L’avènement récent d’outils associés au travail génétique, tels que la méthode Peturb-seq, qui associent l’analyse de criblages CRISPR en pools au séquençage d’ARN unicellulaire a fourni des informations imcomparables sur la fonction génétique chez les mammifères et sur les réseaux de régulation génétique. La mise en œuvre de ces outils est cependant confrontée à des limitations techniques et pratiques qui en restreignent l’utilisation.

Pour surmonter ces difficultés, des chercheurs de l’Université de Californie à San Francisco et de l’Université de Princeton, en collaboration avec la société 10x Genomics, ont développé une technologie Peturb-seq à « capture directe » qui permet des investigations à débit nettement supérieur sur les interactions génétiques. En outre, grâce à l’ajout d’une méthodologie d’enrichissement ciblé basé sur hybridation, il est désormais possible d’obtenir un séquençage sensible et spécifique de panels de transcriptions biologiquement significatifs, ce qui réduit notablement le coût des expériences.

Dans ce webinaire, vous allez…

• Découvrez comment Perturb-seq, qui associe des criblages CRISPR en pools à un séquençage d’ARN unicellulaire facilite l’exploration sans biais de la fonction génétique et la délimitation des réseaux de régulation génique.
• Informez-vous sur l’innovation récente de la capture directe de la méthode Perturb-seq qui augmente notablement le débit du criblage et qui étend fortement l’échelle et la flexibilité de cette technologie.
• Découvrez comment le fait de cibler des gènes individuels à l’aide de plusieurs sgARN par cellule améliore l’efficacité de l’interférence et de l’activation CRISPR, ce qui facilite l’utilisation de banques de CRISPR compactes et hautement actives pour les criblages unicellulaires.
• Découvrez comment l’enrichissement ciblé basé sur hybridation peut permettre une réduction des coûts de séquençage des transcriptions d’intérêt pouvant atteindre 90 %.
• Découvrez l’aide apportée par l’évolutivité et l’exactitude des pool d’oligonucléotides CRISPR et des solutions d’enrichissement de cibles pour NGS de Twist au développement et à la mise en application de cette technologie révolutionnaire.