Was ist die Definition einer Region mit geringer Komplexität für das Target Enrichment?

Wir verwenden derzeit ein proprietäres Modell, um vorherzusagen, ob eine Sonde mithilfe der Illumina-Sequenzierung schwer zu erkennen ist oder nicht. Die Eingaben in dieses Modell umfassen den GC-Gehalt, die globale Komplexität (gemessen als Anzahl unterschiedlicher k-Mere in einer Sondensequenz), die lokale Komplexität (gemessen als Anzahl unterschiedlicher k-Mere innerhalb eines begrenzten Bereichs einer Sequenz) und das Vorhandensein von Homopolymeren.

Im Allgemeinen ist es schwierig, Sonden mit einem GC-Gehalt von > 85 %, Homopolymeren mit einer Länge von mehr als 20 nt oder Tandem Repeats von Di- oder Trinukleotiden mit einer Länge von mehr als 30 nt zu sequenzieren.


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Stellt Twist RNA-Sonden her?

Wir stellen keine RNA-Sonden her. Unsere DNA-Sonden können jedoch verwendet werden, um Ziele aus cDNA-Libraries anzureichern, die aus RNA bestehen.


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Gibt es die Möglichkeit, andere Sondenlängen für ein Target-Enrichment-Panel zu erstellen?

Ja, es wird allerdings empfohlen, dass Sie sich an Ihren lokalen Twist Kundenbetreuer wenden, um weitere Informationen zu erhalten. Wir können Panels mit Sondenlängen von 80 bp, 100 bp und 120 bp entwerfen. 


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Was ist die maximale Panelgröße, die Twist erstellen kann?

Es gibt keine Größenbeschränkungen für kundenspezifische Panel-Designs.


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Kann Twist ein benutzerdefiniertes Anreicherungspanel für andere Arten als Menschen entwickeln?

Ja, bitte wenden Sie sich an customersupport@twistbioscience oder Ihren Kundenbetreuer, um weitere Informationen anzufordern.  


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Handelt es sich bei Twist Sonden um RNA oder DNA?

Die Twist Sonden zum Target Enrichment sind doppelsträngige DNA. Die Sonden zielen auf beide Stränge ab, um die Sensitivität zu verbessern. Sie können auch zur Zielanreicherung der aus RNA hergestellten cDNA-Libraries verwendet werden.


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Was ist die Definition einer Region mit geringer Komplexität für das Target Enrichment?

Wir verwenden derzeit ein proprietäres Modell, um vorherzusagen, ob eine Sonde mithilfe der Illumina-Sequenzierung schwer zu erkennen ist oder nicht. Die Eingaben in dieses Modell umfassen den GC-Gehalt, die globale Komplexität (gemessen als Anzahl unterschiedlicher k-Mere in einer Sondensequenz), die lokale Komplexität (gemessen als Anzahl unterschiedlicher k-Mere innerhalb eines begrenzten Bereichs einer Sequenz) und das Vorhandensein von Homopolymeren.

Im Allgemeinen ist es schwierig, Sonden mit einem GC-Gehalt von > 85 %, Homopolymeren mit einer Länge von mehr als 20 nt oder Tandem Repeats von Di- oder Trinukleotiden mit einer Länge von mehr als 30 nt zu sequenzieren.


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Wir stellen keine RNA-Sonden her. Unsere DNA-Sonden können jedoch verwendet werden, um Ziele aus cDNA-Libraries anzureichern, die aus RNA bestehen.


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Ja, es wird allerdings empfohlen, dass Sie sich an Ihren lokalen Twist Kundenbetreuer wenden, um weitere Informationen zu erhalten. Wir können Panels mit Sondenlängen von 80 bp, 100 bp und 120 bp entwerfen. 


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Was ist die maximale Panelgröße, die Twist erstellen kann?

Es gibt keine Größenbeschränkungen für kundenspezifische Panel-Designs.


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Kann Twist ein benutzerdefiniertes Anreicherungspanel für andere Arten als Menschen entwickeln?

Ja, bitte wenden Sie sich an customersupport@twistbioscience oder Ihren Kundenbetreuer, um weitere Informationen anzufordern.  


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Handelt es sich bei Twist Sonden um RNA oder DNA?

Die Twist Sonden zum Target Enrichment sind doppelsträngige DNA. Die Sonden zielen auf beide Stränge ab, um die Sensitivität zu verbessern. Sie können auch zur Zielanreicherung der aus RNA hergestellten cDNA-Libraries verwendet werden.


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