Soluciones de flujo de trabajo de secuenciación de ARN Twist

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PREP. DE BIBLIOTECAS DE ARN
EXOMA DE ARN
FUSIÓN DE ARN
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Descripción general de la preparación de bibliotecas de secuenciación de ARN

Twist RNA library preparation offers workflow which was optimized to take a sample through to completed library in as little as 5 hours (left). Las bibliotecas de transcriptoma completo se pueden secuenciar directamente para un análisis completo. También se pueden utilizar como entrada en el flujo de trabajo de enriquecimiento del objetivo de ARN Twist con nuestros paneles de enriquecimiento del objetivo para el exoma de ARN, fusión de ARN o paneles de enriquecimiento del ARN diseñados por el cliente que se centran en la cobertura de la secuenciación de última generación (NGS) en las regiones de codificación, lo que permite el análisis de la expresión genética, la detección de fusiones y la identificación de variantes de codificación a partir de un solo ensayo (derecha).

Flujo de trabajo de preparación de bibliotecas de secuenciación de ARN

Starting with total RNA as input from 1 ng up to 1 ug of input can be introduced into the workflow with or without the optional ribosomal RNA and Globin depletion module to remove unwanted RNA species. El ARN se fragmenta y, a continuación, se transcribe a la inversa en ADNc seguido por la síntesis de una segunda cadena en un solo paso y la adición de colas de nucleótidos A que ahorra tiempo y pasos del procedimiento. Por último, las bibliotecas se crean ligando UMI o adaptadores universales (UDI) de alta calidad Twist y se realiza la amplificación.

Hoja de productos de LP de ARN

Esta hoja de producto resume las capacidades del exoma de ARN de Twist, con información esencial para obtener mejores resultados en la secuenciación genómica.

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LP de ARN con protocolo UMI

This protocol details the steps to build sequencing libraries for target enrichment including converting RNA and preparing cDNA libraries with Twist UMIs.

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LP de ARN con protocolo UDI

Protocol for RNA library preparation using universal adapter system.

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Exoma de ARN

El exoma de ARN Twist, junto con la preparación de bibliotecas de ARN Twist y el enriquecimiento del objetivo Twist, proporciona una herramienta fiable para generar datos de secuenciación del transcriptoma a partir de ARN extraído de diversas fuentes, como muestras FFPE. El exoma de ARN aumenta la señal al tiempo que requiere menos lecturas de secuenciación para el mismo número de genes detectados. Esto permite la detección de objetivos de baja expresión que son fundamentales para obtener una imagen precisa del estado de transcripción de la muestra biológica. Además, el enfoque de diseño que tiene en cuenta los exones del exoma de ARN deja abierta la posibilidad de detectar isoformas y uniones que, de otro modo, podrían perderse con los enfoques de diseño típicos. Esta solución completa de secuenciación puede producir lecturas de secuenciación altamente complejas y uniformes para el análisis de secuenciación de ARN de las secuencias de codificación de proteínas del transcriptoma humano.

Diseñado para el transcriptoma humano

Se dirige a bases de 35,8 Mb, 19 708 genes y 63 215 isoformas
Construido con secuencias de Gencode y RefSeq
Enriquecimiento superior a 1,8 veces con respecto al transcriptoma completo

Enriquecimiento del objetivo construido para ARN

Diseño de sondas que tiene en cuenta los exones para regiones codificantes de proteínas, fusiones e isoformas
Menos lecturas por muestra para más muestras
Compatible con FFPE y bajos niveles de ARN

Más objetivos, menos lecturas

El exoma de ARN Twist detecta más objetivos con menos lecturas en un rango de entradas de ARN con ARN de referencia humano universal y FFPE. All libraries were prepared with the Twist RNA Library Prep

Hoja de productos de LP de ARN

Esta hoja de producto resume las capacidades del exoma de ARN de Twist, con información esencial para obtener mejores resultados en la secuenciación genómica.

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LP de ARN con protocolo UMI

This protocol details the steps to build sequencing libraries for target enrichment including converting RNA and preparing cDNA libraries with Twist UMIs.

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LP de ARN con protocolo UDI

Protocol for RNA library preparation using universal adapter system.

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Fusión de ARN

Las fusiones de genes suelen actuar como mutaciones impulsoras oncogénicas en una amplia variedad de tipos de cáncer. Su detección rápida y precisa puede servir de base para las acciones clínicas y orientar las decisiones de tratamiento. El kit del panel de fusión de ARN Twist Alliance CeGaT es un panel de enriquecimiento basado en ARN que mejora el enfoque dirigido y sensible para la investigación de fusiones de genes en comparación con los métodos convencionales.

Este panel incluye 160 genes de fusión asociados con aproximadamente 30 tipos de cáncer. The fusion genes were selected by CeGaT, a leading genetic diagnostic and sequencing company located in Europe. El diseño no es solo para la detección de fusiones de genes conocidas, sino que también se utiliza para identificar nuevas fusiones de genes.

El panel está optimizado y validado para su uso con el kit de preparación de bibliotecas de ARN Twist para un flujo de trabajo completo de extremo a extremo de rendimiento excepcional. La alta eficiencia de captura con el enriquecimiento basado en ARN aumenta la sensibilidad de la detección. Este panel es ideal para el cribado de muestras oncológicas con el fin de informar sobre las opciones de tratamiento o descubrir nuevas fusiones para la clasificación de tumores.*

Enriquezca con confianza las fusiones de genes de ARN

Diseño de contenido experto gracias a la colaboración con CeGaT
Flujo de trabajo optimizado con el kit de preparación de bibliotecas de ARN Twist
La tecnología de enriquecimiento de núcleo Twist maximiza la eficiencia de captura

Diseño del panel

160 fusion associated genes with 66 genes in the breakpoint design
7394 Probes
Cubre una variedad de diferentes tipos de cáncer

* Nota: The Twist Alliance CeGaT RNA Fusion Panel – 3 MB is ISO-13485 certified.

Hoja de productos de LP de ARN

Esta hoja de producto resume las capacidades del exoma de ARN de Twist, con información esencial para obtener mejores resultados en la secuenciación genómica.

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LP de ARN con protocolo UMI

This protocol details the steps to build sequencing libraries for target enrichment including converting RNA and preparing cDNA libraries with Twist UMIs.

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