Elimine sesgos y motivos no deseados
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INFORMACIÓN GENERAL DATOS PEDIDOS RECURSOS
Descripción general

La tecnología de biblioteca de variantes de precisión permite un cribado enfocado

La plataforma de síntesis de ADN basada en silicio masivamente paralela de Twist produce oligonucleótidos altamente uniformes y precisos, con el 90 % de los oligonucleótidos representados dentro de <2,5x de la media, junto con una tasa de error baja líder del sector de 1:2000 nt.

Combinado con nuestra experiencia en biología molecular bien asentada, la plataforma de síntesis de oligonucleótidos Twist permite la fabricación de bibliotecas de genes mutantes muy diversas con una excelente representación de variantes y una composición definida por el usuario altamente específica sin sesgos ni motivos no deseados. La tecnología de bibliotecas Twist permite una interrogación completa del espacio de la secuencia de la variante.

Precisión de alta diversidad
Precisión de alta diversidad
Incorpore sin esfuerzo múltiples dominios variantes en una o varias estructuras
Control preciso del uso de codones (los 64 codones), la distribución de los aminoácidos y la variación de las longitudes
Calidad verificada
Calidad verificada
Control de calidad riguroso, lo que incluye la verificación por secuenciación de última generación (NGS) de las regiones modificadas
Relaciones de variantes de secuencias documentadas
Distribución uniforme de variantes definidas por el usuario
Sin codones de detención prematuros ni codones no deseados
Flexibilidad
Flexibilidad
Diseñe todas las secuencias, dominios únicos o múltiples, y combinaciones: variantes únicas, pareadas o triples
Sistema de síntesis modular que permite la iteración de bibliotecas futuras
Mayor flexibilidad que la TRIM (mutagénesis de trinucleótidos) y el enfoque degenerado
La tecnología de biblioteca de variantes de precisión permite un cribado enfocado

Obtenga más información sobre la capacidad de Twist Bioscience para construir bibliotecas complejas de alta diversidad en regiones confinadas (por ejemplo, CDR) e introducir avances tecnológicos que permiten la construcción de bibliotecas de ADN sintético con diversidad dispersa a lo largo de las estructuras.

Ver el seminario web

La tecnología de biblioteca de variantes de precisión permite un cribado enfocado

La plataforma de síntesis de ADN basada en silicio masivamente paralela de Twist produce oligonucleótidos altamente uniformes y precisos, con el 90 % de los oligonucleótidos representados dentro de <2,5x de la media, junto con una tasa de error baja líder del sector de 1:2000 nt.

Combinado con nuestra experiencia en biología molecular bien asentada, la plataforma de síntesis de oligonucleótidos Twist permite la fabricación de bibliotecas de genes mutantes muy diversas con una excelente representación de variantes y una composición definida por el usuario altamente específica sin sesgos ni motivos no deseados. La tecnología de bibliotecas Twist permite una interrogación completa del espacio de la secuencia de la variante.

Precisión de alta diversidad
Precisión de alta diversidad
Incorpore sin esfuerzo múltiples dominios variantes en una o varias estructuras
Control preciso del uso de codones (los 64 codones), la distribución de los aminoácidos y la variación de las longitudes
Calidad verificada
Calidad verificada
Control de calidad riguroso, lo que incluye la verificación por secuenciación de última generación (NGS) de las regiones modificadas
Relaciones de variantes de secuencias documentadas
Distribución uniforme de variantes definidas por el usuario
Sin codones de detención prematuros ni codones no deseados
Flexibilidad
Flexibilidad
Diseñe todas las secuencias, dominios únicos o múltiples, y combinaciones: variantes únicas, pareadas o triples
Sistema de síntesis modular que permite la iteración de bibliotecas futuras
Mayor flexibilidad que la TRIM (mutagénesis de trinucleótidos) y el enfoque degenerado
La tecnología de biblioteca de variantes de precisión permite un cribado enfocado

Obtenga más información sobre la capacidad de Twist Bioscience para construir bibliotecas complejas de alta diversidad en regiones confinadas (por ejemplo, CDR) e introducir avances tecnológicos que permiten la construcción de bibliotecas de ADN sintético con diversidad dispersa a lo largo de las estructuras.

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DATOS
High Quality Data

Twist Bioscience’s silicon-based DNA synthesis platform and library technology provides scientists with high-quality libraries that produce reliable data in less time. When compared to two other competing technologies (figure 1), Twist’s library showed less than 1% deviation from the designed amino acid frequency.  In addition to precisely matching designed amino acid ratios, Twist’s in-silico DNA synthesis platform seamlessly incorporates desirable binding motifs and length variation across multi-domain libraries, giving scientists the power to precisely design and customize variant libraries that enable a comprehensive analysis of the variant space.

And with Twist libraries, the problems and challenges typical of NNK and TRIM libraries are avoided. Each variant is printed base-by-base and screened prior to synthesis, eliminating stop codons, liability motifs, unwanted mutations, and any undesirable biases, all at the beginning of the process. As a result, the library is enriched for the requested functional variants and the screening burden is reduced..

Our industry-leading, ready to use, highly-diverse and precisely designed libraries give scientists more opportunities to achieve their research goals.

Twist Technology Comparison NNK vs Trimer vs Twist
Superior Libraries

En Twist, utilizamos la experiencia en biología molecular para construir bibliotecas de variantes con precisión. Nuestro enfoque de control de base simple nos permite proporcionar bibliotecas de alta diversidad sin motivos que puedan confundir el proceso de cribado. Proporcionamos bibliotecas completamente personalizadas con una calidad inigualable con las variantes deseadas presentes en relaciones definidas por el usuario. Aquí puede ver un ejemplo de CVL representativo de dicha calidad. Se generaron variantes en siete posiciones de aminoácidos secuenciales y todas presentaron las variantes esperadas en las posiciones mostradas, casi todas en la relación deseada:

En las posiciones 1 y 6, se solicitó el aminoácido de tipo salvaje al 40 % (posición 1) y al 30 % (posición 7). Se solicitó que los 18 aminoácidos restantes fueran de tan solo 3,3 %.

Se solicitaron los residuos de aminoácidos en la posición 3-5 y se observaron al 5,3 %.

Distribución de la biblioteca de variantes combinatorias (CVL)
Bibliotecas de CDR definidas por el usuario

Nuestras bibliotecas de variantes precisas le permiten seleccionar qué secuencias de CDR (regiones de definición complementarias) exclusivas desea incorporar en la selección de estructuras.

Pueden optimizarse los codones de todas las CDR para evitar la creación de sitios de restricción no deseados. El aprendizaje automático se ha convertido en una parte integral de la investigación científica y se ha utilizado como una herramienta para analizar las bibliotecas de anticuerpos e identificar combinaciones de CDR exclusivas que podrían proporcionar, por ejemplo, una mayor afinidad y especificidad. 

Combinadas con la plataforma de síntesis basada en el silicio de Twist, las combinaciones explícitas de bibliotecas generadas a partir del análisis pueden sintetizarse e incorporarse sin problemas en una biblioteca completamente sintética para refinar la exploración del espacio de las variantes.

Bibliotecas de CDR definidas por el usuario

 

Control de calidad de bibliotecas con la secuenciación de última generación (NGS)

Todas las bibliotecas se verifican con la secuenciación de última generación (NGS), de modo que pueden utilizarse los datos negativos para identificar las mutaciones que no proporcionan funciones mejoradas y las que pueden eliminarse en la siguiente iteración del diseño de la biblioteca.

La tabla muestra la frecuencia de aminoácidos (%) en siete sitios de una región mutagenizada sintetizada. Se generaron variantes en siete posiciones de aminoácidos secuenciales con 19 residuos de aminoácidos (se omitió la cisteína) en los primeros siete sitios. Datos de frecuencia tabulados obtenidos mediante la secuenciación de última generación (NGS), con sombra verde que indica la desviación con respecto al valor esperado. Se encontraron todas las variantes esperadas en todas las posiciones y su frecuencia observada estuvo dentro del 25 % del valor esperado (especificación) al 5,3 %.

Distribución de la biblioteca de variantes combinatorias (CVL)
High Quality Data

Twist Bioscience’s silicon-based DNA synthesis platform and library technology provides scientists with high-quality libraries that produce reliable data in less time. When compared to two other competing technologies (figure 1), Twist’s library showed less than 1% deviation from the designed amino acid frequency.  In addition to precisely matching designed amino acid ratios, Twist’s in-silico DNA synthesis platform seamlessly incorporates desirable binding motifs and length variation across multi-domain libraries, giving scientists the power to precisely design and customize variant libraries that enable a comprehensive analysis of the variant space.

And with Twist libraries, the problems and challenges typical of NNK and TRIM libraries are avoided. Each variant is printed base-by-base and screened prior to synthesis, eliminating stop codons, liability motifs, unwanted mutations, and any undesirable biases, all at the beginning of the process. As a result, the library is enriched for the requested functional variants and the screening burden is reduced..

Our industry-leading, ready to use, highly-diverse and precisely designed libraries give scientists more opportunities to achieve their research goals.

Twist Technology Comparison NNK vs Trimer vs Twist
Superior Libraries

En Twist, utilizamos la experiencia en biología molecular para construir bibliotecas de variantes con precisión. Nuestro enfoque de control de base simple nos permite proporcionar bibliotecas de alta diversidad sin motivos que puedan confundir el proceso de cribado. Proporcionamos bibliotecas completamente personalizadas con una calidad inigualable con las variantes deseadas presentes en relaciones definidas por el usuario. Aquí puede ver un ejemplo de CVL representativo de dicha calidad. Se generaron variantes en siete posiciones de aminoácidos secuenciales y todas presentaron las variantes esperadas en las posiciones mostradas, casi todas en la relación deseada:

En las posiciones 1 y 6, se solicitó el aminoácido de tipo salvaje al 40 % (posición 1) y al 30 % (posición 7). Se solicitó que los 18 aminoácidos restantes fueran de tan solo 3,3 %.

Se solicitaron los residuos de aminoácidos en la posición 3-5 y se observaron al 5,3 %.

Distribución de la biblioteca de variantes combinatorias (CVL)
Bibliotecas de CDR definidas por el usuario

Nuestras bibliotecas de variantes precisas le permiten seleccionar qué secuencias de CDR (regiones de definición complementarias) exclusivas desea incorporar en la selección de estructuras.

Pueden optimizarse los codones de todas las CDR para evitar la creación de sitios de restricción no deseados. El aprendizaje automático se ha convertido en una parte integral de la investigación científica y se ha utilizado como una herramienta para analizar las bibliotecas de anticuerpos e identificar combinaciones de CDR exclusivas que podrían proporcionar, por ejemplo, una mayor afinidad y especificidad. 

Combinadas con la plataforma de síntesis basada en el silicio de Twist, las combinaciones explícitas de bibliotecas generadas a partir del análisis pueden sintetizarse e incorporarse sin problemas en una biblioteca completamente sintética para refinar la exploración del espacio de las variantes.

Bibliotecas de CDR definidas por el usuario

 

Control de calidad de bibliotecas con la secuenciación de última generación (NGS)

Todas las bibliotecas se verifican con la secuenciación de última generación (NGS), de modo que pueden utilizarse los datos negativos para identificar las mutaciones que no proporcionan funciones mejoradas y las que pueden eliminarse en la siguiente iteración del diseño de la biblioteca.

La tabla muestra la frecuencia de aminoácidos (%) en siete sitios de una región mutagenizada sintetizada. Se generaron variantes en siete posiciones de aminoácidos secuenciales con 19 residuos de aminoácidos (se omitió la cisteína) en los primeros siete sitios. Datos de frecuencia tabulados obtenidos mediante la secuenciación de última generación (NGS), con sombra verde que indica la desviación con respecto al valor esperado. Se encontraron todas las variantes esperadas en todas las posiciones y su frecuencia observada estuvo dentro del 25 % del valor esperado (especificación) al 5,3 %.

Distribución de la biblioteca de variantes combinatorias (CVL)
Pedidos

Queremos ayudarle a realizar su pedido de bibliotecas de variantes de saturación de sitio. Haga clic en el botón “Get quote” (Obtener presupuesto) anterior, lo que le dirigirá a un breve formulario que deberá cumplimentar y nos pondremos en contacto con usted cuanto antes para ayudarle a realizar el pedido. 

Si ya tiene una cuenta en Twist, puede iniciar sesión y empezar a cumplimentar los datos del pedido en línea.
 

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