¿Cuál es la definición de una región de baja complejidad para el enriquecimiento del objetivo?

Actualmente, estamos utilizando un modelo patentado para predecir si una sonda será o no difícil de detectar mediante la secuenciación de Illumina. Las entradas de este modelo incluyen contenido de GC, complejidad global (medida como el número de kmers distintos contenidos en una secuencia de sonda), complejidad local (medida como el número de kmers distintos dentro de una región limitada de una secuencia) y presencia de homopolímeros.

Generalmente, las sondas con contenido de GC > 85 %, homopolímeros de más de 20 nucleótidos o repeticiones en tándem de di o trinucleótidos de más de 30 nucleótidos serán difíciles de secuenciar.


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¿Twist fabrica sondas de ARN?

No fabricamos sondas de ARN. Sin embargo, nuestras sondas de ADN se pueden utilizar para enriquecer objetivos de bibliotecas de ADNc elaboradas a partir de ARN.


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¿Tengo la opción de crear otras longitudes de sonda para un panel de enriquecimiento del objetivo?

Sí, aunque le recomendamos consultar a su jefe de cuentas de Twist para obtener más información. Podemos diseñar paneles con longitudes de sonda de 80 pb, 100 pb y 120 pb. 


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¿Qué tamaño de panel puede hacer Twist?

No hay limitaciones de tamaño en los diseños de paneles personalizados.


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¿Puede Twist diseñar un panel de enriquecimiento personalizado para especies que no sean humanas?

Sí, póngase en contacto con customersupport@twistbioscience o con su administrador de cuentas para obtener más información.  


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¿Las sondas Twist son ARN o ADN?

Las sondas de Twist para el enriquecimiento del objetivo son ADN bicatenario que se dirigen a ambas hebras para mejorar la sensibilidad. También se pueden usar para enriquecer objetivos a partir de bibliotecas de ADNc obtenidas a partir de ARN.


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¿Cuál es la definición de una región de baja complejidad para el enriquecimiento del objetivo?

Actualmente, estamos utilizando un modelo patentado para predecir si una sonda será o no difícil de detectar mediante la secuenciación de Illumina. Las entradas de este modelo incluyen contenido de GC, complejidad global (medida como el número de kmers distintos contenidos en una secuencia de sonda), complejidad local (medida como el número de kmers distintos dentro de una región limitada de una secuencia) y presencia de homopolímeros.

Generalmente, las sondas con contenido de GC > 85 %, homopolímeros de más de 20 nucleótidos o repeticiones en tándem de di o trinucleótidos de más de 30 nucleótidos serán difíciles de secuenciar.


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¿Twist fabrica sondas de ARN?

No fabricamos sondas de ARN. Sin embargo, nuestras sondas de ADN se pueden utilizar para enriquecer objetivos de bibliotecas de ADNc elaboradas a partir de ARN.


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¿Tengo la opción de crear otras longitudes de sonda para un panel de enriquecimiento del objetivo?

Sí, aunque le recomendamos consultar a su jefe de cuentas de Twist para obtener más información. Podemos diseñar paneles con longitudes de sonda de 80 pb, 100 pb y 120 pb. 


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¿Qué tamaño de panel puede hacer Twist?

No hay limitaciones de tamaño en los diseños de paneles personalizados.


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¿Puede Twist diseñar un panel de enriquecimiento personalizado para especies que no sean humanas?

Sí, póngase en contacto con customersupport@twistbioscience o con su administrador de cuentas para obtener más información.  


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¿Las sondas Twist son ARN o ADN?

Las sondas de Twist para el enriquecimiento del objetivo son ADN bicatenario que se dirigen a ambas hebras para mejorar la sensibilidad. También se pueden usar para enriquecer objetivos a partir de bibliotecas de ADNc obtenidas a partir de ARN.


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