs hinzugefügt werden. 

Wenn Sie Fragen zu Ihrer Bestellung haben, kontaktieren Sie uns bitte unter customersupport@twistbioscience.com

Ja, Genfragmente werden Bead-basiert aufgereinigt. Kurze Fragmente können jedoch in geringen Mengen übertragen werden.

• Bestellungen, die vor dem 9. August 2021 eingehen, haben die folgenden Adaptersequenzen:
  • 5'-Adapter: GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
  • 3’-Adapter: AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
  • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

• Bestellungen, die nach dem 9. August 2021 bis zum 1. November 2021 eingehen, haben die folgenden Adaptersequenzen:
  • 5'-Adapter: CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
  • 3’-Adapter: AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
  • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

• Bestellungen, die nach dem 2. November 2021eingehen, haben die folgenden Adaptersequenzen:
  • 5'-Adapter: CAATCCGCCCTCACTACAACCG
  • 3’-Adapter: CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
  • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

*Adapter sind kurze Sequenzen, die jedem Ende des Fragments als Teil unseres Syntheseprozesses hinzugefügt werden. Genfragmente ohne diese Adapter können während des Bestellvorgangs hinzugefügt werden.

If you have any questions about your order, please contact us at customersupport@twistbioscience.com

Die folgende Liste enthält die Organismen, die für die Codonoptimierung auf unserer Website unterstützt werden:

• Arabidopsis thaliana
• Aspergillus niger
• Aspergillus oryzae
• Bacillus subtilis
• Brassica napus
• Caenorhabditis elegans
• Cricetulus griseus (CHO)
• Drosophila melanogaster
• Escherichia coli
• Glycine max
• Homo sapiens
• Hypocrea jecorina
• Medicago sativa
• Mus musculus
• Nicotiana tabacum
• Petunia x hybrida
• Pichia pastoris
• Pisum sativum
• Rattus norvegicus
• Saccharomyces cerevisiae
• Solanum tuberosum
• Spodoptera frugiperda
• Streptomyces coelicolor A3(2)
• Sus scrofa
• Toxoplasma gondii
• Xenopus laevis
• Yarrowia lipolytica
• Zea mays

If you do not see your specific organism, contact customersupport@twistbioscience.com

Derzeit sind wir nicht in der Lage, Gene zu synthetisieren, die als nicht möglich eingestuft werden. Es gibt mehrere Faktoren, die dazu führen, dass unser Algorithmus ein Gen als nicht möglich einstuft, und die spezifischen Parameter sind für die Gensequenz eindeutig. Unser Algorithmus ist proprietär und wurde mithilfe von maschinellem Lernen entwickelt. Zusätzlich zum maschinellen Lernen berücksichtigt unser Algorithmus die folgenden Faktoren:

• %GC zwischen 25 und 65 %
• maximale Homopolymerlänge < 10
• geringe Homologie

Eine einzigartige Kombination der oben genannten Faktoren reflektiert den spezifischen Gensequenz-Score „Nicht möglich“.

Zur Bewahrung der Wildtyp-Proteinexpression:

• Wir vermeiden die Verwendung seltener Codons (solche mit einer Codonhäufigkeit von < 8 %).
• Wir stellen sicher, dass Sequenzen in den ersten 48 Basenpaaren der resultierenden Sequenzen keine starken Sekundärstrukturen (∆G <-8) aufweisen.
• Wir überprüfen beide Stränge, um sicherzustellen, dass sie nicht die Enzymschnittstellen enthalten, die wir vermeiden sollen.
• Wir vermeiden die Einführung von Promotorsequenzen innerhalb der Expressionssequenz, indem wir die Bildung starker Sigma70-Bindungsstellen vermeiden.
• Wir vermeiden Sequenzen, die starke Ribosomenbindungsstellen erzeugen (GGAGG und TAAGGAG).
• Wir vermeiden Sequenzen, die Terminatorsequenzen (TTTTT oder AAAAA) erzeugen.

So erhöhen wir die Wahrscheinlichkeit einer erfolgreichen Herstellung:

• Wir führen keine Wiederholung ein, die länger als 20 Basenpaare ist.
• Wir vermeiden Homopolymer-Durchläufe mit 10 oder mehr Basen.
• Wir vermeiden angepasste Sequenzen, die einen globalen GC-Gehalt von weniger als 25 % oder mehr als 65 % und lokale GC-Fenster (50 bp) von weniger als 35 % oder mehr als 65 % erzeugen.

Bitte beachten Sie, dass die Codonoptimierung nützlich ist, um die Chancen auf eine erfolgreiche Synthese zu verbessern, nicht die Proteinexpression.  

Syntheseprobleme werden hauptsächlich durch sich wiederholende Strukturen, extremen GC-Gehalt und Homopolymere verursacht. Wir verwenden maschinelle Lernverfahren, um die Erfolgschance zu bestimmen. Daher gibt es meistens nicht nur einen Grund für die Ablehnung einer Sequenz. Vielmehr sind Komplexität oder Ablehnung auf eine Kombination von Merkmalen zurückzuführen, die eine Sequenz zu einem bestimmten Komplexitätsniveau bringen. Die einzigen harten Regeln sind die folgenden:

• Vermeidung von Homopolymeren >= 14 bp

• Ausschluss von CcdB (Typ-II-Toxin-Antitoxin-System)

Wenn Sie auf ein Problem stoßen, empfehlen wir, Wiederholungen, Regionen mit extremem GC-Gehalt und Homopolymeren zu entfernen oder zu minimieren. Wir werden problematische Regionen hervorheben, wenn Ihre Sequenz komplex, unverbindlich ist oder Sequenzen enthält, die mit unseren internen Prozessen in Konflikt stehen.

Nachdem Sie Ihre Gensequenzen auf unserer Website eingereicht haben, wird automatisch bewertet, ob sie zusammengesetzt werden können:

Standard: No errors have been found. Die Gensequenz weist eine „standardmäßige“ Gesamtkomplexität auf (z. B. Länge, GC-Gehalt, Homologie usw.). 

Complex: No errors have been found. Einige komplexe Sequenzen (z. B. Länge, GC-Gehalt, Homologie usw.) sind vorhanden, aber wir erwarten keine Probleme bei der Synthese Ihres Gens. In seltenen Fällen kann es bei Sequenzen zu einer erhöhten Bearbeitungszeit oder dem Risiko eines Herstellungsfehlers kommen.

Error: Gene sequence contains errors. Bitte klicken Sie auf die Sequenz, um weitere Details zur Lösung zu erhalten.

Not Accepted: The sequence contains elements that make it impossible for us to synthesize. Bitte beachten Sie die detaillierten Erläuterungen zu den Fehlermeldungen oder den „Designleitfaden“.

Über das Scoring-System

Unser Scoring-System verwendet ein maschinelles Lernmodell, das mehrere Sequenzparameter analysiert und kombiniert (z. B. Gesamt-GC-Prozent, maximale Homopolymerlänge, maximale Wiederholungslänge, Sequenzlänge, Wiederholungsdichte usw.). Dieses Modell wurde mithilfe unserer historischen Herstellungsdaten trainiert und liefert eine genauere Abschätzung des Produktionserfolgs von Genen und Antikörperprodukten.

Über FEHLER-Meldungen

Warnings: Are associated with the risk of failure, predicted by the machine learning model. Eine höhere Anzahl von Warnhinweisen führt mit größerer Wahrscheinlichkeit zu einem „Nicht akzeptiert“-Score.

Errors: Are not associated with gene complexity, and they can be fixed by correcting the gene design

Unsere Website akzeptiert Aminosäuresequenzen und wandelt sie zur Synthese in eine DNA-Sequenz um. Wählen Sie auf der Seite „Sequenzen hochladen“ die Option „Aminosäuresequenz“.


 Stellen Sie sicher, dass Ihre Eingabe nur aus einem Buchstaben bestehende Zeichen für Aminosäuren enthält. Unser System unterstützt nur die standardmäßigen 20 Codezeichen, die jeweils einen Buchstaben enthalten.

Das sternchen (*) am ende ihrer aminosäuresequenzen markiert ein stoppcodon (wir fügen stoppcodons nicht automatisch hinzu).

Basierend auf Ihrer ausgewählten Codonverwendungstabelle werden die am häufigsten verwendeten Codons ausgewählt.            

Wenn Sie Ihren spezifischen Organismus nicht sehen, bitten Sie customersupport@twistbioscience.com um Hilfe.

Hinweis zu klonalen Genen: Nicht alle Expressionsvektoren von Twist enthalten vor der Insertionsstelle einen Standard-Expressionsmechanismus. We recommend double-checking the sequence of your final plasmid construct by clicking "Download Sequences"after selecting your desired vector. 

Kunden haben die Möglichkeit, Oligo-Pools, Genfragmente und klonale Gene zu bestellen.

Oligonukleotide (lineare einzelsträngige DNAs) in einem Oligo-Pool können eine Größe von 20 bp bis 300 bp aufweisen.

Genfragmente sind lineare doppelsträngige DNAs mit einer Größe zwischen 300 bp und 5.000 bp.

Klonale Gene sind doppelsträngige DNAs, die in einen der Vektoren von Twist oder einen vom Kunden bereitgestellten benutzerdefinierten Vektor kloniert wurden. Klonale Gene können eine Länge von 300 bp bis 5.000 bp aufweisen.