Paneles de CRISPR unicelulares escalables y combinatorias mediante captura de ARN de guía directa y secuencia dirigida

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Presentado por
Joseph Replogle
Universidad de California, San Francisco

Cubierto en este seminario web
Descubra cómo Perturb-seq facilita una exploración no sesgada de la función genética
Comprenda cómo la selección de genes individuales con múltiples ARNsg por célula mejora la eficacia de CRISPR y CRISPRa
Vea cómo el enriquecimiento del objetivo basado en la hibridación puede reducir los costos de secuenciación hasta en un 90 %
Descubra la escalabilidad y exactitud de las soluciones de grupos de oligonucleótidos de CRISPR y de enriquecimiento del objetivo por NGS de Twist

El reciente advenimiento de herramientas genéticas, como Peturb-seq, que combinan el análisis de paneles de CRISPR agrupados con secuenciación de ARN monocelular, ha proporcionado conocimientos sin precedentes sobre la función de los genes de mamíferos y las redes de regulación genética. Sin embargo, las implementaciones actuales de estas herramientas se enfrentan a limitaciones técnicas y prácticas que restringen su uso.

Para superar estos desafíos, los investigadores de la Universidad de California (San Francisco), la Universidad de Princeton y 10x Genomics han desarrollado Peturb-seq de “captura directa”, que permite investigaciones de rendimiento sustancialmente más alto sobre las interacciones genéticas. Además, mediante la adición de una metodología de enriquecimiento del objetivo basada en la hibridación, ahora es posible la secuenciación sensible y específica de paneles de transcripciones biológicamente significativas, lo que reduce significativamente los costes experimentales.


En este seminario web:

  • Descubra cómo Perturb-seq, que combina paneles de CRISPR agrupados con secuenciación de ARN unicelular, facilita la exploración imparcial de la función genética y la delineación de las redes reguladoras genéticas.
  • Escuche sobre la reciente innovación de Perturb-seq de captura directa, que aumenta significativamente el rendimiento del cribado, lo que amplía sustancialmente la escala y la flexibilidad de esta tecnología.
  • Comprenda cómo el direccionamiento a genes individuales con múltiples ARNgu por célula mejora la eficacia de la activación y la interferencia de CRISPR, lo que facilita el uso de bibliotecas CRISPR compactas y altamente activas para detecciones unicelulares.
  • Vea cómo el enriquecimiento del objetivo basado en la hibridación puede reducir los costos de secuenciación de las transcripciones de interés hasta en un 90 %.
  • Descubra cómo la escalabilidad y exactitud de las soluciones de grupos de oligonucleótidos de CRISPR y de enriquecimiento del objetivo por NGS de Twist permitieron el desarrollo y la aplicación de esta tecnología innovadora.
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