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Variant Library-Präzisionstechnologie ermöglicht zielgerichtete Analysen
Die massiv parallele siliziumbasierte DNA-Syntheseplattform von Twist erzeugt äußerst einheitliche und genaue Oligonukleotide, wobei 90 % der Oligonukleotide innerhalb des <2,5-Fachen des Mittelwerts liegen, zusammen mit einer branchenführenden niedrigen Fehlerrate von 1:2.000 nt.
In Kombination mit unserer umfassenden Erfahrung in der Molekularbiologie ermöglicht die Oligonukleotid-Syntheseplattform von Twist die Herstellung sehr unterschiedlicher Genmutanten-Libraries mit ausgezeichneter Variantenrepräsentation und hochspezifischer benutzerdefinierter Zusammensetzung, und zwar ohne unerwünschte Verzerrungen oder Motive. Die Twist-Library-Technologie ermöglicht eine umfassende Interrogation des Varianten-Sequenzabschnitts.
HAUPTVORTEILE
Hochdiversitätspräzision
- Einfache Integration verschiedener Variantendomänen in eines oder mehrere Scaffolds
- Präzise Kontrolle der Codonverwendung (alle 64 Codone), Verteilung der Aminosäuren und Längenvariation
Verifizierte Qualität
- Rigorose Qualitätskontrolle, einschließlich NGS-Verifizierung von modifizierten Bereichen
- Variantenverhältnis der Sequenzen dokumentiert
- Gleichmäßige Verteilung der benutzerdefinierten Varianten
- Keine vorzeitigen Stoppcodons oder unerwünschten Codons
Flexibilität
- Design aller Sequenzen, einzelne oder multiple Domänen und Kombinationen – einzelne, paarweise oder dreifache Varianten
- Modulares Synthesesystem befähigt die Iteration von zukünftigen Libraries
- Höhere Flexibilität als TRIM und der Degenerationsansatz
Variant Library-Präzisionstechnologie ermöglicht zielgerichtete Analysen
Erfahren Sie mehr über die Fähigkeit von Twist, komplexe Libraries mit hoher Diversität in begrenzten Regionen (z. B. CDRs) zu konstruieren, und stellen technologische Fortschritte vor, die den Aufbau synthetischer DNA-Libraries mit über die Länge der Konstrukte verstreuter Diversität ermöglichen.
Wussten Sie, dass die Ionenladung die Antikörper-Target-Bindung beeinflussen kann?
Learn how Twist helped a leading pharmaceutical company precisely interrogate key residues involved in both target recognition and antibody charge by synthesizing combinatorial variant libraries.
Einführung in das neue Library-Design-Tool von Twist
Optimiertes Library-Design im Handumdrehen
Hochwertige Daten
Die siliziumbasierte DNA-Syntheseplattform und Library-Technologie von Twist Bioscience bietet Wissenschaftlern qualitativ hochwertige Libraries, die in kürzerer Zeit zuverlässige Daten liefern. Im Vergleich zu zwei anderen konkurrierenden Technologien (Abbildung 1) zeigte die Twist-Library weniger als 1 % Abweichung von der vorgesehenen Aminosäurefrequenz. Zusätzlich zum präzisen Abgleich der vorgesehenen Aminosäureverhältnisse integriert die In-silico-DNA-Syntheseplattform von Twist nahtlos erwünschte Bindungsmotive und Längenvariationen in Multi-Domain-Libraries, was Wissenschaftlern die Möglichkeit gibt, in präziser Weise Variant Libraries zu entwerfen und anzupassen, die eine umfassende Analyse des Variantenraums ermöglichen.
Außerdem werden mit Twist-Libraries die für NNK- und TRIM-Libraries typischen Probleme und Schwierigkeiten vermieden. Jede Variante wird Base für Base gedruckt und vor der Synthese überprüft, um Stoppcodons, Haftungsmotive, unerwünschte Mutationen und unerwünschte Verzerrungen bereits zu Beginn des Prozesses zu eliminieren. Dadurch wird die Library mit den gewünschten funktionalen Varianten angereichert und der Aufwand für das Screening verringert.
Unsere branchenführenden, sofort einsatzbereiten, hochdiversen und präzise konzipierten Libraries bieten Wissenschaftlern mehr Möglichkeiten, ihre Forschungsziele zu erreichen.
Überlegene Libraries
Twist nutzt die eigene Erfahrung mit Molekularbiologie zur präzisen Konstruktion der Variant Libraries. Unser Ansatz der Einzelbasis-Kontrolle ermöglicht es uns, hochdiverse Libraries ohne Motive zu liefern, die Ihre Screening-Prozesse verwirren könnten. Wir liefern vollständig angepasste Libraries von einmaliger Qualität, in denen die gewünschten Varianten zu von den Nutzern definierten Verhältnissen vorhanden sind. Hier sehen Sie ein CVL-Beispiel, welches diese Qualität repräsentiert. Es wurden Varianten in sieben aufeinanderfolgenden Aminosäurepositionen erzeugt, und alle haben die erwarteten Varianten an den gezeigten Positionen, wobei fast alle das gewünschte Verhältnis aufweisen:
An den Positionen 1 und 6 sollte die Wildtyp-Aminosäure bei 40 % (Position 1) und 30 % (Position 7) liegen. Für die übrigen 18 Aminosäuren wurde ein Anteil von 3,3 % gefordert.
An den Positionen 3 bis 5 sollten die Aminosäurenreste bei 5,3 % liegen, was dann auch beobachtet wurde.
Benutzerdefinierte CDR-Libraries
Unsere Precise Variant Libraries ermöglichen es Ihnen zu wählen, welche einzigartigen CDR (Complimentary Defining Regions - komplementäre definierende Regionen)-Sequenzen in die Wahl Ihres Frameworks integriert werden sollen.
Bei jeder CDR kann eine Codonoptimierung angewendet werden, um die Schaffung von ungewünschten Restriktionsstellen zu vermeiden. Das maschinelle Lernen ist zu einem festen Bestandteil der wissenschaftlichen Forschung geworden und wurde als Instrument zur Analyse von Antikörper-Libraries und zur Identifizierung einzigartiger CDR-Kombinationen eingesetzt, die beispielsweise eine höhere Affinität und Spezifität ergeben würden.
Zusammen mit der silikonbasierten Syntheseplattform von Twist können aus der Analyse generierte explizite Library-Kombinationen synthetisiert und nahtlos in eine komplett synthetische Library eingefügt werden, um die Erforschung des Variantenraums weiterzuentwickeln.
Klonoption für Librarys
Unsere Plattform ermöglicht die einheitliche Synthese von hochkomplexen Oligonukleotiden, wodurch mögliche Verzerrungen im nachgeschalteten Arbeitsablauf minimiert werden. Unser Wissenschaftlerteam hat eine Strategie entwickelt, um diese Einheitlichkeit während der gesamten Library-Herstellung und des Klonens aufrechtzuerhalten. Dies sind Schritte im Arbeitsablauf, die nachweislich zu Verzerrungen führen, die dazu führen können, dass einige Varianten in den Screens/Assays unverhältnismäßig häufig auftauchen. Durch die Beibehaltung der Einheitlichkeit der Ausgangssubstanz und die Minimierung von Ausfällen und unterrepräsentierten Varianten sind unsere geklonten Librarys in der Lage, ein hohes Maß an Diversität aufrechtzuerhalten, was dazu beiträgt, Zeit und Aufwand für das Screening zu reduzieren.
Die Abbildung zeigt die beobachtete Aminosäureverteilung an jeder Variantenposition nach der Herstellung (linear) und nach dem Klonen im Vergleich zur gewünschten Häufigkeit (erwartet).
Qualitätskontrolle der Libraries mit NGS
Da alle Librarys mit NGS verifiziert werden, können negative Daten verwendet werden, um Mutationen zu identifizieren, die keine verbesserten Funktionen ergeben, und diese können in der nächsten Iteration des Library-Designs entfernt werden.
Die Tabelle zeigt die Aminosäurehäufigkeit (%) an vier Stellen einer mutagenen Domäne nach dem linearen Aufbau der Library und nach dem Klonen. Die erwarteten Spalten für jede Position zeigen die gewünschte Häufigkeit jeder Aminosäuresubstitution. Diese Daten zeigen, dass alle erwarteten Varianten an allen Positionen vorhanden waren und die Einheitlichkeit während der gesamten Assemblierung und Klonierung beibehalten wurde.
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Eine neue Art, Ihre Librarys zu gestalten
Das neue Library Design Tool ist Ihre Komplettlösung, mit der Sie den Design- und Bestellprozess von DNA-Librarys rationalisieren, optimieren und beschleunigen können.
Design-Partner
- Intuitives, interaktives Portal zum einfachen Hochladen Ihrer Library-Sequenzdatei
- Identifizieren Sie potenzielle Fehler in der Sequenz mit sofortiger Rückmeldung und ermöglichen Sie eine sofortige Validierung der Library.
- Entwürfe für spätere Verwendung speichern
Optimierung in Echtzeit
- Fehler werden zur Überprüfung markiert, sodass Sie Probleme schnell und ohne Verzögerungen beheben können.
- Unsere Experten für die Gestaltung von Librarys stehen auch in dieser Phase bereit, um Ihnen bei Fragen zu helfen.
- Mit unserem intuitiven Tool und fachkundiger Unterstützung können wir Ihnen helfen, den schnellsten Weg zu einer validierten, hochwertigen Library zu finden.
Schnellerer Prozess
- Die interaktive Schnittstelle für das Library-Design in Echtzeit unterstützt Sie bei der Optimierung Ihres Library-Designs und der Kosteneffizienz.
- Entwürfe für spätere Verwendung speichern
- Erzeugt automatisch eine Leistungsbeschreibung für Ihren Auftrag und beschleunigt so den gesamten Bestellvorgang.
Experten-Support nur einen Klick entfernt
If you have any questions,please feel free to email us at library@twistbioscience.com
Werfen Sie einen Blick auf unser Library Design Tool
Eine neue Art bei Twist, Ihre Librarys zu gestalten
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Legen wir los
The New Library Design Tool is your all in one solution to streamline, optimize, and expedite the DNA Library design and ordering process.
Schritt 1
Melden Sie sich bei Ihrem Konto an. Wenn Sie noch kein Konto haben, dauert es nur ein paar Minuten, eines einzurichten!
Schritt 2
Beginnen Sie mit der Gestaltung Ihrer Library im neuen interaktiven Library Design Tool, das einen Schritt-für-Schritt-Assistenten zur Verfügung stellt. Mit dieser Option können Sie Ihre Library in Echtzeit optimieren, indem Sie die Preise in Echtzeit validieren und am Ende des Einreichungsprozesses eine Übersicht über Ihre Leistungsbeschreibung erhalten.
Schritt 3
Sobald der Kunde das Angebot akzeptiert hat, sendet das Librarys-Team das Projekt an das Produktionsteam.
Hinweis:
Das Library Design Tool ist derzeit in der Region APAC nicht verfügbar. Please check with your local support team on availability date.
Twist Bioscience HQ
681 Gateway Blvd
South San Francisco, CA 94080, USA
