El sistema de detección de metilación por NGS Twist proporciona una solución integral y sólida de preparación de muestras para la identificación de regiones metiladas en el genoma humano. El flujo de trabajo utiliza un proceso enzimático único de New England Biolabs®, que es mucho menos lesivo para el ADN, junto con el diseño del panel de metilación personalizado de Twist.

 

Con independencia de que esté investigando la diferenciación celular o el cribado de biopsias líquidas para el cáncer, el sistema ofrece la detección de metilación más eficiente disponible.

BENEFICIOS CLAVE

Una solución integral

  • Conversión enzimática innovadora de citosinas no metiladas
  • Captura uniforme con sondas Twist personalizadas de alto rendimiento
  • Mejora de las tasas en el objetivo con reactivos optimizados

Preparación de bibliotecas innovadora

  • Mejores resultados para bibliotecas más complejas y mejores equilibrios de GC
  • Detecta un 15 % más de CpG que la conversión con bisulfito
  • Un mejor daño de las muestras permite la entrada de muestras complejas
  • Adición sencilla del flujo de trabajo a las vías de secuenciación por metilación

Reactivos de hibridación optimizados

  • Ajuste la temporización de la hibridación sin sacrificar el rendimiento
  • Tasas en el objetivo mejoradas con el potenciador de metilación
  • Hibridación en menos de 4 horas

Paneles personalizados muy eficientes*

  • El diseño sofisticado, la síntesis precisa y el control de calidad detallado maximizan la uniformidad de la captura y la reproducibilidad
  • Detección y antidetección de la captura, ADN metilado y no metilado simultáneamente
  • Rendimiento excepcional en todos los tamaños de panel, regiones objetivo y requisitos de multiplexación
  • Añada o mejore fácilmente el contenido del panel

* Vendido por separado

Desbloqueo de la complejidad de la metilación

Escuche al jefe de producto de Twist y a un científico de la aplicación NEB proporcionar una descripción general del flujo de trabajo NEB–Twist. Descubra las ventajas de la conversión enzimática, las ventajas del enfoque de diseño de la sonda de conversión precaptura Twist y la aplicabilidad del flujo de trabajo a tipos de muestras clínicamente pertinentes.

Herramientas para mejorar la eficiencia de la secuenciación por metilación para una mejor resolución de los estudios epigenéticos

Profundice más en el nuevo flujo de trabajo de secuenciación por metilación de Twist Bioscience creado en colaboración con New England Biolabs. Descubra cómo aumenta la confianza en las activaciones de bases metiladas.

Kit NEBNext® EM-seq™ para la secuenciación por metilación dirigida Twist

 

En asociación con New England Biolabs (NEB), Twist Bioscience ofrece un nuevo flujo de trabajo de secuenciación por metilación que mejora la calidad de las bibliotecas y elimina la necesidad del dañino tratamiento con bisulfito durante la preparación. 
 
El flujo de trabajo incluye la conversión enzimática de citosinas no metiladas (consulte la figura) para identificar sitios de metilcitosina (5mC) e hidroximetil-citosina (5hmC). 
 
La conversión enzimática produce bibliotecas más intactas con mejor representación y, en última instancia, consigue una detección de la metilación más sensible. El sistema de preparación de bibliotecas es apto para una secuenciación del genoma completo y el enriquecimiento posterior con paneles de metilación Twist. 

 

La conversión EM-seq conlleva una serie de pasos enzimáticos para convertir citosinas no metiladas en uracilos. El resultado final es el mismo que la conversión con bisulfito convencional, lo que hace que EM-seq sea compatible con las vías de análisis existentes que utilizan Bismark y la metilación BWA. 

Paneles de metilación personalizados y sistema de hibridación rápida Twist

El kit de hibridación rápida y lavado Twist proporciona un rendimiento óptimo y una flexibilidad máxima. Los reactivos y pasos pueden optimizarse para ajustar las métricas de secuenciación posteriores y reducir el tiempo de trabajo manual y el uso de las pipetas. 

Diseñados con un algoritmo muy sofisticado, los paneles de metilación personalizados Twist capturan objetivos con una eficiencia excepcional en una amplia gama de tamaños de objetivo. Juntos, estos componentes garantizan la mejor captura híbrida de regiones de interés personalizadas.

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Potenciador de metilación Twist

Los flujos de trabajo de secuenciación por metilación dirigida suelen presentar capturas fuera del objetivo porque el proceso de conversión reduce la complejidad de la secuencia de la muestra durante la preparación de bibliotecas. 

Con el fin de maximizar la captura de muestras posconversión, el sistema de detección de metilación por NGS Twist incluye un bloqueador patentado diseñado específicamente para la detección de la metilación. Denominado “potenciador de metilación”, este reactivo reduce las capturas fuera del objetivo a la mitad.  

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Detección muy sensible de regiones metiladas de forma diferencial

Los niveles de metilación varían sustancialmente en el genoma humano y las regiones metiladas de forma diferencial (DMR) pueden utilizarse para identificar ciertos cánceres. 

Para comprobar los efectos de la metilación en el rendimiento del sistema de detección de metilación por NGS Twist, se generaron bibliotecas con distintos niveles de metilación (0-100 %) combinando ADN genómico hipo e hipermetilado en relaciones definidas. Este análisis demostró unos efectos mínimos en el nivel de metilación en las métricas de secuenciación finales.

El sistema de detección de metilación por NGS Twist también captura regiones hipo e hipermetiladas con una gran sensibilidad.

Sistema de detección de metilación por NGS

Preparación de bibliotecas mediante secuenciación por metilación enzimática NEBNext
Protocolo de secuenciación por metilación dirigida de Twist

Detección altamente sensible de metilación mediante el uso de la secuenciación por metilación enzimática y el enriquecimiento del objetivo de Twist
Minimizing Off-Target Capture in Targeted Methyl-Seq Through Panel Design
Optimización del rendimiento del flujo de trabajo de la secuenciación por metilación dirigida de Twist
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